| 摘要 | 第5-7页 |
| Abstract | 第7-8页 |
| 1 引言 | 第11-17页 |
| 1.1 太行鸡（河北柴鸡）介绍 | 第11-12页 |
| 1.2 海蓝褐鸡、罗曼鸡和灵山鸡简介 | 第12页 |
| 1.3 Agouti 基因研究 | 第12-14页 |
| 1.3.1 Agouti 基因作用机理 | 第12-13页 |
| 1.3.2 Agouti 基因及其信号蛋白 | 第13页 |
| 1.3.3 Agouti 基因研究现状 | 第13-14页 |
| 1.3.4 鸡 Agouti 基因研究进展 | 第14页 |
| 1.4 基因 3’非编码区（UTR）及其作用 | 第14-16页 |
| 1.4.1 3’UTR 对生产性能影响 | 第15页 |
| 1.4.2 3’UTR 与 miRNA 间相关研究 | 第15-16页 |
| 1.4.3 Agouti 基因 3’非编码区的研究 | 第16页 |
| 1.5 本研究目的意义及主要内容 | 第16-17页 |
| 1.5.1 研究目的意义 | 第16页 |
| 1.5.2 主要内容研究 | 第16-17页 |
| 2 材料与方法 | 第17-27页 |
| 2.1 试验材料 | 第17-20页 |
| 2.1.1 序列获取 | 第17-18页 |
| 2.1.2 试验鸡的来源 | 第18页 |
| 2.1.3 主要仪器设备 | 第18-19页 |
| 2.1.4 常规溶液及试剂配制 | 第19-20页 |
| 2.1.5 主要分析工具软件 | 第20页 |
| 2.2 主要试验方法和步骤 | 第20-25页 |
| 2.2.1 生物信息学分析 | 第20-21页 |
| 2.2.2 性能测定及分析方法 | 第21-22页 |
| 2.2.3 DNA 的提取及浓度和纯度的检测 | 第22-23页 |
| 2.2.4 引物设计与合成 | 第23-25页 |
| 2.3 统计分析 | 第25-27页 |
| 2.3.1 基因频率和基因型频率的计算 | 第25-26页 |
| 2.3.2 遗传多样性分析 | 第26页 |
| 2.3.3 生产性能相关性分析 | 第26-27页 |
| 3 结果与分析 | 第27-44页 |
| 3.1 Agouti 基因遗传多样性及其变异 | 第27-31页 |
| 3.1.1 物种间 Agouti 基因多样性 | 第27-28页 |
| 3.1.2 物种间 Agouti 基因遗传分化 | 第28-29页 |
| 3.1.3 鸡 Agouti 基因启动子预测 | 第29-30页 |
| 3.1.4 小结 | 第30-31页 |
| 3.2 基因组 DNA 提取结果 | 第31页 |
| 3.3 鸡 Agouti 基因 3’UTR 区变异鉴定及其群体遗传分析 | 第31-38页 |
| 3.3.1 Agouti 基因 3’UTR 部分序列扩增结果 | 第31-32页 |
| 3.3.2 Agouti 基因 3’UTR 序列测序比对结果 | 第32页 |
| 3.3.3 Agouti 基因 3’UTR 群体变异分析 | 第32-36页 |
| 3.3.4 生产性能测定与关联分析 | 第36-37页 |
| 3.3.5 小结 | 第37-38页 |
| 3.4 Agouti 基因外显子 4 变异鉴定及其群体遗传分析 | 第38-44页 |
| 3.4.1 Agouti 基因外显子 4 部分序列扩增结果 | 第38页 |
| 3.4.2 Agouti 基因测序结果比对 | 第38-39页 |
| 3.4.3 Agouti 基因外显子 4 变异群体变异分析 | 第39-41页 |
| 3.4.4 生产性能测定与关联分析 | 第41-42页 |
| 3.4.5 小结 | 第42-44页 |
| 4 结论 | 第44-45页 |
| 参考文献 | 第45-50页 |
| 在读期间发表论文情况 | 第50-51页 |
| 作者简历 | 第51-52页 |
| 致谢 | 第52-53页 |
