| 摘要 | 第5-7页 |
| Abstrat | 第7-8页 |
| 第一章 绪论 | 第12-16页 |
| 1 植物的转录组测序技术 | 第12-13页 |
| 1.1 测序技术的平台 | 第12页 |
| 1.2 转录组的拼接 | 第12-13页 |
| 2 转录组数据基础上的SSR分子标记 | 第13-14页 |
| 3 兰属植物的转录组测序与分子标记的开发 | 第14-16页 |
| 第二章 建兰转录组的SSR信息分析 | 第16-27页 |
| 1 材料与方法 | 第16-18页 |
| 1.1 实验材料及提取RNA | 第16-17页 |
| 1.2 cDNA文库构建和Illumina测序 | 第17页 |
| 1.3 数据过滤和重头拼接 | 第17页 |
| 1.4 SSR的挖掘 | 第17页 |
| 1.5 SSR的序列注释 | 第17-18页 |
| 2 结果与分析 | 第18-26页 |
| 2.1 测序结果 | 第18-19页 |
| 2.2 鉴定Genic-SSR | 第19-21页 |
| 2.3 含有SSR序列的注释 | 第21-26页 |
| 3 讨论 | 第26-27页 |
| 第三章 利用建兰转录组数据开发Genic-SSR标记 | 第27-46页 |
| 1 材料与方法 | 第28-29页 |
| 1.1 实验材料和模板DNA的提取 | 第28页 |
| 1.2 铁骨素转录组SSR的搜索 | 第28页 |
| 1.3 设计引物 | 第28-29页 |
| 1.4 PCR扩增及电泳检测 | 第29页 |
| 1.5 标记分析及所在序列的功能注释 | 第29页 |
| 2 结果与分析 | 第29-44页 |
| 2.1 引物的设计与扩增 | 第29-30页 |
| 2.2 标记多样性检测 | 第30-40页 |
| 2.3 所在序列的功能注释 | 第40-44页 |
| 3 讨论 | 第44-46页 |
| 第四章 Genic-SSR在分析中国兰遗传和地理背景上的应用 | 第46-57页 |
| 1 材料和方法 | 第47-49页 |
| 1.1 植物材料 | 第47页 |
| 1.2 Genic-SSR和基因型鉴定 | 第47页 |
| 1.3 数据分析 | 第47-49页 |
| 2 结果与分析 | 第49-54页 |
| 2.1 品种遗传多样性 | 第49-50页 |
| 2.2 群体内多样性 | 第50-53页 |
| 2.3 群体间关系 | 第53-54页 |
| 2.4 地理分布与多样性 | 第54页 |
| 3 讨论 | 第54-57页 |
| 3.1 遗传多样性 | 第54-55页 |
| 3.2 中国兰遗传背景与地理分布 | 第55-57页 |
| 结论与展望 | 第57-58页 |
| 参考文献 | 第58-68页 |
| 附录 | 第68-69页 |
| 致谢 | 第69页 |