| 摘要 | 第4-6页 |
| Abstract | 第6-7页 |
| 第一章 绪论 | 第10-18页 |
| 1.1 植物病害的研究现状 | 第10-11页 |
| 1.1.1 植物病害的介绍 | 第10页 |
| 1.1.2 植物病害的防治 | 第10-11页 |
| 1.2 生防细菌的研究背景 | 第11-14页 |
| 1.2.1 生防假单胞菌及应用 | 第11-13页 |
| 1.2.2 生防芽孢杆菌及应用 | 第13-14页 |
| 1.3 全基因组测序 | 第14-16页 |
| 1.3.1 DNA测序的发展 | 第15-16页 |
| 1.3.2 全基因组研究现状及应用 | 第16页 |
| 1.4 研究目的及意义 | 第16-18页 |
| 第二章 JD37适应性及生防作用机制的生物信息学分析 | 第18-32页 |
| 2.1 试验材料 | 第19-20页 |
| 2.1.1 供试菌株 | 第19页 |
| 2.1.2 供试菌株全基因组信息 | 第19页 |
| 2.1.3 生物信息学分析软件 | 第19-20页 |
| 2.2 试验方法 | 第20-21页 |
| 2.2.1 与适应不利环境相关的基因的查找 | 第20页 |
| 2.2.2 基因岛、前噬菌体及其相关功能预测 | 第20页 |
| 2.2.3 细菌次级代谢产物的预测 | 第20页 |
| 2.2.4 JD37中合成抗生素的相关基因 | 第20-21页 |
| 2.3 结果与分析 | 第21-30页 |
| 2.3.1 适应性相关作用机制试验结果 | 第21-23页 |
| 2.3.2 基因岛及其相关信息的查找结果 | 第23-24页 |
| 2.3.3 前噬菌体基因预测结果 | 第24-27页 |
| 2.3.4 假单胞菌次级代谢产物合成基因簇预测及比较分析结果 | 第27-28页 |
| 2.3.5 JD37合成抗生素基因簇分析 | 第28-30页 |
| 2.4 小结 | 第30-32页 |
| 第三章 S3-1 基因组测序、拼接与序列特征的分析 | 第32-48页 |
| 3.1 试验材料 | 第32-33页 |
| 3.1.1 供试菌株 | 第32-33页 |
| 3.1.2 培养基和材料 | 第33页 |
| 3.1.3 主要试剂 | 第33页 |
| 3.1.4 主要仪器 | 第33页 |
| 3.2 试验方法 | 第33-36页 |
| 3.2.1 供试菌株的活化 | 第33页 |
| 3.2.2 细菌总DNA提取 | 第33-34页 |
| 3.2.3 细菌总DNA纯度检测 | 第34页 |
| 3.2.4 细菌 16S rDNA重鉴定和总DNA的测序、拼接与序列递交 | 第34-35页 |
| 3.2.5 细菌全基因组序列功能元件分析 | 第35-36页 |
| 3.2.6 细菌全基因组生物信息学分析 | 第36页 |
| 3.2.7 基因组圈图绘制 | 第36页 |
| 3.3 结果与分析 | 第36-46页 |
| 3.3.1 细菌总DNA提取与检测 | 第36-37页 |
| 3.3.2 细菌 16S rDNA重鉴定及全基因组测序 | 第37-38页 |
| 3.3.3 细菌全基因组序列功能元件分析 | 第38-40页 |
| 3.3.4 细菌全基因组生物信息学分析 | 第40-46页 |
| 3.4 小结 | 第46-48页 |
| 第四章 JD37与S3-1 在生物防治中的复合作用 | 第48-58页 |
| 4.1 试验材料 | 第48-50页 |
| 4.1.1 供试菌株 | 第48-49页 |
| 4.1.2 土壤样品 | 第49页 |
| 4.1.3 培养基和材料 | 第49页 |
| 4.1.4 主要仪器 | 第49-50页 |
| 4.2 试验方法 | 第50-52页 |
| 4.2.1 供试菌株的活化 | 第50页 |
| 4.2.2 番茄灰霉病病菌孢子悬液的制备 | 第50页 |
| 4.2.3 供试菌株对番茄灰霉病菌抑制效果试验 | 第50-51页 |
| 4.2.4 供试菌株相容性检测 | 第51页 |
| 4.2.5 不同培养基对供试菌株生长的影响 | 第51页 |
| 4.2.6 复合发酵生长曲线及抑菌活性 | 第51页 |
| 4.2.7 复合发酵液对土壤中病原真菌数量的影响 | 第51-52页 |
| 4.3 结果与分析 | 第52-57页 |
| 4.3.1 利用平板对峙检测JD37、S3-1 对番茄灰霉病菌的抑制效果 | 第52-53页 |
| 4.3.2 JD37和S3-1 相容性检测结果 | 第53页 |
| 4.3.3 不同培养基对复合发酵效果的影响 | 第53-54页 |
| 4.3.4 复合发酵生长曲线及抑菌活性 | 第54-55页 |
| 4.3.5 复合发酵液对土壤中病原真菌数量的影响 | 第55-57页 |
| 4.4 小结 | 第57-58页 |
| 总结 | 第58-60页 |
| 致谢 | 第60-61页 |
| 参考文献 | 第61-66页 |
| 主要科研成果 | 第66页 |
