中文摘要 | 第4-7页 |
Abstract | 第7-9页 |
目录 | 第10-14页 |
第一章 绪论 | 第14-30页 |
1.1 胶质瘤的相关介绍 | 第14-20页 |
1.1.1 胶质瘤的概述 | 第14页 |
1.1.2 发病机制 | 第14-15页 |
1.1.3 临床表现及早期检查 | 第15-17页 |
1.1.4 治疗现状 | 第17-20页 |
1.2 基因芯片数据的生物信息学分析 | 第20-26页 |
1.2.1 基因芯片及其应用 | 第20-21页 |
1.2.2 生物信息学及其应用 | 第21-22页 |
1.2.3 数据预处理 | 第22-23页 |
1.2.4 差异表达基因分析 | 第23-24页 |
1.2.5 聚类分析 | 第24-25页 |
1.2.6 胶质瘤的生物信息学研究现状 | 第25-26页 |
1.3 研究目的及主要内容 | 第26-28页 |
1.4 本研究的创新性及意义 | 第28-30页 |
第二章 芯片数据获取及差异表达基因分析 | 第30-40页 |
2.1 实验目的 | 第30页 |
2.2 材料与方法 | 第30-32页 |
2.2.1 数据下载途径 | 第30页 |
2.2.2 GSE4290基因表达谱 | 第30-31页 |
2.2.3 GSE15824基因表达谱 | 第31页 |
2.2.4 芯片数据的预处理 | 第31-32页 |
2.2.5 差异表达基因的获得 | 第32页 |
2.3 结果 | 第32-37页 |
2.3.1 筛选差异化表达基因的数目 | 第32-34页 |
2.3.2 差异表达基因表达变化分析 | 第34-37页 |
2.3.3 不同亚型胶质瘤的重叠差异表达基因 | 第37页 |
2.3.4 不同级别胶质瘤的重叠差异表达基因 | 第37页 |
2.4 本章小结 | 第37-40页 |
第三章 不同亚型胶质瘤的基因功能分析 | 第40-52页 |
3.1 实验目的 | 第40页 |
3.2 材料与方法 | 第40-42页 |
3.2.1 差异表达基因的 GO 富集分析和 KEGG 通路分析 | 第40页 |
3.2.2 差异表达基因的蛋白质相互作用网络的构建 | 第40-41页 |
3.2.3 差异共表达基因和差异共调控基因的筛选 | 第41页 |
3.2.4 差异共调控基因相关的转录调控网络的构建 | 第41-42页 |
3.3 实验结果 | 第42-50页 |
3.3.1 差异表达基因的 GO 富集分析和 KEGG 通路富集分析 | 第42-44页 |
3.3.2 三组差异表达基因的 PPI 网络及重要基因 | 第44-46页 |
3.3.3 差异共调控网络 | 第46-48页 |
3.3.4 转录调控网络 | 第48-50页 |
3.4 本章小结 | 第50-52页 |
第四章 不同级别胶质瘤的基因功能分析 | 第52-62页 |
4.1 实验目的 | 第52页 |
4.2 材料和方法 | 第52-54页 |
4.2.1 基因分类方法 | 第52页 |
4.2.2 构建蛋白质互作(PPI)网络 | 第52-53页 |
4.2.3 KEGG通路富集分析 | 第53-54页 |
4.3 实验结果 | 第54-60页 |
4.3.1 Grade依赖的基因分类 | 第54-56页 |
4.3.2 基于蛋白质互作(PPI)网络的 KEGG 通路富集分析 | 第56-59页 |
4.3.3 富集 KEGG 通路的调控 | 第59-60页 |
4.4 本章小结 | 第60-62页 |
第五章 讨论 | 第62-72页 |
第六章 结论 | 第72-74页 |
参考文献 | 第74-96页 |
附录 | 第96-106页 |
附表 1. 两个通路中的差异基因及其分类 | 第96-97页 |
附表 2. 中英文词语对照 | 第97-106页 |
作者简介及攻博期间所取得的科研成果 | 第106-107页 |
致谢 | 第107页 |