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脂肪酶SMG1小分子抑制剂的筛选及其激活机制的研究

摘要第5-7页
Abstract第7-9页
缩略符号第13-15页
第一章 绪论第15-22页
    1.1 脂肪酶SMG1的来源及功能第15页
    1.2 脂肪酶SMG1与头屑/脂溢性皮炎(D/SD)的关联第15-18页
    1.3 脂肪酶SMG1在生物催化中的应用和价值第18-19页
    1.4 脂肪酶的激活机制第19-20页
    1.5 本论文研究的目的和意义第20-22页
第二章 实验材料与方法第22-87页
    2.1 实验材料第22-30页
        2.1.1 基因第22页
        2.1.2 菌株和质粒第22页
        2.1.3 试剂和耗材第22-24页
        2.1.4 实验仪器第24-25页
        2.1.5 溶液配制第25-30页
    2.2 实验方法第30-87页
        2.2.1 SMG1突变体基因克隆第30-35页
        2.2.2 蛋白质表达与纯化第35-40页
        2.2.3 同源模建第40-43页
        2.2.4 虚拟筛选第43-44页
        2.2.5 基于酶活性的体外抑制剂筛选第44-66页
        2.2.6 单油酸甘油酯(Monolein)水解活性测定第66-67页
        2.2.7 蛋白质晶体生长及优化实验第67-68页
        2.2.8 X射线晶体结构数据采集和结构解析第68-69页
        2.2.9 蛋白质序列比对第69-74页
        2.2.10 分子对接第74-76页
        2.2.11 分子动力学模拟第76-77页
        2.2.12 PMSF抑制实验第77-78页
        2.2.13 DAG水解活性测定第78页
        2.2.14 微流速液相色谱-电喷雾离子化-串联质谱(Nano LC-ESI-MS/MS)第78-80页
        2.2.15 还原/氧化状态酶的水解活性测定第80-81页
        2.2.16 蛋白质浓度测定第81页
        2.2.17 数据分析第81-87页
第三章 SMG1小分子抑制剂的发现第87-122页
    3.1 SMG1的基因克隆、表达与蛋白纯化第87-88页
    3.2 SMG1开放结构的同源模建第88-94页
    3.3 虚拟筛选第94-105页
    3.4 体外实验筛选第105-115页
        3.4.1 高通量体外筛选体系的建立第105-110页
        3.4.2 初级筛选第110-111页
        3.4.3 IC50测定第111-114页
        3.4.4 抑制模式鉴定第114-115页
        3.4.5 先导化合物的再验证第115页
    3.5 先导化合物的结构-功能关系研究第115-120页
        3.5.1 复合物晶体实验第115-116页
        3.5.2 化合物结构-活性研究及分子对接第116-120页
    3.6 本章小结第120-122页
第四章 SMG1的激活机制(一)第122-133页
    4.1 研究策略第122页
    4.2 SMG1突变体设计第122-124页
    4.3 SMG1 F278N和F278D突变体的结晶实验和结构解析第124-127页
    4.4 SMG1的“门控机制”的验证第127-132页
        4.4.1 F278N晶体结构代表SMG1的开放构象第127-129页
        4.4.2 SMG1野生型中278和 102 残基控制口袋打开第129-131页
        4.4.3 PMSF抑制实验第131-132页
    4.5 基于门控机制的高活性突变体的理性设计第132页
    4.6 本章小结第132-133页
第五章 SMG1的激活机制(二)第133-145页
    5.1 研究策略第133页
    5.2 引入二硫键的突变体设计第133-134页
    5.3 L106C/V233C蛋白的二硫键检测第134-139页
    5.4 SMG1的完全激活需要盖子的构象变化第139-142页
    5.5 L106C/V233C蛋白的应用价值第142-143页
    5.6 本章小结第143-145页
结论第145-147页
参考文献第147-153页
攻读博士学位期间取得的研究成果第153-155页
致谢第155-156页
答辩委员会对论文的评定意见第156页

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