基于模体识别和机器学习的细菌基因组中sigma-54启动子预测
| 中文摘要 | 第8-10页 |
| ABSTRACT | 第10-11页 |
| 第一章 引言 | 第12-17页 |
| 1.1 生物信息学简介 | 第12页 |
| 1.2 研究背景 | 第12-14页 |
| 1.3 研究意义 | 第14-16页 |
| 1.4 论文内容与框架 | 第16-17页 |
| 第二章 准备知识 | 第17-21页 |
| 2.1 基因的表达和调控 | 第17-18页 |
| 2.2 调控模体:表示法和识别算法 | 第18-19页 |
| 2.3 分类算法 | 第19-21页 |
| 第三章 数据和方法 | 第21-33页 |
| 3.1 数据准备 | 第21-22页 |
| 3.2 大肠杆菌数据集上的模体识别 | 第22-23页 |
| 3.3 特征选择 | 第23-25页 |
| 3.4 分类 | 第25-27页 |
| 3.5 降维 | 第27-30页 |
| 3.6 性能评价 | 第30-32页 |
| 3.7 本章小节 | 第32-33页 |
| 第四章 结果 | 第33-39页 |
| 4.1 在基准数据集上的模体识别和特征生成 | 第33页 |
| 4.2 结果分析 | 第33-34页 |
| 4.3 降维 | 第34-35页 |
| 4.4 方法在其他物种上的表现 | 第35-36页 |
| 4.5 方法在其他启动子上的表现 | 第36-38页 |
| 4.6 本章小节 | 第38-39页 |
| 第五章 总结与展望 | 第39-40页 |
| 附录 | 第40-45页 |
| 参考文献 | 第45-51页 |
| 致谢 | 第51-53页 |
| 攻读硕士学位期间完成论文情况 | 第53-54页 |
| 学位论文评阅及答辩情况表 | 第54页 |
