东北虎源消化道病毒宏基因组学分析
| 摘要 | 第6-7页 |
| Abstract | 第7-8页 |
| 英文缩略表 | 第11-12页 |
| 第一章 引言 | 第12-20页 |
| 1.1 未知病毒检测方法 | 第12-13页 |
| 1.1.1 随机PCR | 第12页 |
| 1.1.2 基于保守序列的PCR扩增技术 | 第12页 |
| 1.1.3 表达cDNA文库方法 | 第12页 |
| 1.1.4 滚环复制技术 | 第12-13页 |
| 1.1.5 不依赖序列的单引物扩增 | 第13页 |
| 1.1.6 代表性差异分析法（RDA） | 第13页 |
| 1.1.7 基因芯片技术 | 第13页 |
| 1.2 宏基因组学 | 第13-16页 |
| 1.2.1 宏基因组学概述 | 第13-14页 |
| 1.2.2 病毒宏基因组学 | 第14页 |
| 1.2.3 高通量测序在宏基因组研究中的应用 | 第14-15页 |
| 1.2.4 病毒宏基因组研究材料选择 | 第15-16页 |
| 1.3 虎源病毒性疾病 | 第16-19页 |
| 1.3.1 猫泛白细胞减少症病毒 | 第16-17页 |
| 1.3.2 猫杯状病毒 | 第17页 |
| 1.3.3 流感病毒 | 第17-18页 |
| 1.3.4 犬瘟热病毒 | 第18页 |
| 1.3.5 其他虎源病毒 | 第18-19页 |
| 1.4 研究的目的和意义 | 第19-20页 |
| 第二章 东北虎源粪便病毒宏基因组学分析 | 第20-28页 |
| 2.1 材料 | 第20-21页 |
| 2.1.1 样品 | 第20页 |
| 2.1.2 试剂 | 第20页 |
| 2.1.3 仪器设备 | 第20页 |
| 2.1.4 引物 | 第20-21页 |
| 2.2 方法 | 第21-24页 |
| 2.2.1 样品处理 | 第21页 |
| 2.2.2 病毒DNA和RNA的提取 | 第21页 |
| 2.2.3 依赖于锚定随机引物的反转录 | 第21-22页 |
| 2.2.4 依赖于锚定随机引物的双链DNA合成 | 第22页 |
| 2.2.5 不依赖序列的单引物扩增（SISPA） | 第22-23页 |
| 2.2.6 PCR产物的浓缩纯化 | 第23页 |
| 2.2.7 高通量测序 | 第23-24页 |
| 2.3 结果 | 第24-25页 |
| 2.3.1 样品检测 | 第24页 |
| 2.3.2 高通量测序 | 第24-25页 |
| 2.4 讨论 | 第25-28页 |
| 第三章 宏基因组测序结果的验证及分析 | 第28-48页 |
| 3.1 材料 | 第28-29页 |
| 3.1.1 试剂与细胞 | 第28页 |
| 3.1.2 主要仪器 | 第28页 |
| 3.1.3 引物 | 第28-29页 |
| 3.2 FPV的验证 | 第29-32页 |
| 3.2.1 分离培养 | 第29-30页 |
| 3.2.2 PCR检测 | 第30页 |
| 3.2.3 电镜观察 | 第30页 |
| 3.2.4 直接免疫荧光 | 第30页 |
| 3.2.5 VP2基因克隆测序及序列分析 | 第30-32页 |
| 3.2.6 全基因组克隆测序及序列分析 | 第32页 |
| 3.3 FCV验证 | 第32-35页 |
| 3.3.1 分离培养 | 第32-33页 |
| 3.3.2 RT-PCR检测 | 第33-34页 |
| 3.3.3 电镜观察 | 第34页 |
| 3.3.4 IFA | 第34页 |
| 3.3.5 全基因组测序及序列分析 | 第34-35页 |
| 3.5 结果 | 第35-45页 |
| 3.5.1 FPV的验证 | 第35-41页 |
| 3.5.2 FCV的验证 | 第41-45页 |
| 3.6 讨论 | 第45-48页 |
| 第四章 全文结论 | 第48-49页 |
| 参考文献 | 第49-54页 |
| 附录 | 第54-59页 |
| 致谢 | 第59-60页 |
| 作者简历 | 第60页 |
