| 摘要 | 第4-6页 |
| Abstract | 第6-7页 |
| 第一章 文献综述 | 第12-34页 |
| 1.1 小麦基因组学研究进展 | 第12-15页 |
| 1.2 小麦抗白粉病基因国内外研究进展 | 第15-21页 |
| 1.3 野生二粒小麦中抗白粉病基因研究进展 | 第21-23页 |
| 1.4 中国小麦地方品种中抗白粉病基因研究进展 | 第23-25页 |
| 1.5 小麦和其它禾本科作物比较基因组学研究 | 第25-28页 |
| 1.6 小麦抗病基因图位克隆研究进展 | 第28-32页 |
| 1.7 立论依据和研究内容 | 第32-34页 |
| 第二章 小麦抗白粉病基因Pm41高密度遗传连锁图谱构建和比较基因组学分析 | 第34-52页 |
| 2.1 材料与方法 | 第34-38页 |
| 2.1.1 实验材料 | 第34页 |
| 2.1.2 苗期白粉病抗性鉴定 | 第34-35页 |
| 2.1.3 基因组DNA提取 | 第35-36页 |
| 2.1.4 抗、感池构建 | 第36页 |
| 2.1.5 比较基因组学开发标记 | 第36-37页 |
| 2.1.6 聚合酶链式反应体系和扩增程序 | 第37页 |
| 2.1.7 聚合酶链式反应产物检测 | 第37-38页 |
| 2.1.8 分子标记连锁分析和抗白粉病基因Pm41高密度遗传连锁图谱构建 | 第38页 |
| 2.2 结果与分析 | 第38-48页 |
| 2.2.1 抗白粉病基因Pm41抗性鉴定和遗传分析 | 第38页 |
| 2.2.2 抗白粉病基因Pm41连锁的EST-STS标记 | 第38-39页 |
| 2.2.3 抗白粉病基因Pm41所在基因组区域比较基因组学分析 | 第39-42页 |
| 2.2.4 比较基因组学开发与Pm41连锁的分子标记 | 第42-45页 |
| 2.2.5 抗白粉病基因Pm41所在基因组区域、中国春3B染色体、二穗短柄草、水稻和高粱比较基因组学分析 | 第45-48页 |
| 2.2.6 抗白粉病基因Pm41候选基因组区域与中国春3B染色体参考序列比较分析 | 第48页 |
| 2.3 讨论 | 第48-52页 |
| 2.3.1 野生二粒小麦含有丰富的白粉病抗源 | 第48-49页 |
| 2.3.2 利用比较基因组学构建抗白粉病基因Pm41高密度遗传连锁图谱 | 第49-50页 |
| 2.3.3 抗白粉病基因Pm41所在基因组区域、中国春、二穗短柄草、水稻和高粱同源区间比较 | 第50页 |
| 2.3.4 抗白粉病基因Pm41候选基因组区域与中国春3B染色体参考序列比较 | 第50-52页 |
| 第三章 小麦抗白粉病基因MLHLT比较基因组学定位 | 第52-65页 |
| 3.1 材料与方法 | 第52-53页 |
| 3.1.1 实验材料 | 第52页 |
| 3.1.2 白粉病抗性鉴定 | 第52页 |
| 3.1.3 基因组DNA提取 | 第52页 |
| 3.1.4 抗、感池构建 | 第52页 |
| 3.1.5 分子标记染色体物理定位 | 第52-53页 |
| 3.1.6 比较基因组学开发标记 | 第53页 |
| 3.1.7 聚合酶链式反应体系和扩增程序 | 第53页 |
| 3.1.8 聚合酶链式反应产物检测 | 第53页 |
| 3.1.9 分子标记连锁分析 | 第53页 |
| 3.2 结果与分析 | 第53-61页 |
| 3.2.1 葫芦头抗白粉病鉴定和遗传分析 | 第53-54页 |
| 3.2.2 抗白粉病基因MlHLT分子标记初步定位 | 第54-55页 |
| 3.2.3 利用比较基因组学方法开发与抗白粉病基因MlHLT连锁的分子标记 | 第55-57页 |
| 3.2.4 粗山羊草、二穗短柄草、水稻和高粱比较基因组学分析 | 第57-60页 |
| 3.2.5 抗白粉病基因MlHLT染色体Bin定位 | 第60-61页 |
| 3.2.6 抗白粉病基因MlHLT物理定位 | 第61页 |
| 3.3 讨论 | 第61-65页 |
| 3.3.1 中国小麦地方品种含有丰富的抗白粉病基因 | 第61-62页 |
| 3.3.2 抗白粉病基因MlHLT、Pm24和Pm24b遗传连锁图谱比较 | 第62-63页 |
| 3.3.3 小麦1D染色体短臂富含抗病基因 | 第63-64页 |
| 3.3.4 小麦D基因组多态性较低 | 第64-65页 |
| 第四章 小麦抗白粉病基因MLHLT精细定位和物理图谱构建 | 第65-91页 |
| 4.1 材料与方法 | 第65-71页 |
| 4.1.1 实验材料 | 第65页 |
| 4.1.2 BAC pool构建 | 第65-66页 |
| 4.1.3 BAC pool DNA提取 | 第66-67页 |
| 4.1.4 BAC pool DNA测序和拼接 | 第67页 |
| 4.1.5 利用粗山羊草序列开发标记 | 第67页 |
| 4.1.6 BSR-Seq开发SNP标记及其验证 | 第67-70页 |
| 4.1.7 基于SNP的CAPs/dCAPS标记的开发 | 第70-71页 |
| 4.1.8 关键交换单株筛选 | 第71页 |
| 4.1.9 抗白粉病基因MlHLT高密度遗传连锁图谱构建 | 第71页 |
| 4.1.10 抗白粉病基因MlHLT所在基因组区域物理图谱构建和基因注释 | 第71页 |
| 4.2 结果与分析 | 第71-88页 |
| 4.2.1 抗白粉病基因MlHLT候选区间MTP BAC混池测序 | 第71-74页 |
| 4.2.2 重组单株的筛选 | 第74页 |
| 4.2.3 利用粗山羊草测序scaffolds进行分子标记开发 | 第74-77页 |
| 4.2.4 BSR-Seq开发SNP标记和验证 | 第77-79页 |
| 4.2.5 SNP标记转化成dCAPS标记 | 第79-82页 |
| 4.2.6 抗白粉病基因MlHLT精细遗传连锁图谱构建 | 第82页 |
| 4.2.7 关键重组单株 | 第82-83页 |
| 4.2.8 抗白粉病基因MlHLT所在基因组区间基因注释分析 | 第83-84页 |
| 4.2.9 抗白粉病基因MlHLT候选区间单倍型分析 | 第84-88页 |
| 4.2.10 抗白粉病基因MlHLT候选区间物理图谱 | 第88页 |
| 4.3 讨论 | 第88-91页 |
| 4.3.1 利用粗山羊草序列对抗白粉病基因MlHLT进行精细定位 | 第88-89页 |
| 4.3.2 利用BSR-Seq快速定位小麦基因 | 第89页 |
| 4.3.3 基于SNP位点dCAPS标记的开发和应用 | 第89-90页 |
| 4.3.4 抗白粉病基因MlHLT候选区间包含一个具有CC-NBS-LRR结构域的抗病基因 | 第90-91页 |
| 第五章 结论 | 第91-92页 |
| 参考文献 | 第92-105页 |
| 致谢 | 第105-106页 |
| 作者简历 | 第106-108页 |
