| 摘要 | 第8-9页 |
| ABSTRACT | 第9-10页 |
| 1 前言 | 第11-26页 |
| 1.1 氮循环方式 | 第11-14页 |
| 1.1.1 生物固氮作用 | 第12-13页 |
| 1.1.2 硝化作用 | 第13-14页 |
| 1.1.3 反硝化作用 | 第14页 |
| 1.1.4 氨化作用 | 第14页 |
| 1.2 氮转化微生物及功能基因 | 第14-19页 |
| 1.2.1 固氮微生物 | 第14-15页 |
| 1.2.2 氨氧化细菌微生物 | 第15-16页 |
| 1.2.3 氨氧化古菌微生物 | 第16-17页 |
| 1.2.4 反硝化菌微生物 | 第17-19页 |
| 1.3 生态因子对微生物群落影响的相关研究 | 第19-21页 |
| 1.4 荧光定量 PCR 技术 | 第21-23页 |
| 1.4.1 荧光定量 PCR 技术分类 | 第21-22页 |
| 1.4.2 荧光定量 PCR 技术的优势 | 第22-23页 |
| 1.5 研究区域概况 | 第23-24页 |
| 1.6 本论文的目的和意义 | 第24-26页 |
| 2 江南桤木-芦苇混合群落土壤中固氮菌的分离、筛选与鉴定 | 第26-43页 |
| 2.1 材料与方法 | 第26-34页 |
| 2.1.1 土壤样品的采集和预处理 | 第26-27页 |
| 2.1.2 土壤理化性质的测定 | 第27-29页 |
| 2.1.3 分离自生固氮菌的培养基 | 第29-31页 |
| 2.1.4 不同土壤样品固氮菌的分离 | 第31页 |
| 2.1.5 固氮菌的纯化及保存 | 第31页 |
| 2.1.6 菌种的革兰氏测定 | 第31-33页 |
| 2.1.7 菌株产酸、碱性能的测定 | 第33页 |
| 2.1.8 不同植物群落固氮酶活性的测定 | 第33-34页 |
| 2.2 结果与分析 | 第34-40页 |
| 2.2.1 不同土壤理化性质的差异 | 第34-36页 |
| 2.2.2 菌落的形态学特性 | 第36-39页 |
| 2.2.3 不同土壤固氮菌固氮酶活性的差异 | 第39-40页 |
| 2.3 讨论 | 第40-42页 |
| 2.4 小结 | 第42-43页 |
| 3 不同植物群落土壤中分离固氮菌的 16S rDNA 及 nifH 系统发育分析 | 第43-55页 |
| 3.1 实验材料及方法 | 第43-48页 |
| 3.1.1 实验仪器 | 第43页 |
| 3.1.2 主要试剂 | 第43-44页 |
| 3.1.3 PCR 引物 | 第44-45页 |
| 3.1.4 土壤微生物总 DNA 的提取 | 第45-46页 |
| 3.1.5 分离的菌株 16S rDNA PCR 扩增 | 第46-47页 |
| 3.1.6 分离菌株 nifH PCR 扩增 | 第47页 |
| 3.1.7 PCR 产物的纯化 | 第47-48页 |
| 3.1.8 DNA 序列测定 | 第48页 |
| 3.1.9 系统发育分析方法 | 第48页 |
| 3.2 结果与分析 | 第48-53页 |
| 3.2.1 固氮菌的 16S rDNA 序列系统发育分析 | 第48-51页 |
| 3.2.2 固氮菌 nifH 序列系统发育分析 | 第51-53页 |
| 3.3 讨论 | 第53-54页 |
| 3.4 小结 | 第54-55页 |
| 4 江南桤木-芦苇混合群落和纯芦苇群落参与氮转化微生物的定量分析 | 第55-78页 |
| 4.1 混合群落和芦苇群落根际与非根际固氮菌的定量分析 | 第55-62页 |
| 4.1.1 材料与方法 | 第55-58页 |
| 4.1.2 结果与分析 | 第58-62页 |
| 4.2 混合群落和芦苇群落根际与非根际氨氧化细菌和古菌的定量分析 | 第62-68页 |
| 4.2.1 材料与方法 | 第62-64页 |
| 4.2.2 结果与分析 | 第64-68页 |
| 4.3 混合群落和芦苇群落根际与非根际反硝化细菌的定量分析 | 第68-72页 |
| 4.3.1 材料与方法 | 第68-70页 |
| 4.3.2 结果与分析 | 第70-72页 |
| 4.4 环境因子与氮转化过程中微生物数量的相关性 | 第72-74页 |
| 4.4.1 氮转化过程主要功能基因拷贝数的比较与分析 | 第72-73页 |
| 4.4.2 环境因子对氮转化过程微生物的主要影响及相关性分析 | 第73-74页 |
| 4.5 讨论 | 第74-77页 |
| 4.6 小结 | 第77-78页 |
| 5 结论与展望 | 第78-80页 |
| 5.1 结论 | 第78-79页 |
| 5.2 展望 | 第79-80页 |
| 参考文献 | 第80-89页 |
| 附录 1 崇西湿地土壤中分离的固氮菌 16S rDNA 序列 | 第89-98页 |
| 附录 2 分离固氮菌 nif 序列 | 第98-101页 |
| 作者在攻读硕士学位期间公开发表的论文 | 第101-103页 |
| 致谢 | 第103页 |
