基于网络拓扑结构的蛋白质相互作用网络比对方法研究
| 摘要 | 第4-5页 |
| Abstract | 第5页 |
| 第1章 绪论 | 第8-16页 |
| 1.1 本课题的背景 | 第8-11页 |
| 1.2 国内外研究现状 | 第11-12页 |
| 1.3 本课题的研究意义 | 第12-13页 |
| 1.4 本文的主要研究内容 | 第13页 |
| 1.5 本文的工作及组织结构 | 第13-16页 |
| 第2章 蛋白质相互作用网络概述 | 第16-28页 |
| 2.1 复杂网络的基本概念 | 第16-18页 |
| 2.2 网络模型的概念 | 第18-19页 |
| 2.2.1 随机网络模型 | 第18-19页 |
| 2.2.2 无标度网络模型 | 第19页 |
| 2.2.3 粘性网络模型 | 第19页 |
| 2.3 蛋白质相互作用网络比对的基本概念 | 第19-21页 |
| 2.4 蛋白质相互作用网络比对的特点 | 第21-22页 |
| 2.5 蛋白质网络比对算法 | 第22-26页 |
| 2.5.1 蛋白质相互作用网络比对的分类 | 第22-24页 |
| 2.5.2 常见的蛋白质相互作用网络比对方法 | 第24-26页 |
| 2.6 小结 | 第26-28页 |
| 第3章 数据库介绍 | 第28-34页 |
| 3.1 数据库简介 | 第28-31页 |
| 3.2 实验数据来源 | 第31-33页 |
| 3.3 小结 | 第33-34页 |
| 第4章 蛋白质相互作用网络比对算法 | 第34-44页 |
| 4.1 蛋白质相互作用网络全局比对 | 第34-36页 |
| 4.1.1 序列比对 | 第35-36页 |
| 4.1.2 局部比对 | 第36页 |
| 4.2 Tolop 算法的比对思想 | 第36-37页 |
| 4.3 Tolop 算法的节点比对方法 | 第37-40页 |
| 4.3.1 子图比对 | 第38-39页 |
| 4.3.2 节点的相似性计算 | 第39-40页 |
| 4.4 网络搜索算法 | 第40-42页 |
| 4.5 小结 | 第42-44页 |
| 第5章 结果分析 | 第44-52页 |
| 5.1 网络比对的结果 | 第44-45页 |
| 5.2 比对结果的分析 | 第45-46页 |
| 5.3 不同算法的结果分析 | 第46-48页 |
| 5.4 比对结果的评估 | 第48-51页 |
| 5.4.1 Yeast-Human 相似性评估 | 第48-50页 |
| 5.4.2 Tolop 算法比对的生物意义 | 第50-51页 |
| 5.5 小结 | 第51-52页 |
| 第6章 总结与展望 | 第52-56页 |
| 6.1 总结 | 第52-54页 |
| 6.1.1 贡献和创新点 | 第52-53页 |
| 6.1.2 工作内容 | 第53-54页 |
| 6.2 展望 | 第54-56页 |
| 参考文献 | 第56-64页 |
| 作者简介及攻读硕士期间科研成果 | 第64-66页 |
| 致谢 | 第66-67页 |
