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牙鲆变态发育中Drosha蛋白与甲状腺激素受体的相互作用及其对microRNA的调控

中文摘要第4-8页
英文摘要第8-11页
缩略词表第12-16页
第一章 引言第16-28页
    1.1 牙鲆变态的分子机制第16-19页
    1.2 甲状腺激素在牙鲆变态发育过程中的作用第19-24页
    1.3 Drosha基因在个体发育中的作用第24-28页
第二章 甲状腺激素对牙鲆Drosha基因表达的影响第28-53页
    2.1 实验材料与试剂第28-32页
        2.1.1 样品采集第28-29页
        2.1.2 主要试剂与仪器第29-32页
    2.2 实验方法第32-44页
        2.2.1 牙鲆组织总RNA提取与鉴定第32页
        2.2.2 cDNA第一链的合成第32-34页
        2.2.3 引物设计第34页
        2.2.4 牙鲆Drosha基因片段克隆第34-37页
        2.2.5 牙鲆Drosha基因全长克隆第37-43页
        2.2.6 Drosha基因cDNA小片段、5'RACE和 3'RACE序列拼接第43页
        2.2.7 生物信息学分析第43页
        2.2.8 实时荧光定量分析第43-44页
    2.3 结果第44-50页
        2.3.1 牙鲆Drosha cDNA克隆及分析第44-47页
        2.3.2 .Drosha基因在牙鲆发育过程中的表达分析第47-50页
    2.4 讨论第50-53页
        2.4.1 Drosha基因在各组织中的表达第51页
        2.4.2.Drosha基因仔鱼各发育时期的表达第51-52页
        2.4.3 外源甲状腺激素对Drosha基因表达的影响第52-53页
第三章 甲状腺激素受体与DROSHA蛋白的相互作用第53-60页
    3.1 材料与方法第53-56页
        3.1.1 实验材料第53页
        3.1.2 实验方法第53-56页
    3.2 结果第56-57页
    3.3 讨论第57-60页
        3.3.1 利用免疫共沉淀技术研究THR-Drosha之间的相互作用第57-58页
        3.3.2 实验的质量控制第58页
        3.3.3 THR和Drosha相互作用调控miRNA的生成第58-60页
第四章RNA干扰沉默Drosha基因表达第60-73页
    4.1 材料第60-61页
    4.2 实验方法第61-65页
        4.2.1 Drosha-siRNA靶点的选择、设计及合成第61页
        4.2.2 细胞转染第61-62页
        4.2.3 转染效率的检测第62页
        4.2.4 Realtime-PCR检测Drosha mRNA表达第62-63页
        4.2.5 Western blot检测Drosha蛋白表达第63页
        4.2.6 siRNA最佳作用浓度的筛选第63页
        4.2.7 siRNA最佳作用时间的筛选第63-64页
        4.2.8 细胞凋亡检测第64页
        4.2.9 Realtime-PCR检测Drosha下游基因CDKN2A,Cdc42 的表达第64页
        4.2.10 统计学处理第64-65页
    4.3 结果第65-70页
        4.3.1 siRNA转染效果检测第65页
        4.3.2 siRNA沉默效果检测第65-66页
        4.3.3 siRNA最佳浓度的筛选第66-67页
        4.3.4 siRNA最佳作用时间的筛选第67-68页
        4.3.5 siRNA转染后细胞凋亡的检测第68-69页
        4.3.6 Realtime-PCR检测Drosha基因沉默后pri-miRNA和miRNA的表达第69页
        4.3.7 Realtime-PCR检 测Drosha基 因沉默后细胞周期调控基因CDKN2A,Cdc42 mRNA表达第69-70页
    4.4 讨论第70-73页
        4.4.1 利用siRNA干扰技术靶向抑制Drosha基因的表达第70-71页
        4.4.2 牙鲆胚胎细胞中Drosha基因靶向沉默对下游基因的影响第71-72页
        4.4.3 靶向沉默Drosha基因后导致miRNA表达谱的变化第72-73页
第五章microRNA靶基因预测及验证第73-105页
    5.1 材料与方法第74-80页
        5.1.1 实验材料第74页
        5.1.2 实验方法第74-80页
    5.2 结果第80-98页
        5.2.1 肌肉相关microRNA靶基因预测及验证第80-91页
        5.2.2 细胞周期相关靶基因预测及验证第91-98页
    5.3 讨论第98-105页
        5.3.1 α-TM在牙鲆组织和发育时期的表达第98-99页
        5.3.2 牙鲆HDAC4 序列的结构特点第99-100页
        5.3.3 牙鲆HDAC4 在牙鲆发育过程中的作用第100-102页
        5.3.4 牙鲆HDAC4 是miR-1 和miR-133a的靶基因第102-103页
        5.3.5 牙鲆Cdc42 的结构特点及在牙鲆发育过程中的作用第103-104页
        5.3.6 Cdc42 是miR-17 的靶基因第104-105页
第六章 总结与展望第105-107页
参考文献第107-116页
发表论文第116-117页
致谢第117页

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