| 摘要 | 第5-6页 |
| Abstrct | 第6-7页 |
| 英文缩略词表 | 第8-9页 |
| 第一章 绪论 | 第9-20页 |
| 1.1 日本脑炎病毒 | 第9-12页 |
| 1.1.1 世界乙型脑炎流行情况 | 第9页 |
| 1.1.2 我国乙型脑炎流行情况 | 第9页 |
| 1.1.3 JEV传播途径 | 第9页 |
| 1.1.4 JEV的感染与发病 | 第9-10页 |
| 1.1.5 JEV基因组 | 第10-11页 |
| 1.1.6 JEV分型 | 第11页 |
| 1.1.7 JEV的生命周期 | 第11-12页 |
| 1.2 哺乳动物非折叠蛋白反应研究进展 | 第12-18页 |
| 1.2.1 折叠循环、质量控制、ER相关的降解（ERAD） | 第12-14页 |
| 1.2.2 PERK通路 | 第14-15页 |
| 1.2.3 ATF6途径 | 第15-16页 |
| 1.2.4 IRE1通路 | 第16-18页 |
| 1.3 ER导致的自噬和凋亡 | 第18-20页 |
| 第二章 JEV诱导内质网应激反应及细胞凋亡 | 第20-33页 |
| 2.1 前言 | 第20页 |
| 2.2 试验材料 | 第20-22页 |
| 2.2.1 细胞系材料 | 第20页 |
| 2.2.2 病毒株材料 | 第20页 |
| 2.2.3 试剂 | 第20-22页 |
| 2.3 试验方法 | 第22-28页 |
| 2.3.1 细胞培养和病毒扩增、滴度测定 | 第22-23页 |
| 2.3.2 病毒、药物处理细胞试验 | 第23页 |
| 2.3.3 RT-PCR | 第23-26页 |
| 2.3.4 Western blot | 第26-28页 |
| 2.3.5 细胞增殖与细胞毒检测（MTT法） | 第28页 |
| 2.4 试验结果 | 第28-31页 |
| 2.4.1 乙脑病毒感染诱导GRP78，ATF4转录水平升高。 | 第28-29页 |
| 2.4.2 乙脑病毒感染诱导XBP1 mRNA拼接 | 第29-30页 |
| 2.4.3 乙脑病毒感染诱导GRP78， chop蛋白水平升高和ATF6剪切 | 第30页 |
| 2.4.4 乙脑病毒感染和内质网应激反应激活诱导BHK-21细胞病变和活力降低 | 第30-31页 |
| 2.5 讨论 | 第31-33页 |
| 第三章 RNA-seq技术研究JEV引起的细胞内基因表达水平变化 | 第33-48页 |
| 3.1 前言 | 第33页 |
| 3.2 实验材料 | 第33页 |
| 3.2.1 细胞系材料 | 第33页 |
| 3.2.2 病毒株材料 | 第33页 |
| 3.2.3 试剂： | 第33页 |
| 3.3 实验方法 | 第33-36页 |
| 3.3.1 细胞培养等 | 第33页 |
| 3.3.2 病毒、药物处理细胞试验 | 第33页 |
| 3.3.3 RNA提取 | 第33-34页 |
| 3.3.4 送样测序 | 第34-36页 |
| 3.4 实验结果 | 第36-47页 |
| 3.4.1 RNA样品质量满足建库测序要求 | 第36-38页 |
| 3.4.2 得到可靠测序数据 | 第38页 |
| 3.4.3 比对参考基因组 | 第38-39页 |
| 3.4.4 各组基因表达水平差异 | 第39-40页 |
| 3.4.5 差异基因表达分析 | 第40-47页 |
| 3.5 讨论 | 第47-48页 |
| 第四章 JEV通过内质网IRE1/JNK信号通路诱导细胞凋亡 | 第48-59页 |
| 4.1 前言 | 第48页 |
| 4.2 实验材料 | 第48-49页 |
| 4.2.1 细胞系材料 | 第48页 |
| 4.2.2 病毒株材料 | 第48页 |
| 4.2.3 试剂 | 第48-49页 |
| 4.3 实验方法 | 第49-54页 |
| 4.3.1 细胞培养 | 第49页 |
| 4.3.2 细胞的处理 | 第49页 |
| 4.3.3 细胞增殖与细胞毒检测（MTT法） | 第49-50页 |
| 4.3.4 细胞流式实验 | 第50页 |
| 4.3.5 western blot实验 | 第50页 |
| 4.3.6 磷酸化western blot实验 | 第50-51页 |
| 4.3.7 RT-PCR | 第51-53页 |
| 4.3.8 TCID50 | 第53页 |
| 4.3.9 统计分析 | 第53-54页 |
| 4.4 实验结果 | 第54-57页 |
| 4.4.1 IRE1抑制剂、JNK激酶抑制剂处理接毒后的细胞能显著减少细胞凋亡的发生 | 第54-55页 |
| 4.4.2 IRE1抑制剂处理使接毒细胞内CHOP、caspsase 3 和磷酸化IRE1蛋白水平下降 | 第55-56页 |
| 4.4.3 药物处理对JEV复制没有影响 | 第56-57页 |
| 4.5 讨论 | 第57-59页 |
| 在校期间完成的其他工作 | 第59-60页 |
| 参考文献 | 第60-67页 |
| 致谢 | 第67-68页 |
| 在校期间论文发表情况 | 第68页 |
