| 致谢 | 第6-8页 |
| 芙文缩写词表 | 第8-12页 |
| 摘要 | 第12-14页 |
| Abstract | 第14-15页 |
| 1 绪论 | 第16-35页 |
| 1.1 硝酸及亚硝酸代谢过程 | 第16-18页 |
| 1.2 S.oneidensis无氧呼吸网络研究现状 | 第18-22页 |
| 1.3 细胞色素c成熟机制 | 第22-32页 |
| 1.3.1 细胞色素c蛋白 | 第22-23页 |
| 1.3.2 细胞色素c成熟过程 | 第23-25页 |
| 1.3.3 Ccm系统 | 第25-30页 |
| 1.3.4 S.oneidensis的Ccm系统 | 第30-32页 |
| 1.4 本研究的背景、主要内容及意义 | 第32-35页 |
| 2. S.oneidensis呼吸替补通路的研究 | 第35-56页 |
| 2.1 材料和方法 | 第35-40页 |
| 2.1.1 菌株、质粒和培养条件 | 第35-37页 |
| 2.1.2 框内缺失突变株的构建和回补 | 第37页 |
| 2.1.3 化学检测 | 第37-38页 |
| 2.1.4 醌提取和定量 | 第38页 |
| 2.1.5 S.oneidensis无标记的整合报告基因系统的构建 | 第38页 |
| 2.1.6 基因表达分析 | 第38-39页 |
| 2.1.7 S.oneidensis Crp和ArcA表达纯化以及EMSA | 第39-40页 |
| 2.2 结果与分析 | 第40-52页 |
| 2.2.1 筛选硝酸和亚硝酸呼吸通路中CymA的功能替代物 | 第40-42页 |
| 2.2.2 细胞色素bc_1是硝酸和亚硝酸呼吸通路中CymA的功能替代物 | 第42-43页 |
| 2.2.3 缺失细胞色素bc_1可能导致流向CymA的电子流增大 | 第43-46页 |
| 2.2.4 UQ和MK均可作为CymA和细胞色素bc_1的电子供体 | 第46-47页 |
| 2.2.5 细胞色素bc_1不参与其它EAs的呼吸通路 | 第47-48页 |
| 2.2.6 细胞色素bc_1的表达受氧气而非硝酸或亚硝酸的诱导 | 第48-49页 |
| 2.2.7 细胞色素bc_1的表达受Crp和ArcA间接调控 | 第49-52页 |
| 2.3 讨论 | 第52-56页 |
| 2.3.1 细胞色素bc_1是硝酸和亚硝酸呼吸通路中CymA的部分功能替代物 | 第53-54页 |
| 2.3.2 细胞色素bc_1表达调控机制 | 第54-56页 |
| 3 Ccm系统组分CcmI在典型细胞色素c成熟过程的功能研究 | 第56-69页 |
| 3.1 材料和方法 | 第57-59页 |
| 3.1.1 菌株、质粒和培养条件 | 第57-58页 |
| 3.1.2 框内缺失突变株的构建和回补 | 第58页 |
| 3.1.3 化学检测 | 第58页 |
| 3.1.4 酶活性测定 | 第58页 |
| 3.1.5 Heme staining | 第58-59页 |
| 3.1.6 Nadi实验 | 第59页 |
| 3.2 结果与分析 | 第59-66页 |
| 3.2.1 缺失SO0265(CcmI)对不同EAs呼吸的影响 | 第59-63页 |
| 3.2.2 S.oneidensis CcmI不同于其同源物 | 第63-64页 |
| 3.2.3 CcmI-1和CcmI-2在典型细胞色素c成熟过程中功能不同 | 第64-66页 |
| 3.3 讨论 | 第66-69页 |
| 4 CcmI在非典型细胞色素c成熟过程的功能研究 | 第69-85页 |
| 4.1 材料与方法 | 第70-73页 |
| 4.1.1 菌株、质粒和培养条件 | 第70-71页 |
| 4.1.2 框内缺失突变株的构建和回补、定点突变菌株的构建 | 第71页 |
| 4.1.3 化学检测 | 第71页 |
| 4.1.4 酶活性检测 | 第71-72页 |
| 4.1.5 SDS-PAGE和免疫印迹 | 第72页 |
| 4.1.6 蛋白质纯化和pull-down实验 | 第72-73页 |
| 4.1.7 氨苄青霉素敏感性实验 | 第73页 |
| 4.1.8 表达情况分析 | 第73页 |
| 4.1.9 生物信息学和数据分析 | 第73页 |
| 4.2 结果与分析 | 第73-82页 |
| 4.2.1 NrfA的成熟依赖于完整的CcmI | 第73-75页 |
| 4.2.2 S.oneidensis可能没有NrfA特异性裂合酶 | 第75-76页 |
| 4.2.3 CcmI-2与NrfA的C端相互作用 | 第76-79页 |
| 4.2.4 Heme共价结合的及时完成保证NrfA的蛋白稳定性 | 第79-82页 |
| 4.3 讨论 | 第82-85页 |
| 4.3.1 Ccm系统中的apocyt c分子伴侣 | 第82-83页 |
| 4.3.2 非典型细胞色素c中特异性裂合酶识别的特征 | 第83-84页 |
| 4.3.3 S.oneidensis NrfA可能没有特异性的裂合酶 | 第84-85页 |
| 5 论文总结 | 第85-90页 |
| 5.1 主要研究成果 | 第85-87页 |
| 5.2 创新之处 | 第87-88页 |
| 5.3 不足和展望 | 第88-90页 |
| 参考文献 | 第90-109页 |
| 附录 | 第109-111页 |
| 作者简介 | 第111-112页 |
