| 主要缩略词表 | 第5-6页 |
| 中文摘要 | 第6-9页 |
| 英文摘要 | 第9-12页 |
| 前言 | 第13-19页 |
| 第一章 Discovery Studio软件抗体分子建模准确度分析 | 第19-27页 |
| 第一节 方法 | 第19-21页 |
| 第二节 结果 | 第21-25页 |
| 2.1 测试集选取 | 第21-22页 |
| 2.2 抗原抗体柔性分析 | 第22-23页 |
| 2.3 抗体建模准确度评估 | 第23-25页 |
| 2.4 比较抗体建模准确程度与抗体柔性之间的关系 | 第25页 |
| 第三节 讨论 | 第25-27页 |
| 第二章 Residue Contact Frequency算法实现及优化 | 第27-39页 |
| 第一节 方法 | 第27-33页 |
| 第二节 结果 | 第33-37页 |
| 2.1 抗原抗体夹角θ的分布 | 第33-34页 |
| 2.2 计算PR曲线 | 第34页 |
| 2.3 RCF算法及3个优化算法预测结果 | 第34-36页 |
| 2.4 RCF预测8A7抗体表位 | 第36页 |
| 2.5 RCF预测22F1抗体表位 | 第36-37页 |
| 第三节 讨论 | 第37-39页 |
| 第三章 鼠疫F1抗体F2H5表位预测及验证 | 第39-77页 |
| 第一节 材料与方法 | 第39-54页 |
| 第二节 结果 | 第54-75页 |
| 2.1 F2H5与F1的结合及实验鉴定表位 | 第54-55页 |
| 2.2 RCF优化算法预测F2H5表位 | 第55-60页 |
| 2.3 实验验证预测表位 | 第60-64页 |
| 2.4 模拟F1-F2H5复合物结构 | 第64-67页 |
| 2.5 F2H5配位预测及亲和力增强株的获得 | 第67-75页 |
| 第三节 讨论 | 第75-77页 |
| 第四章 结论 | 第77-79页 |
| 参考文献 | 第79-83页 |
| 附录 | 第83-102页 |
| 个人简介 | 第102-103页 |
| 致谢 | 第103页 |