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Streptomyces thermolilacinus SPC6中环脂肽化合物Marihysin A的发现及其生物合成基因簇的研究

中文摘要第3-5页
Abstract第5-6页
缩略语表第7-11页
第一章 引言第11-20页
    1.1 天然产物的发展历程第11-13页
        1.1.1 放线菌来源的天然产物第11-13页
        1.1.2 天然产物的发现策略第13页
    1.2 聚酮和聚肽类天然产物第13-16页
        1.2.1 聚酮类天然产物第13-14页
        1.2.2 聚肽类天然产物第14-16页
        1.2.3 聚酮/聚肽杂合类天然产物第16页
    1.3 脂肽类天然产物第16-19页
        1.3.1 脂肽类天然产物的分类和生物学功能第16-17页
        1.3.2 环脂肽类天然产物的生物合成机制第17-19页
    1.4 本课题研究的目的和意义第19-20页
第二章 材料与方法第20-37页
    2.1 菌种与质粒第20页
    2.2 实验用引物第20-21页
    2.3 实验用仪器和部分试剂第21-23页
        2.3.1 实验用仪器第21-22页
        2.3.2 实验用生物试剂和主要化学试剂第22-23页
    2.4 培养基第23-24页
    2.5 溶液第24-26页
        2.5.1 DNA琼脂糖凝胶电泳用溶液第24-25页
        2.5.2 实验用抗生素溶液第25页
        2.5.3 其它溶液第25-26页
    2.6 菌种活化第26页
    2.7 链霉菌总基因组提取第26-27页
    2.8 PCR反应体系第27-28页
    2.9 DNA琼脂糖凝胶电泳第28页
    2.10 碱式裂解法提取大肠杆菌质粒第28-29页
    2.11 大肠杆菌感受态细胞的制备和转化第29-30页
        2.11.1 Inoue法感受态细胞的制备第29页
        2.11.2 电转化法感受态细胞的制备第29-30页
        2.11.3 大肠杆菌化学转化法第30页
        2.11.4 大肠杆菌电转化法第30页
    2.12 TA克隆蓝白斑筛选第30-31页
    2.13 片段和载体的双酶切以及连接重组第31-32页
    2.14 基因中断原理和基因中断重组质粒构建第32-33页
        2.14.1 基因中断原理第32页
        2.14.2 基因中断重组质粒的构建第32-33页
    2.15 链霉菌和大肠杆菌的属间接合转移第33-34页
    2.16 S.thermolilacinus SPC6野生型菌株和中断突变菌株发酵产物处理第34页
        2.16.1 液体发酵产物处理第34页
        2.16.2 固体发酵产物处理第34页
    2.17 发酵产物HPLC检测第34-35页
    2.18 发酵产物LC-MS检测第35-37页
第三章 实验结果第37-52页
    3.1 S.thermolilacinus SPC6相关培养基的筛选第37-39页
        3.1.1 产孢培养基的筛选第37-38页
        3.1.2 发酵培养基的筛选第38-39页
        3.1.3 其他培养基的筛选第39页
    3.2 WT-SPC6发酵粗提物抑菌活性测试第39-40页
    3.3 S.thermolilacinus SPC6中环脂肽化合物Marihysin A的发现第40-43页
        3.3.1 WT-SPC6发酵产物Marihysin AHPLC检测结果第42页
        3.3.2 WT-SPC6发酵产物Marihysin ALC-MS检测结果第42-43页
        3.3.3 WT-SPC6发酵产物Marihysin A抑菌活性测试第43页
    3.4 S.thermolilacinus SPC6生物合成基因簇的生物信息学分析第43-46页
    3.5 基因中断重组质粒构建第46-50页
        3.5.1 S.thermolilacinus SPC6总基因组提取第46页
        3.5.2 中断基因簇中部分基因片段的扩增第46-47页
        3.5.3 克隆用载体的选择第47-49页
        3.5.4 C9、C14和C28基因中断重组质粒的构建第49页
        3.5.5 基因中断重组质粒酶切验证第49-50页
    3.6 中断突变株基因型鉴定第50页
    3.7 中断突变株发酵粗提物活性测试第50-51页
    3.8 S.thermolilacinus SPC6野生型菌株和中断突变型菌株发酵产物HPLC检测结果第51-52页
第四章 讨论与展望第52-54页
参考文献第54-58页
致谢第58页

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