| 摘要 | 第6-8页 |
| abstract | 第8-10页 |
| 第一章 绪论 | 第11-15页 |
| 1.1 Aβ简介 | 第11页 |
| 1.2 pH对Aβ_(42)的影响 | 第11-14页 |
| 1.3 研究目的及意义 | 第14-15页 |
| 第二章 模型设计和计算方法 | 第15-21页 |
| 2.1 模型构建 | 第15-18页 |
| 2.1.1 全长的Aβ_(42)单体和低聚物模型构建 | 第15-16页 |
| 2.1.2 全长的Aβ_(42)纤维模型构建 | 第16页 |
| 2.1.3 pH酸性环境的设置 | 第16-17页 |
| 2.1.4 His互变异构影响聚集实验体系的建立 | 第17-18页 |
| 2.2 模拟方法 | 第18页 |
| 2.3 分析方法 | 第18-21页 |
| 第三章 pH对Aβ_(42)单体和低聚物的影响 | 第21-37页 |
| 3.1 Aβ_(42)单体以及低聚物的pKa值 | 第21-22页 |
| 3.2 pH对单体和低聚物的二级结构影响 | 第22-24页 |
| 3.3 Aβ_(42)单体每个残基的二级结构 | 第24-25页 |
| 3.4 质子化使His朝向Aβ_(42)单体质心移动 | 第25-27页 |
| 3.5 His6-His14loop区的构象变化 | 第27-29页 |
| 3.6 pH对低聚物的βcore区域影响 | 第29-31页 |
| 3.7 pH对低聚物Asp23-Lys28盐桥的影响 | 第31-33页 |
| 3.8 与Shammas等人的实验结果的对比 | 第33-34页 |
| 3.9 小结 | 第34-37页 |
| 第四章 pH对Aβ_(42)纤维的影响 | 第37-47页 |
| 4.1 质子数和pH/Aβ_(42)纤维层数的线性关系 | 第37-38页 |
| 4.2 不同pH下的ΔRMSD | 第38-39页 |
| 4.3 临界长度和扭转角 | 第39-42页 |
| 4.4 不同酸性下二级结构 | 第42-44页 |
| 4.5 pH对H-bond数量的影响 | 第44-45页 |
| 4.6 小结 | 第45-47页 |
| 第五章 His异构体对Aβ_(40/42)五聚的影响 | 第47-57页 |
| 5.1 对前人工作的验证 | 第47-48页 |
| 5.2 Aβ_(40/42)低聚体系的SAS | 第48-49页 |
| 5.3 聚集过程中的低聚物数量以及最大低聚物 | 第49-52页 |
| 5.4 低聚过程中Aβ_(40)和Aβ_(42)的体系组成 | 第52-54页 |
| 5.5 小结 | 第54-57页 |
| 第六章 结论与展望 | 第57-59页 |
| 参考文献 | 第59-67页 |
| 致谢 | 第67-69页 |
| 附录 | 第69-70页 |
