| 摘要 | 第1-5页 |
| Abstract | 第5-11页 |
| 第一部分 前言 | 第11-25页 |
| 1 飞蝗研究概况 | 第11-16页 |
| ·飞蝗分类地位及分布 | 第11-12页 |
| ·飞蝗研究进展 | 第12-14页 |
| ·我国不同地理区系飞蝗关系和历史演化过程的讨论 | 第14-16页 |
| 2 种群基因组学 | 第16-22页 |
| ·种群基因组学的起始、技术基础和概念 | 第16-18页 |
| ·关于种群基因组学的重要假设 | 第18-20页 |
| ·种群基因组学的研究步骤 | 第20-22页 |
| 3 线粒体基因组 | 第22-23页 |
| ·线粒体基因组结构 | 第22-23页 |
| ·动物线粒体基因组遗传和进化特点 | 第23页 |
| 4 本项研究的意义 | 第23-25页 |
| 第二部分 材料与方法 | 第25-37页 |
| 1 实验材料 | 第25-28页 |
| ·标本的采集、保存与鉴定 | 第25页 |
| ·实验仪器和试剂 | 第25-27页 |
| ·生物信息学软件 | 第27-28页 |
| 2 实验方法 | 第28-33页 |
| ·总DNA提取 | 第28页 |
| ·总DNA检测 | 第28-29页 |
| ·PCR引物设计及PCR扩增 | 第29-32页 |
| ·Sub-PCR扩增产物测序 | 第32-33页 |
| 3 序列编辑和组成分析 | 第33-34页 |
| ·测序结果的片段拼接 | 第33页 |
| ·线粒体基因组序列的基因定位与注释 | 第33页 |
| ·序列组成分析 | 第33页 |
| ·RNA的二级结构的预测 | 第33-34页 |
| 4 七个飞蝗种群线粒体基因组比较分析 | 第34-35页 |
| 5 七个飞蝗种群线粒体基因组系统发育关系分析 | 第35-37页 |
| ·数据来源和数据集组成 | 第35页 |
| ·数据集系统发育信号检验 | 第35-36页 |
| ·建树方法 | 第36-37页 |
| 第三部分 实验结果 | 第37-42页 |
| 1 总DNA的提取 | 第37页 |
| 2 PCR扩增及产物纯化 | 第37-38页 |
| 3 测序结果及序列拼接 | 第38-41页 |
| 4 去重复和序列调零 | 第41-42页 |
| 第四部分 西藏飞蝗线粒体基因组 | 第42-51页 |
| 1 线粒体基因组的基本结构和组成特征 | 第42-44页 |
| ·基因组结构 | 第42-44页 |
| ·基因重叠区和基因间隔区 | 第44页 |
| ·核苷酸组成特点 | 第44页 |
| 2 蛋白质基因 | 第44-48页 |
| ·蛋白质基因碱基组成偏向性分析 | 第44-45页 |
| ·蛋白质基因密码子使用 | 第45-48页 |
| 3 tRNA基因 | 第48页 |
| 4 rRNA基因 | 第48页 |
| 5 A+T丰富区 | 第48-51页 |
| 第五部分 东亚飞蝗松潘种群线粒体基因组 | 第51-58页 |
| 1 线粒体基因组的基本结构和组成特征 | 第51-53页 |
| ·基因组结构 | 第51-53页 |
| ·基因重叠区和基因间隔区 | 第53页 |
| ·核苷酸组成特点 | 第53页 |
| 2 蛋白质基因 | 第53-54页 |
| ·蛋白质基因碱基组成偏向性分析 | 第53-54页 |
| ·蛋白质基因密码子使用 | 第54页 |
| 3 tRNA基因 | 第54-55页 |
| 4 rRNA基因 | 第55页 |
| 5 A+T丰富区 | 第55-58页 |
| 第六部分 东亚飞蝗临沧种群线粒体基因组 | 第58-65页 |
| 1 线粒体基因组的基本结构和组成特征 | 第58-60页 |
| ·基因组结构 | 第58-60页 |
| ·基因重叠区和基因间隔区 | 第60页 |
| ·核苷酸组成特点 | 第60页 |
| 2 蛋白质基因 | 第60-61页 |
| ·蛋白质基因碱基组成偏向性分析 | 第60-61页 |
| ·蛋白质基因密码子使用 | 第61页 |
| 3 tRNA基因 | 第61-62页 |
| 4 rRNA基因 | 第62页 |
| 5 A+T丰富区 | 第62-65页 |
| 第七部分 东亚飞蝗香格里拉种群线粒体基因组 | 第65-72页 |
| 1 线粒体基因组的基本结构和组成特征 | 第65-67页 |
| ·基因组结构 | 第65-67页 |
| ·基因重叠区和基因间隔区 | 第67页 |
| ·核苷酸组成特点 | 第67页 |
| 2 蛋白质基因 | 第67-68页 |
| ·蛋白质基因碱基组成偏向性分析 | 第67-68页 |
| ·蛋白质基因密码子使用 | 第68页 |
| 3 tRNA基因 | 第68-69页 |
| 4 rRNA基因 | 第69页 |
| 5 A+T丰富区 | 第69-72页 |
| 第八部分 七个飞蝗种群线粒体基因组比较分析 | 第72-79页 |
| 1 七个飞蝗种群线粒体基因组比对结果 | 第72-73页 |
| 2 七个飞蝗种群线粒体基因组结构比较 | 第73-76页 |
| 3 七个飞蝗种群的控制区分析 | 第76-79页 |
| 第九部分 七个飞蝗种群线粒体基因组系统发育关系分析 | 第79-85页 |
| 1 碱基替代饱合性分析 | 第79-80页 |
| 2 g1检验 | 第80-81页 |
| 3 PTP检验 | 第81页 |
| 4 构建系统发育关系树 | 第81-83页 |
| ·简约法建树 | 第81-82页 |
| ·最大似然法建树 | 第82页 |
| ·贝叶斯系统发育推论 | 第82-83页 |
| 5 讨论 | 第83-85页 |
| 结论 | 第85-87页 |
| 参考文献 | 第87-98页 |
| 致谢 | 第98-99页 |
| 攻读学位期间的研究成果 | 第99页 |