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基于基因芯片技术的小麦品种望水白抗赤霉病表达谱分析及一个非特异性脂转移蛋白基因的克隆

摘要第7-10页
ABSTRACT第10-13页
缩略语第14-15页
第一章 文献综述第15-45页
    1 小麦抗赤霉病研究进展第15-27页
        1.1 小麦赤霉病的发生及危害第15-16页
        1.2 禾谷镰刀菌及其毒素研究第16-21页
            1.2.1 禾谷镰刀菌的分类及特征第16-18页
            1.2.2 禾谷镰刀菌的侵染过程第18-19页
            1.2.3 禾谷镰刀菌的毒素类型及其在赤霉菌侵染中的作用第19-21页
        1.3 小麦赤霉病抗性机制研究进展第21-27页
            1.3.1 小麦赤霉病的抗性类型第21-22页
            1.3.2 小麦赤霉病的抗源筛选与种质创新第22-23页
            1.3.3 小麦赤霉病的抗性遗传研究第23-24页
            1.3.4 小麦赤霉病相关的抗病信号途径研究第24-27页
    2 基因芯片技术及其应用第27-32页
        2.1 基因芯片的概念第27页
        2.2 基因芯片的发展历程第27-28页
        2.3 基因芯片的类型第28页
        2.4 基因芯片的制备第28-29页
            2.4.1 芯片制备第28-29页
            2.4.2 样品制备第29页
            2.4.3 生物分子杂交反应第29页
            2.4.4 信号检测第29页
        2.5 基因芯片的数据分析第29-30页
        2.6 基因芯片在植物研究中的应用第30-32页
            2.6.1 基因组测序第30页
            2.6.2 基因差异表达及新基因的发现第30-31页
            2.6.3 基因多态性分析及突变性检测第31页
            2.6.4 植物抗逆研究第31页
            2.6.5 转基因农产品检测和植物检疫第31-32页
        2.7 基因芯片存在的问题第32页
    3 植物非特异性脂转移蛋白的研究进展第32-42页
        3.1 非特异性脂转移蛋白的发现第32-33页
        3.2 非特异性脂转移蛋白的结构和分类第33-35页
        3.3 非特异性脂转移蛋白的生物学功能第35-42页
            3.3.1 非特异性脂转移蛋白的脂转移活性第35页
            3.3.2 非特异性脂转移蛋白在生殖发育中的功能第35-36页
            3.3.3 非特异性脂转移蛋白在抗逆反应中的功能第36页
            3.3.4 非特异性脂转移蛋白在抗病反应中的功能及作用机制第36-42页
    本研究的目的和意义第42-43页
    本研究技术路线第43-45页
第二章 基于基因芯片杂交的望水白抗赤霉病表达谱分析第45-85页
    1 引言第45-46页
    2 材料和方法第46-55页
        2.1 试验材料第46-47页
            2.1.1 植物材料第46-47页
            2.1.2 Affymetrix小麦基因组表达谱芯片2.0第47页
            2.1.3 赤霉菌菌株第47页
        2.2 试验方法第47-55页
            2.2.1 芯片杂交探针制备和芯片杂交、数据扫描和数据处理第47-52页
            2.2.2 实时荧光定量RT-PCR(qRT-PCR)第52-54页
            2.2.3 引物设计第54页
            2.2.4 本研究生物信息学分析所用到的网站网址第54-55页
    3 结果与分析第55-81页
        3.1 望水白和NAUH117受赤霉菌诱导的基因表达谱分析第55-71页
            3.1.1 望水白和NAUH117穗部组织受赤霉菌诱导表达谱分析第55-56页
            3.1.2 差异表达基因的聚类分析第56-57页
            3.1.3 差异表达基因的功能注释第57-61页
            3.1.4 差异表达基因的代谢通路分析第61-66页
            3.1.5 差异表达基因的qRT-PCR分析第66-69页
            3.1.6 差异表达基因的染色体电子定位第69-71页
        3.2 望水白受赤霉菌和DON诱导的基因表达谱分析第71-81页
            3.2.1 望水白穗部组织受赤霉菌和DON诱导表达谱分析第71页
            3.2.2 差异表达基因的聚类分析第71-72页
            3.2.3 差异表达基因的功能注释第72-76页
            3.2.4 差异表达基因的代谢通路分析第76-79页
            3.2.5 差异表达基因的染色体电子定位第79-81页
    4 讨论第81-85页
第三章 望水白中一个非特异性脂转移蛋白基因的克隆和功能鉴定第85-121页
    1 引言第85-86页
    2 材料和方法第86-100页
        2.1 试验材料第86-87页
            2.1.1 植物材料第86页
            2.1.2 用于表达谱分析的植物材料处理方法和取样方案第86-87页
            2.1.3 赤霉菌菌株第87页
            2.1.4 其它菌株和载体第87页
        2.2 试验方法第87-100页
            2.2.1 植物基因组DNA的提取第87-89页
            2.2.2 PCR反应第89页
            2.2.3 PCR扩增产物的检测第89-90页
            2.2.4 PCR扩增产物的染色第90页
            2.2.5 PCR产物的回收及克隆第90-93页
            2.2.6 目的基因与GFP融合蛋白表达载体的构建第93-95页
            2.2.7 基因枪法转化小麦叶片和洋葱表皮细胞第95-96页
            2.2.8 基因的遗传转化第96-99页
            2.2.9 引物设计第99-100页
            2.2.10 本研究生物信息学分析所用到的网站网址第100页
    3 结果与分析第100-118页
        3.1 非特异性脂转移蛋白基因的克隆和序列分析第100-101页
        3.2 TaLTP-B基因的生物信息学分析第101-107页
            3.2.1 ORF及编码氨基酸序列分析第101-102页
            3.2.2 TaLTP-B蛋白质的基本性质第102页
            3.2.3 TaLTP-B的信号肽预测第102-103页
            3.2.4 TaLTP-B蛋白质磷酸化分析第103-104页
            3.2.5 TaLTP-B蛋白质的疏水性分析第104页
            3.2.6 TaLTP-B的系统进化关系分析第104-107页
        3.3 TaLTP-B基因的染色体定位第107页
        3.4 TaLTP-B基因的表达特征分析第107-110页
        3.5 TaLTP-B的亚细胞定位分析第110-112页
            3.5.1 利用生物信息学分析预测TaLTP-B的亚细胞定位第110页
            3.5.2 TaLTP-B-GFP在洋葱表皮细胞及小麦叶片中的亚细胞定位第110-112页
        3.6 TaLTP-B基因的遗传转化及功能鉴定第112-118页
            3.6.1 转TaLTP-B基因超量表达载体的构建第112-113页
            3.6.2 阳性扬麦158转TaLTP-B基因植株的获得及表达分析第113-114页
            3.6.3 TaLTP-B基因转扬麦158 T_0代转基因植株的赤霉病抗性鉴定第114-116页
            3.6.4 转基因植株的白粉病抗性鉴定第116-118页
    4 讨论第118-121页
全文结论第121-123页
创新点第123-125页
参考文献第125-141页
攻读学位期间发表论文情况第141-143页
致谢第143页

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