| 摘要 | 第3-6页 |
| Abstract | 第6-9页 |
| 目录 | 第10-13页 |
| 符号说明 | 第13-18页 |
| 第一章 绪论 | 第18-56页 |
| 1.1 引言 | 第18-21页 |
| 1.1.1 生物系统发酵过程的意义 | 第18-20页 |
| 1.1.2 生物系统带有酶系作用的调节机制 | 第20-21页 |
| 1.2 生物系统发酵过程模型化研究 | 第21-34页 |
| 1.2.1 模型化方法发展综述 | 第21-24页 |
| 1.2.2 集总动力学模型化方法（Lumped kinetic model） | 第24-27页 |
| 1.2.3 考虑代谢网络的复杂动力学模型化方法 | 第27-28页 |
| 1.2.4 基于流量约束的化学计量学模型化方法 | 第28-32页 |
| 1.2.5 其他模型化方法简介 | 第32-34页 |
| 1.2.6 模型化方法小结 | 第34页 |
| 1.3 带有酶系调节作用的动力学模型 | 第34-53页 |
| 1.3.1 模型对于酶系调节作用的描述 | 第34-42页 |
| 1.3.2 带有酶系作用动力学模型的集总表达形式 | 第42-48页 |
| 1.3.3 兼顾代谢网络的带有酶系作用的动力学模型 | 第48-53页 |
| 1.4 本文的主要工作 | 第53-56页 |
| 第二章 带有酶系作用的青霉素发酵过程模型化研究 | 第56-77页 |
| 2.1 青霉素工业生产流程 | 第56-57页 |
| 2.2 青霉素发酵过程已有模型化研究工作 | 第57-61页 |
| 2.2.1 青霉素机理模型 | 第58-59页 |
| 2.2.2 黑箱模型的研究 | 第59-61页 |
| 2.2.3 宏观动力学模型 | 第61页 |
| 2.3 带有酶系作用的青霉素发酵过程的动力学模型 | 第61-76页 |
| 2.3.1 青霉素发酵过程的代谢网络及其简化 | 第61-64页 |
| 2.3.2 反应动力学方程 | 第64-66页 |
| 2.3.3 对青霉素发酵过程酶系作用调节机制的描述 | 第66-71页 |
| 2.3.4 胞内外物质动态平衡方程 | 第71-72页 |
| 2.3.5 青霉素发酵过程带有酶系作用的动力学模型的验证 | 第72页 |
| 2.3.6 小结 | 第72-76页 |
| 2.4 本章小结 | 第76-77页 |
| 第三章 动物细胞培养过程带有酶系作用的模型化研究 | 第77-112页 |
| 3.1 动物细胞培养的实验过程 | 第79-80页 |
| 3.1.1 细胞培养以及培养条件 | 第79-80页 |
| 3.1.2 三组实验描述 | 第80页 |
| 3.1.3 实验分析方法 | 第80页 |
| 3.2 动物细胞代谢网络及其分解 | 第80-90页 |
| 3.2.1 动物细胞代谢网络 | 第80-83页 |
| 3.2.2 代谢网络分析 EFMA 技术 | 第83-88页 |
| 3.2.3 动物细胞的代谢网络分析结果 | 第88-90页 |
| 3.3 带有酶系作用的动物细胞培养过程的动力学模型 | 第90-101页 |
| 3.3.1 带有酶系作用的动力学模型基本框架 | 第90-97页 |
| 3.3.2 带有酶系作用的动物细胞培养动力学模型结构 | 第97-98页 |
| 3.3.3 调节变量的描述 | 第98-99页 |
| 3.3.4 微分方程以及反应动力学方程 | 第99-101页 |
| 3.4 带有酶系作用的动物细胞动力学模型验证 | 第101-108页 |
| 3.4.1 利用最小残差法对模型进行参数辨识 | 第101-102页 |
| 3.4.2 模型有效性的验证与结果讨论 | 第102-108页 |
| 3.5 动物细胞模型预报能力以及适应能力的检验 | 第108-110页 |
| 3.6 本章小结 | 第110-112页 |
| 第四章 混菌发酵过程的模型化研究及优化 | 第112-143页 |
| 4.1 单菌发酵过程以及混菌发酵过程的动力学模型框架 | 第115-117页 |
| 4.1.1 酵母菌单菌发酵过程的动力学模型框架 | 第115-117页 |
| 4.1.2 将单菌发酵的动力学模型拓展到混菌发酵过程 | 第117页 |
| 4.2 单菌动力学模型结构与验证 | 第117-129页 |
| 4.2.1 单菌发酵的带有酶系作用的动力学模型 | 第117-124页 |
| 4.2.2 单菌发酵过程的动力学模型的参数辨识及实验验证 | 第124-129页 |
| 4.3 混菌发酵过程动力学模型预报能力的验证 | 第129-133页 |
| 4.4 混菌发酵过程的优化策略 | 第133-141页 |
| 4.4.1 比较单菌发酵以及混菌发酵的生物乙醇产率 | 第133-136页 |
| 4.4.2 优化混菌发酵过程的两步发酵法 | 第136-137页 |
| 4.4.3 通过最优化计算两步发酵法最优的切换点 | 第137-141页 |
| 4.5 本章小结 | 第141-143页 |
| 第五章 结论与展望 | 第143-148页 |
| 5.1 主要结论 | 第143-146页 |
| 5.2 展望 | 第146-148页 |
| 参考文献 | 第148-163页 |
| 致谢 | 第163-164页 |
| 攻读博士学位期间发表和录用的学术论文 | 第164-165页 |
| 参加的主要科研项目 | 第165-167页 |
