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利用生物信息学方法筛选胶质瘤的差异表达基因及其相关机制

中文摘要第4-7页
Abstract第7-9页
目录第10-14页
第一章 绪论第14-30页
    1.1 胶质瘤的相关介绍第14-20页
        1.1.1 胶质瘤的概述第14页
        1.1.2 发病机制第14-15页
        1.1.3 临床表现及早期检查第15-17页
        1.1.4 治疗现状第17-20页
    1.2 基因芯片数据的生物信息学分析第20-26页
        1.2.1 基因芯片及其应用第20-21页
        1.2.2 生物信息学及其应用第21-22页
        1.2.3 数据预处理第22-23页
        1.2.4 差异表达基因分析第23-24页
        1.2.5 聚类分析第24-25页
        1.2.6 胶质瘤的生物信息学研究现状第25-26页
    1.3 研究目的及主要内容第26-28页
    1.4 本研究的创新性及意义第28-30页
第二章 芯片数据获取及差异表达基因分析第30-40页
    2.1 实验目的第30页
    2.2 材料与方法第30-32页
        2.2.1 数据下载途径第30页
        2.2.2 GSE4290基因表达谱第30-31页
        2.2.3 GSE15824基因表达谱第31页
        2.2.4 芯片数据的预处理第31-32页
        2.2.5 差异表达基因的获得第32页
    2.3 结果第32-37页
        2.3.1 筛选差异化表达基因的数目第32-34页
        2.3.2 差异表达基因表达变化分析第34-37页
        2.3.3 不同亚型胶质瘤的重叠差异表达基因第37页
        2.3.4 不同级别胶质瘤的重叠差异表达基因第37页
    2.4 本章小结第37-40页
第三章 不同亚型胶质瘤的基因功能分析第40-52页
    3.1 实验目的第40页
    3.2 材料与方法第40-42页
        3.2.1 差异表达基因的 GO 富集分析和 KEGG 通路分析第40页
        3.2.2 差异表达基因的蛋白质相互作用网络的构建第40-41页
        3.2.3 差异共表达基因和差异共调控基因的筛选第41页
        3.2.4 差异共调控基因相关的转录调控网络的构建第41-42页
    3.3 实验结果第42-50页
        3.3.1 差异表达基因的 GO 富集分析和 KEGG 通路富集分析第42-44页
        3.3.2 三组差异表达基因的 PPI 网络及重要基因第44-46页
        3.3.3 差异共调控网络第46-48页
        3.3.4 转录调控网络第48-50页
    3.4 本章小结第50-52页
第四章 不同级别胶质瘤的基因功能分析第52-62页
    4.1 实验目的第52页
    4.2 材料和方法第52-54页
        4.2.1 基因分类方法第52页
        4.2.2 构建蛋白质互作(PPI)网络第52-53页
        4.2.3 KEGG通路富集分析第53-54页
    4.3 实验结果第54-60页
        4.3.1 Grade依赖的基因分类第54-56页
        4.3.2 基于蛋白质互作(PPI)网络的 KEGG 通路富集分析第56-59页
        4.3.3 富集 KEGG 通路的调控第59-60页
    4.4 本章小结第60-62页
第五章 讨论第62-72页
第六章 结论第72-74页
参考文献第74-96页
附录第96-106页
    附表 1. 两个通路中的差异基因及其分类第96-97页
    附表 2. 中英文词语对照第97-106页
作者简介及攻博期间所取得的科研成果第106-107页
致谢第107页

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