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苹果IAA代谢几个关键基因在矮化砧木与miRNA在短枝品种中致矮作用研究

摘要第5-7页
Abstract第7-9页
第一章文献综述第13-26页
    1.1 苹果矮化砧木种质资源与致矮机理研究进展第13-18页
        1.1.1 矮化砧木种质资源第13-16页
        1.1.2 苹果砧木致矮机理研究进展第16-18页
            1.1.2.1 树体发育与矮化第16页
            1.1.2.2 激素与砧木生长势的关系第16-18页
    1.2 植物体内生长素代谢第18-21页
    1.3 苹果短枝型研究进展第21-25页
    1.4 本论文的研究目的意义第25-26页
第二章生长素合成、运输和代谢基因在苹果砧木中表达分析第26-54页
    2.1 材料和方法第26-30页
        2.1.1 材料第26页
        2.1.2 采样第26页
        2.1.3 树体生长指标测定第26页
        2.1.4 生长素测定第26-27页
        2.1.5 RNA提取及反转录第27-28页
        2.1.6 苹果基因组中生长素相关基因确定第28-29页
        2.1.7 基因表达量测定第29页
        2.1.8 GH3酶活性测定第29-30页
        2.1.9 基因表达聚类分析第30页
        2.1.10 数据处理与分析第30页
    2.2 结果与分析第30-52页
        2.2.1 株高和根系生长量第30-31页
        2.2.2 生长素含量第31-32页
        2.2.3 苹果生长素合成基因MdYUCCA基因鉴定及表达分析第32-36页
        2.2.4 苹果生长素运输基因MdPIN基因鉴定及表达分析第36-40页
        2.2.5 苹果生长素轭合酶基因MdGH3鉴定及表达分析第40-46页
        2.2.6 苹果生长素轭合物水解酶基因MdILR基因家族鉴定及表达分析第46-51页
        2.2.7 生长素含量和生长素代谢基因表达量聚类分析第51-52页
    2.3 讨论第52-54页
第三章 MdYUCCA8和MdYUCCA10a克隆及功能分析第54-75页
    3.1 材料和方法第54-58页
        3.1.1 基因克隆第54页
        3.1.2 蛋白质保守结构域分析和进化分析第54页
        3.1.3 启动子GUS染色及测定第54-56页
        3.1.4 农杆菌感受态细胞的制备第56页
        3.1.5 农杆菌的转化第56页
        3.1.6 烟草双荧光素酶瞬时表达第56-57页
        3.1.7 拟南芥种植第57页
        3.1.8 拟南芥转基因第57-58页
    3.2 结果与分析第58-73页
        3.2.1 MdYUCCA8和MdYUCCA10a基因克隆第58-59页
        3.2.2 MdYUCCA8和MdYUCCA10a基因启动子克隆及顺式作用元件分析第59-66页
        3.2.3 MdYUCCA8和MdYUCCA10a基因启动子对外源激素响应第66页
        3.2.4 温度对M9苹果苗生长的影响第66-69页
        3.2.5 双荧光素酶瞬时表达验证MdYUCCA8启动子和MdPIF4a在烟草叶片中的相互作用第69-70页
        3.2.6 拟南芥中异位表达MdYUCCA8和MdYUCCA10a表型观察第70-73页
    3.3 讨论第73-75页
第四章 苹果生长素运输基因MdABCB19克隆及其在矮化砧木中的表达第75-88页
    4.1 材料和方法第75-77页
        4.1.1 材料第75页
        4.1.2 MdABCB19的克隆第75页
        4.1.3 氨基酸序列同源性及蛋白质三级结构分析第75-76页
        4.1.4 MdABCB19的表达分析与生长素含量测定第76页
        4.1.5 MdABCB19启动子克隆及顺式作用元件分析第76页
        4.1.6 MdABCB19启动子活性分析第76-77页
    4.2 结果与分析第77-85页
        4.2.1 MdABCB19的组织表达第77-78页
        4.2.2 长富2号/M9和长富2号/MM106中MdABCB19的表达第78页
        4.2.3 MdABCB19的分离与序列分析第78页
        4.2.4 MdABCB19启动子的克隆与分析第78-80页
        4.2.5 M9和MM106 ABCB19启动子活性分析第80-85页
    4.3 讨论第85-88页
第五章 长富2号及短枝芽变烟富6号miRNA组分析第88-120页
    5.1 材料和方法第88-90页
        5.1.1 植物材料第88页
        5.1.2 树体生长测量第88页
        5.1.3 激素测定第88页
        5.1.4 GA处理第88页
        5.1.5 miRNA测序样品制备第88-89页
        5.1.6 miRNA鉴定第89-90页
        5.1.7 miRNA靶基因预测第90页
        5.1.8 GO富集和KEGG途径分析第90页
        5.1.9 miRNA和mRNA的荧光定量PCR验证第90页
    5.2 结果与分析第90-117页
        5.2.1 长富2号和烟富6号的生长特性第90页
        5.2.2 植物激素含量第90-92页
        5.2.3 长富2号和烟富6号中miRNA测序数据质量分析第92-98页
        5.2.4 差异表达miRNA的分析第98-99页
        5.2.5 miRNA靶基因预测第99-107页
        5.2.6 长富2号和烟富6号中miRNA靶基因GO和KEGG分析第107-111页
        5.2.7 长富2号和烟富6号中参与SAM发育相关miRNA及其靶基因定量验证第111-112页
        5.2.8 长富2号和烟富6号中参与节间伸长相关miRNA及其靶基因定量验证第112-113页
        5.2.9 烟富6号和长富2号中其它差异miRNA及其靶基因的表达验证第113页
        5.2.10 细胞周期和细胞伸长相关基因的表达第113-114页
        5.2.11 激素相关基因表达第114-116页
        5.2.12 GA对枝条生长和miRNA表达的影响第116-117页
    5.3 讨论第117-120页
第六章 结论与创新点第120-121页
    6.1 结论第120页
    6.2 主要创新点第120-121页
参考文献第121-130页
附录第130-134页
致谢第134-135页
作者简介第135-136页

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