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噬菌体(Bacteriophage)基因组中微卫星发生率和分布分析

摘要第5-7页
Abstract第7-9页
第1章 绪论第13-28页
    1.1 生物信息学简介第13-16页
        1.1.1 生物信息学的内涵第13-14页
        1.1.2 生物信息学的主要研究内容第14-15页
        1.1.3 后基因组学时代生物信息的研究热点第15页
        1.1.4 当前我国生物信息学的研究进展第15-16页
    1.2 常用生物信息数据库第16-19页
        1.2.1 不同研究方向代表性数据库第16-18页
        1.2.2 GenBank数据库第18-19页
    1.3 微卫星序列概述第19-23页
        1.3.1 重复序列的分类第19-21页
        1.3.2 微卫星序列的分布和功能第21-22页
        1.3.3 与微卫星扩增相关的人类疾病第22-23页
        1.3.4 微卫星的实际应用第23页
    1.4 有关噬菌体的介绍第23-26页
        1.4.1 噬菌体的分类第23页
        1.4.2 噬菌体在医疗中的应用第23-24页
        1.4.3 T4噬菌体颗粒结构和基因组特征第24-26页
    1.5 本研究工作的内容和意义第26-28页
第2章 T4噬菌体(T4-like viruses)基因组中微卫星和复合型微卫星分析第28-44页
    2.1 前言第28页
    2.2 材料与方法第28-33页
        2.2.1 数据集第28-31页
        2.2.2 随机序列的生成第31-32页
        2.2.3 微卫星的抽提第32页
        2.2.4 复合型微卫星的抽提第32页
        2.2.5 统计学分析第32-33页
    2.3 结果与讨论第33-43页
        2.3.1 微卫星与复合型微卫星的发生率第33-36页
        2.3.2 基因组两大特征对微卫星含量的影响分析第36-38页
        2.3.3 复合型微卫星的复杂程度及其分布第38-39页
        2.3.4 dMAX对复合型微卫星发生率的影响第39页
        2.3.5 T4噬菌体中单核至三核苷酸不同重复单元的发生率第39-41页
        2.3.6 参考序列和随机序列中微卫星发生率的比较第41-43页
    2.4 本章小结第43-44页
第3章 噬菌体与疱疹病毒中的微卫星差异分析第44-54页
    3.1 前言第44页
    3.2 材料与方法第44-48页
        3.2.1 疱疹病毒和尾病毒目噬菌体简介第44-45页
        3.2.2 选材第45-48页
        3.2.3 微卫星的提取和统计第48页
    3.3 结果与讨论第48-52页
        3.3.1 疱疹病毒和噬菌体中微卫星发生率的差异第48页
        3.3.2 GC含量对微卫星发生率的影响第48-50页
        3.3.3 微卫星差异的分析第50-52页
    3.4 本章小结第52-54页
结论第54-55页
参考文献第55-60页
附录一 攻读硕士期间发表的学术论文目录第60-61页
附录二 程序:C语言编程产生随机序列第61-64页
致谢第64页

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