摘要 | 第5-7页 |
Abstract | 第7-9页 |
第1章 绪论 | 第13-28页 |
1.1 生物信息学简介 | 第13-16页 |
1.1.1 生物信息学的内涵 | 第13-14页 |
1.1.2 生物信息学的主要研究内容 | 第14-15页 |
1.1.3 后基因组学时代生物信息的研究热点 | 第15页 |
1.1.4 当前我国生物信息学的研究进展 | 第15-16页 |
1.2 常用生物信息数据库 | 第16-19页 |
1.2.1 不同研究方向代表性数据库 | 第16-18页 |
1.2.2 GenBank数据库 | 第18-19页 |
1.3 微卫星序列概述 | 第19-23页 |
1.3.1 重复序列的分类 | 第19-21页 |
1.3.2 微卫星序列的分布和功能 | 第21-22页 |
1.3.3 与微卫星扩增相关的人类疾病 | 第22-23页 |
1.3.4 微卫星的实际应用 | 第23页 |
1.4 有关噬菌体的介绍 | 第23-26页 |
1.4.1 噬菌体的分类 | 第23页 |
1.4.2 噬菌体在医疗中的应用 | 第23-24页 |
1.4.3 T4噬菌体颗粒结构和基因组特征 | 第24-26页 |
1.5 本研究工作的内容和意义 | 第26-28页 |
第2章 T4噬菌体(T4-like viruses)基因组中微卫星和复合型微卫星分析 | 第28-44页 |
2.1 前言 | 第28页 |
2.2 材料与方法 | 第28-33页 |
2.2.1 数据集 | 第28-31页 |
2.2.2 随机序列的生成 | 第31-32页 |
2.2.3 微卫星的抽提 | 第32页 |
2.2.4 复合型微卫星的抽提 | 第32页 |
2.2.5 统计学分析 | 第32-33页 |
2.3 结果与讨论 | 第33-43页 |
2.3.1 微卫星与复合型微卫星的发生率 | 第33-36页 |
2.3.2 基因组两大特征对微卫星含量的影响分析 | 第36-38页 |
2.3.3 复合型微卫星的复杂程度及其分布 | 第38-39页 |
2.3.4 dMAX对复合型微卫星发生率的影响 | 第39页 |
2.3.5 T4噬菌体中单核至三核苷酸不同重复单元的发生率 | 第39-41页 |
2.3.6 参考序列和随机序列中微卫星发生率的比较 | 第41-43页 |
2.4 本章小结 | 第43-44页 |
第3章 噬菌体与疱疹病毒中的微卫星差异分析 | 第44-54页 |
3.1 前言 | 第44页 |
3.2 材料与方法 | 第44-48页 |
3.2.1 疱疹病毒和尾病毒目噬菌体简介 | 第44-45页 |
3.2.2 选材 | 第45-48页 |
3.2.3 微卫星的提取和统计 | 第48页 |
3.3 结果与讨论 | 第48-52页 |
3.3.1 疱疹病毒和噬菌体中微卫星发生率的差异 | 第48页 |
3.3.2 GC含量对微卫星发生率的影响 | 第48-50页 |
3.3.3 微卫星差异的分析 | 第50-52页 |
3.4 本章小结 | 第52-54页 |
结论 | 第54-55页 |
参考文献 | 第55-60页 |
附录一 攻读硕士期间发表的学术论文目录 | 第60-61页 |
附录二 程序:C语言编程产生随机序列 | 第61-64页 |
致谢 | 第64页 |