| 致谢 | 第4-5页 |
| 摘要 | 第5-6页 |
| Abstract | 第6页 |
| 英文缩略词表(Abbreviation) | 第10-11页 |
| 文献综述 | 第11-21页 |
| 1 引言 | 第21-22页 |
| 2 材料与方法 | 第22-27页 |
| 2.1 试验牛 | 第22页 |
| 2.2 牛血液基因组DNA的提取 | 第22页 |
| 2.2.1 DNA的提取 | 第22页 |
| 2.2.2 DNA的检测 | 第22页 |
| 2.3 血液RNA提取 | 第22-23页 |
| 2.3.1 RNA提取 | 第22页 |
| 2.3.2 RNA检测 | 第22页 |
| 2.3.3 反转录 | 第22-23页 |
| 2.4 PCR扩增与多态性检测 | 第23页 |
| 2.4.1 引物设计 | 第23页 |
| 2.4.2 PCR反应 | 第23页 |
| 2.4.3 多态性检测 | 第23页 |
| 2.5 实时荧光定量PCR | 第23-24页 |
| 2.5.1 定量引物 | 第23页 |
| 2.5.2 RT-PCR反应 | 第23-24页 |
| 2.6 RNA-seq技术文库构建 | 第24-25页 |
| 2.7 RNA-seq信息分析 | 第25-27页 |
| 2.7.1 数据过滤 | 第25页 |
| 2.7.2 数据比对 | 第25-26页 |
| 2.7.3 基因定量 | 第26页 |
| 2.7.4 差异基因筛选：NOISeq方法 | 第26页 |
| 2.7.5 GO和Pathway分析 | 第26-27页 |
| 3 结果与分析 | 第27-36页 |
| 3.1 样品与目的基因验证结果 | 第27-29页 |
| 3.1.1 DNA提取检测结果分析 | 第27页 |
| 3.1.2 牛血液RNA检测 | 第27-28页 |
| 3.1.3 目的基因PCR扩增结果分析 | 第28页 |
| 3.1.4 目的片段的序列及启动子基因型 | 第28-29页 |
| 3.2 不同启动子型与牛GPR54基因表达水平的关联性 | 第29-30页 |
| 3.3 与初情期相关基因RNA-Seq检测分析 | 第30-36页 |
| 3.3.1 RNA-seq测序数据比对和质控 | 第30-31页 |
| 3.3.2 RNA-seq测序饱和度和随机性 | 第31-32页 |
| 3.3.3 RNA-seq测序基因定量分析 | 第32-33页 |
| 3.3.4 RNA-seq测序样品间的相关性 | 第33-34页 |
| 3.3.5 相关基因的差异表达 | 第34页 |
| 3.3.6 相关信号通路差异分析 | 第34-36页 |
| 4 讨论 | 第36-39页 |
| 4.1 试验牛 | 第36页 |
| 4.2 牛初情期启动与GPR54基因多态性关系 | 第36页 |
| 4.3 GPR54基因表达调控 | 第36-37页 |
| 4.4 与GPR54相关的基因表达差异 | 第37-39页 |
| 5 结论 | 第39-40页 |
| 参考文献 | 第40-47页 |
| 作者简介 | 第47页 |