| 中文摘要 | 第8-11页 |
| Abstract | 第11-14页 |
| 英文缩写一览表 | 第15-16页 |
| 前言 | 第16-18页 |
| 第一部分 新分离盖塔病毒的分子特征研究 | 第18-44页 |
| 第一节 新分离盖塔病毒生物学表型分析 | 第18-27页 |
| 1 实验材料 | 第19-21页 |
| 1.1 病毒与细胞株 | 第19页 |
| 1.2 主要试剂 | 第19页 |
| 1.3 主要试剂配制 | 第19-20页 |
| 1.4 主要仪器 | 第20-21页 |
| 2 实验方法 | 第21-23页 |
| 2.1 BHK-21 细胞培养 | 第21页 |
| 2.2 病毒株的复苏 | 第21页 |
| 2.3 病变观察 | 第21页 |
| 2.4 电镜观察 | 第21-22页 |
| 2.5 病毒增值 | 第22页 |
| 2.6 空斑形成实验 | 第22-23页 |
| 3 结果 | 第23-26页 |
| 3.1 病毒株的病变观察 | 第23-24页 |
| 3.2 病毒形态观察 | 第24页 |
| 3.3 病毒空斑特征 | 第24-25页 |
| 3.4 病毒生长曲线 | 第25-26页 |
| 4 讨论 | 第26-27页 |
| 5 小结 | 第27页 |
| 第二节 新分离盖塔病毒（YN12031）分子遗传学特性分析 | 第27-44页 |
| 1 实验试剂和材料 | 第27-28页 |
| 1.1 分子生物学试剂 | 第27-28页 |
| 1.2 主要仪器 | 第28页 |
| 2 实验方法 | 第28-32页 |
| 2.1 病毒RNA的提取 | 第28-29页 |
| 2.2 病毒RNA的逆转录 | 第29页 |
| 2.3 引物设计 | 第29-30页 |
| 2.4 病毒基因的PCR扩增 | 第30-31页 |
| 2.5 PCR产物的纯化 | 第31页 |
| 2.6 序列测定 | 第31页 |
| 2.7 序列分析 | 第31-32页 |
| 3 实验结果 | 第32-42页 |
| 3.1 盖塔病毒（YN12031）各基因片段的扩增结果 | 第32页 |
| 3.2 盖塔病毒（YN12031）全基因组序列 | 第32-33页 |
| 3.3 本研究引用的其它盖塔病毒分离株的背景信息 | 第33-34页 |
| 3.4 GETV全基因组序列分析 | 第34-36页 |
| 3.5 YN12031病毒分离株编码区基因核苷酸和氨基酸同源性分析 | 第36页 |
| 3.6 YN12031病毒分离株Capsid基因核苷酸和氨基酸同源性分析 | 第36-39页 |
| 3.7 YN12031病毒分离株E2基因核苷酸和氨基酸同源性分析 | 第39页 |
| 3.8 YN12031病毒分离株系统进化分析 | 第39-42页 |
| 4 讨论 | 第42-43页 |
| 5 小结 | 第43-44页 |
| 第二部分 盖塔病毒的时空动力学分析 | 第44-65页 |
| 第一节 盖塔病毒分布研究及基因序列分析数据集的构建 | 第44-50页 |
| 1 实验材料 | 第44-45页 |
| 1.1 细胞株与病毒 | 第44页 |
| 1.2 DNAStar软件 | 第44-45页 |
| 1.3 ClustalX 2.0.9软件 | 第45页 |
| 1.4 Bioedit软件 | 第45页 |
| 1.5 Mega 6.06 软件 | 第45页 |
| 2 实验方法 | 第45-47页 |
| 2.1 细胞培养及毒株复苏 | 第45-46页 |
| 2.2 病毒核酸提取和cDNA制备 | 第46页 |
| 2.3 盖塔病毒基因序列扩增和测定 | 第46页 |
| 2.4 盖塔病毒序列整理和数据集构建 | 第46-47页 |
| 3 实验结果 | 第47-49页 |
| 3.1 GETV YN12042病毒株的全基因组序列 | 第48页 |
| 3.2 GETV分析数据集的时间和地域分布 | 第48页 |
| 3.3 GETV分析数据集的宿主媒介分布 | 第48-49页 |
| 4 讨论 | 第49-50页 |
| 5 小结 | 第50页 |
| 第二节 盖塔病毒的种群特征和时空动力学分析 | 第50-65页 |
| 1 实验材料 | 第51-53页 |
| 1.1 DNAStar软件, ClustalX 2.0.9, Bioedit, Mega 6.06软件 | 第51页 |
| 1.2 Gene Doc软件 | 第51页 |
| 1.3 BEAST v1.7.2软件 | 第51-52页 |
| 1.4 Tracer v1.5软件 | 第52页 |
| 1.5 FigTree v1.3.1软件 | 第52页 |
| 1.6 Google Earth v6.02 | 第52页 |
| 1.7 SWISS-MODEL online server | 第52页 |
| 1.8 VMD software | 第52页 |
| 1.9 YASARA softwares | 第52-53页 |
| 2 实验方法 | 第53-54页 |
| 2.1 盖塔病毒数据集的序列分析 | 第53页 |
| 2.2 系统进化及种群动态分析 | 第53页 |
| 2.3 空间动力学分析 | 第53页 |
| 2.4 氨基酸结构分析 | 第53-54页 |
| 3 实验结果 | 第54-61页 |
| 3.1 GETV E2基因同源性分析 | 第54页 |
| 3.2 GETV E2基因氨基酸差异分析 | 第54-57页 |
| 3.3 GETV E2蛋白的三维结构分析 | 第57-58页 |
| 3.4 具有时间尺度的盖塔病毒分子遗传进化分析 | 第58-59页 |
| 3.5 盖塔病毒种群动态分析 | 第59-61页 |
| 3.6 盖塔病毒的空间动力学分析 | 第61页 |
| 4 讨论 | 第61-64页 |
| 5 小结 | 第64-65页 |
| 第三部分 GETV的血清流行病学研究 | 第65-73页 |
| 1 实验材料 | 第65页 |
| 1.1 细胞和病毒 | 第65页 |
| 1.2 血清 | 第65页 |
| 1.3 实验试剂 | 第65页 |
| 1.4 实验仪器 | 第65页 |
| 2 实验方法 | 第65-66页 |
| 1.1 GETV的复苏、滴定 | 第65-66页 |
| 1.2 GETV的空斑减少中和实验 | 第66页 |
| 3 实验结果 | 第66-69页 |
| 3.1 盖塔病毒在人群中的抗体检测结果 | 第66-67页 |
| 3.2 盖塔病毒在动物中的抗体检测结果 | 第67-69页 |
| 4 讨论 | 第69-72页 |
| 5 小结 | 第72-73页 |
| 参考文献 | 第73-80页 |
| 综述 | 第80-91页 |
| 参考文献 | 第87-91页 |
| 致谢 | 第91-93页 |
| 个人简历 | 第93-95页 |
