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一种有效的SDA模体发现算法

摘要第1-4页
Abstract第4-7页
第一章 绪论第7-11页
   ·研究背景第7-8页
   ·DNA序列模体发现的研究历史与现状第8-10页
   ·本文的研究内容和组织结构第10-11页
第二章 DNA序列模体发现问题第11-19页
   ·模体发现问题的定义第11-12页
   ·模体发现问题的分类第12-14页
     ·PMP问题第12-13页
     ·EMP问题第13页
     ·TCM问题第13-14页
   ·DNA序列模体的表示第14-17页
     ·矩阵表示第14-15页
     ·串的表示第15-16页
     ·规则语法表示第16-17页
   ·不同模体的比较第17-19页
第三章 DNA序列模体发现算法第19-27页
   ·DNA序列模体发现算法的分类第19页
   ·基于PDA的搜索算法第19-21页
     ·Voting算法第20-21页
     ·ExVote算法第21页
     ·基于PDA的搜索算法的性能评价第21页
   ·基于SDA的搜索算法第21-27页
     ·Gibbs Sampling算法第22-23页
     ·MEME-EM算法第23-24页
     ·WINNOWER算法第24-25页
     ·MITRA算法第25页
     ·基于SDA的搜索算法的性能评价第25-27页
第四章 一种有效的SDA模体发现算法第27-43页
   ·问题描述第27-28页
   ·算法的基本思想第28-30页
     ·基本概念第29页
     ·基本思想第29-30页
   ·算法设计第30-35页
     ·转化序列为图第30-32页
     ·模体实例的发现第32-34页
     ·模体的表达第34-35页
   ·算法的复杂度分析第35-36页
     ·时间复杂度分析第35-36页
     ·空间复杂度分析第36页
   ·实验结果及分析第36-43页
     ·合成数据第36-38页
     ·真实数据第38-39页
     ·与其它算法的比较与分析第39-43页
第五章 总结与展望第43-45页
致谢第45-47页
参考文献第47-51页
研究成果第51页

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