水稻MiRNA关键区域序列比对算法研究
| 摘要 | 第1-6页 |
| ABSTRACT | 第6-11页 |
| 第1章 引言 | 第11-17页 |
| ·研究背景 | 第11-12页 |
| ·基因组信息学 | 第11-12页 |
| ·小分子RNAs的生物信息学研究 | 第12页 |
| ·研究意义 | 第12-13页 |
| ·国内外研究现状 | 第13-14页 |
| ·研究内容及论文组织 | 第14-15页 |
| ·本章小结 | 第15-17页 |
| 第2章 基因组信息学相关技术 | 第17-27页 |
| ·基因组信息学研究技术概述 | 第17-20页 |
| ·多序列对比 | 第17页 |
| ·序列分析算法 | 第17-19页 |
| ·聚类分析方法 | 第19页 |
| ·基因表达调控网络 | 第19-20页 |
| ·MiRNA研究方法概述 | 第20-25页 |
| ·MiRNA研究方向 | 第20-21页 |
| ·得分函数 | 第21-22页 |
| ·Smith Waterman算法 | 第22-24页 |
| ·Needleman Wunsch算法 | 第24-25页 |
| ·MiRNA算法分析 | 第25-26页 |
| ·本章小结 | 第26-27页 |
| 第3章 MiRNA关键区域序列比对算法 | 第27-45页 |
| ·系统生物学实验需求分析 | 第27-28页 |
| ·KMP算法概述 | 第28-30页 |
| ·改进KMP算法效率 | 第30-34页 |
| ·针对错配、空位和反向链的改进 | 第30-32页 |
| ·种子区域 | 第32-33页 |
| ·评价体系 | 第33页 |
| ·S-W算法评分标准 | 第33-34页 |
| ·本文评价标准的拟定 | 第34页 |
| ·水稻基因关键区域算法设计 | 第34-38页 |
| ·转座子区域算法设计 | 第35页 |
| ·端粒区域算法设计 | 第35-36页 |
| ·微卫星区域算法设计 | 第36-37页 |
| ·着丝粒区域算法设计 | 第37-38页 |
| ·算法描述 | 第38页 |
| ·MiRNA数据来源 | 第38-39页 |
| ·生物信息学数据库 | 第38-39页 |
| ·实验数据 | 第39页 |
| ·关键区域比对结果 | 第39-42页 |
| ·端粒区结果 | 第39-40页 |
| ·其他区域结果 | 第40-41页 |
| ·前导区Motif查找 | 第41-42页 |
| ·基因芯片 | 第42页 |
| ·聚类分析 | 第42-43页 |
| ·结果讨论 | 第43页 |
| ·本章小结 | 第43-45页 |
| 第4章 AFLP计算机模拟 | 第45-49页 |
| ·AFLP技术简介 | 第45页 |
| ·MiRNA与AFLP技术 | 第45-46页 |
| ·软件用途与功能 | 第46页 |
| ·模拟难点分析及解决 | 第46页 |
| ·核心技术 | 第46-48页 |
| ·Visual C#集成开发环境 | 第46-47页 |
| ·配对序列比对查找算法 | 第47页 |
| ·图形展示 | 第47-48页 |
| ·多线程技术 | 第48页 |
| ·本章小结 | 第48-49页 |
| 第5章 模拟软件的应用及结果分析 | 第49-61页 |
| ·模拟软件应用 | 第49-58页 |
| ·软件操作流程 | 第49-50页 |
| ·数据输入 | 第50-52页 |
| ·EcorI和MseI选择 | 第52-54页 |
| ·距离参数 | 第54-55页 |
| ·计算过程 | 第55-56页 |
| ·图形展示 | 第56-57页 |
| ·局部片段放大 | 第57-58页 |
| ·结果分析 | 第58-59页 |
| ·本章小结 | 第59-61页 |
| 第6章 总结与展望 | 第61-63页 |
| ·论文主要工作总结 | 第61页 |
| ·心得体会 | 第61-62页 |
| ·进一步工作 | 第62-63页 |
| 参考文献 | 第63-68页 |
| 致谢 | 第68-69页 |
