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仿刺参(Apostichopus japonicus)高密度SNP遗传连锁图谱的构建及应用

摘要第5-7页
Abstract第7-8页
第一章 文献综述第12-34页
    第一节 仿刺参生物学问题研究现状第12-18页
        1.1 仿刺参的进化地位第12页
        1.2 仿刺参的形态及内部构造第12-13页
        1.3 仿刺参的生活习性及应用价值第13-14页
        1.4 仿刺参的发育及繁育第14页
        1.5 仿刺参遗传学研究背景第14-18页
    第二节 遗传标记发展历程第18-28页
        2.1 遗传标记的特点第18-19页
        2.2 分子标记类型第19-24页
        2.3 高通量测序技术推动分子标记技术的发展第24-25页
        2.4 分子标记的应用第25-28页
    第三节 遗传连锁图谱的构建第28-32页
        3.1 作图亲本的选择第28-29页
        3.2 作图群体的选择第29-30页
        3.3 作图标记的选择第30页
        3.4 连锁图谱分析第30-32页
    第四节 本论文研究的目的及意义第32-34页
第二章 应用 2b-RAD 技术构建测序文库及质量控制第34-49页
    引言第34-36页
    第一节 建库材料与方法第36-41页
        1.1 实验材料第36页
        1.2 建库方法第36-41页
    第二节 测序文库质量控制第41-43页
        2.1 克隆预测序第41-42页
        2.2 Solexa 测序第42-43页
    第三节 结果与分析第43-47页
        3.1 测序文库构建分析第43-45页
        3.2 克隆预测序结果第45-46页
        3.3 Solexa 测序质量检测结果第46-47页
    第四节 讨论第47-49页
        4.1 作图标记选择第47页
        4.2 2b-RAD 技术实现过程及先进性分析第47-49页
第三章 仿刺参高密度 SNP 遗传连锁图谱的构建及QTL分析第49-86页
    引言第49-51页
    第一节 测序数据处理第51-54页
        1.1 数据处理第51-52页
        1.2 筛查 SNP 标记分型准确率的验证第52-54页
    第二节 遗传连锁图谱构建及 QTL分析策略第54-56页
        2.1 确立作图标记第54页
        2.2 雌雄遗传连锁图谱构建第54页
        2.3 遗传连锁图谱的整合第54-55页
        2.4 体重性状的 QTL 分析第55-56页
    第三节 数据处理结果及遗传连锁图谱构建结果分析第56-76页
        3.1 数据处理结果第56-57页
        3.2 SNP 分型的验证结果第57-58页
        3.3 雌雄遗传连锁图谱构建结果第58-69页
        3.4 遗传连锁图谱整合结果第69-76页
    第四节 仿刺参体重性状 QTL定位结果第76-82页
        4.1 仿刺参体重性状测定第76页
        4.2 GWAS 分析结果第76-77页
        4.3 MapQTL 分析结果第77-82页
    第五节 讨论第82-86页
        5.1 SNP 标记分型准确率的判断第82页
        5.2 连锁群数目与单倍体染色体数目的对应关系第82-83页
        5.3 雌雄遗传连锁图谱的重组率差异第83-84页
        5.4 遗传连锁图谱分析第84-85页
        5.5 体重性状 QTL 定位分析第85-86页
参考文献第86-92页
个人简历第92-93页
致谢第93-95页

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