| 中文摘要 | 第4-6页 |
| Abstract | 第6-7页 |
| 第一章 绪论 | 第10-17页 |
| 1.1 引言 | 第10页 |
| 1.2 耐药性的分类 | 第10-13页 |
| 1.2.1 天然耐药性 | 第10-12页 |
| 1.2.2 获得性耐药性 | 第12-13页 |
| 1.3 药物靶点结构的变化与耐药性的关系 | 第13-14页 |
| 1.4 分子模拟技术在药物作用机制研究中的应用 | 第14-16页 |
| 1.5 结语 | 第16-17页 |
| 第二章 拓扑异构酶 1 型突变导致拓扑替康耐药性产生的机制 | 第17-33页 |
| 2.1 研究背景 | 第17-19页 |
| 2.2 研究所用材料与方法 | 第19-22页 |
| 2.2.1 初始结构的准备 | 第19页 |
| 2.2.2 分子动力学模拟 | 第19-20页 |
| 2.2.3 拉伸分子动力学模拟 | 第20-21页 |
| 2.2.4 MM/GBSA 结合自由能计算 | 第21页 |
| 2.2.5 MM/GBSA 结合自由能分解 | 第21-22页 |
| 2.3 研究结果与讨论 | 第22-33页 |
| 2.3.1 野生型和突变型复合物在模拟过程中结构的稳定性和个结构域的柔性 | 第22-23页 |
| 2.3.2 MM/GBSA 和拉伸动力学模拟的方法对药物耐药性的评价 | 第23-26页 |
| 2.3.3 突变对拓扑替康结合 DNA 拓扑异构酶 1 型复合体的影响 | 第26-33页 |
| 第三章 抗病毒药物对 2009 H1N1 甲型流感病毒神经氨酸酶 E119G 突变体敏感性差异的研究 | 第33-48页 |
| 3.1 研究背景 | 第33-36页 |
| 3.2 研究所用材料与方法 | 第36-38页 |
| 3.2.1 初始结构与蛋白准备 | 第36页 |
| 3.2.2 分子动力学模拟 | 第36-37页 |
| 3.2.3 MM/GBSA 结合自由能计算 | 第37-38页 |
| 3.2.4 MM/GBSA 结合自由能分解 | 第38页 |
| 3.3 研究结果与讨论 | 第38-48页 |
| 3.3.1 神经氨酸酶野生型和突变型复合物在模拟过程中结构的稳定性 | 第38-40页 |
| 3.3.2 MM/GBSA 对奥司他韦、扎那米韦和帕拉米韦对 H1N1 甲型流感病毒神经氨酸酶 E119G 突变体敏感性差异的预测 | 第40-41页 |
| 3.3.3 奥司他韦、扎那米韦和帕拉米韦对 E119G 突变的敏感性 | 第41-48页 |
| 参考文献 | 第48-61页 |
| 攻读学位期间本人出版或公开发表的论著、论文 | 第61-63页 |
| 致谢 | 第63-64页 |
