中文摘要 | 第1-10页 |
英文摘要 | 第10-12页 |
缩略词表 | 第12-13页 |
前言 | 第13-16页 |
第一部分 巴尔通体外膜蛋白双向电泳技术的建立 | 第16-33页 |
材料与方法 | 第17-21页 |
1. 材料 | 第17-18页 |
·仪器 | 第17页 |
·主要化学试剂与耗材 | 第17页 |
·实验菌株和培养条件 | 第17页 |
·溶液配制 | 第17-18页 |
2. 方法 | 第18-21页 |
·外膜蛋白的制备 | 第18-19页 |
·IPG-DALT双相电泳 | 第19-20页 |
·考马斯亮蓝染色 | 第20页 |
·图像扫描分析 | 第20-21页 |
结果 | 第21-31页 |
1. 不同方法2-DE图谱比较 | 第21页 |
2. 不同蛋白裂解液溶解样品的2-DE图谱比较 | 第21-22页 |
3. 2-DE图谱的重复性 | 第22页 |
4. 不同菌种的2-DE图谱比较 | 第22-31页 |
讨论 | 第31-33页 |
第二部分 汉赛巴尔通体外膜蛋白质组飞行时间质谱分析 | 第33-82页 |
材料与方法 | 第34-37页 |
1. 菌株培养、样品制备及2-DE | 第34页 |
2. 主要仪器 | 第34页 |
3. 国际互联网的生物信息学资源 | 第34页 |
4. 胶内酶解 | 第34页 |
5. MALDI-TOF-MS质谱鉴定 | 第34-35页 |
6. 数据库检索 | 第35页 |
7. 数据分析 | 第35-37页 |
·数据整理 | 第35页 |
·理论等电点、分子量和疏水性平均值预测 | 第35页 |
·亚细胞定位 | 第35-36页 |
·二级结构及功能位点预测 | 第36页 |
·三级结构预测及评估 | 第36-37页 |
结果 | 第37-75页 |
1. SLS法对汉赛巴尔通体外膜蛋白提取物飞行质谱鉴定分析 | 第37页 |
2. Na_2CO_3法对汉赛巴尔通体外膜蛋白提取物质飞行谱鉴定分析 | 第37-56页 |
3. SLS法与Na_2CO_3法制备的蛋白样品飞行质谱鉴定结果比较 | 第56页 |
4. 功能分类 | 第56页 |
5. 外膜蛋白特征分析 | 第56-71页 |
6. 基于全基因组的外膜蛋白预测及功能分析 | 第71-75页 |
讨论 | 第75-82页 |
1. 外膜蛋白质组分离及鉴定 | 第75-76页 |
2. 外膜蛋白及生物信息学分析 | 第76-82页 |
·关于本研究中鉴定的外膜蛋白 | 第76-78页 |
·关于预测的外膜蛋白 | 第78-82页 |
参考文献 | 第82-87页 |
综述 | 第87-99页 |
参考文献 | 第95-99页 |
附录一 在读期间发表的论著 | 第99-100页 |
附录二 生物信息学分析补充数据 | 第100-116页 |
致谢 | 第116页 |