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杂交盘羊尾部抑制性消减文库的构建与转录组初步分析

摘要第1-7页
Abstract第7-8页
缩略词第8-11页
引言第11-12页
第一章 文献综述第12-21页
 1 m RNA差异显示法第12页
   ·m RNA差异显示法的优点第12页
   ·m RNA差异显示法的缺点第12页
 2 c DNA代表性差异分析(c DNA-RDA)第12-13页
   ·c DNA-RDA的原理和方法第12-13页
   ·c DNA-RDA的优点和缺点第13页
 3 基因表达系列分析(SAGE)第13页
   ·SAGE的原理与实验流程第13页
   ·SAGE技术的优缺点第13页
 4 抑制性消减杂交技术(SSH)第13-16页
   ·SSH的原理与操作第13-15页
   ·SSH的优点与缺点第15页
   ·SSH技术应用进展第15-16页
 5 转录组测序技术及其应用第16-20页
   ·转录组历史第16页
   ·转录组学第16页
   ·转录组技术第16-18页
     ·EST和基因芯片第17页
     ·新一代测序技术第17-18页
     ·RNA-seq第18页
     ·RNA-seq技术的发展第18页
   ·转录组测序的应用第18-20页
 6 研究的目的与意义第20-21页
第二章 试验研究第21-49页
 试验一 杂交盘羊尾部组织抑制性消减文库的构建与分析第21-38页
  1. 材料与方法第21-30页
   ·试验材料第21-22页
     ·样品的采集第21页
     ·试验试剂第21页
     ·质粒及菌种第21页
     ·实验仪器设备第21-22页
   ·方法第22-30页
     ·杂交盘羊尾部组织总RNA提取第22页
     ·m RNA分离纯化第22-23页
     ·抑制性消减杂交第23-30页
  2. 结果第30-36页
   ·杂交盘羊总RNA提取、纯化与检测第30页
   ·酶切第30-31页
   ·接头连接效率的检测第31-32页
   ·消减二次PCR扩增产物第32页
   ·消减效率检测第32-33页
   ·消减c DNA文库的扩增及初步鉴定第33-34页
   ·消减杂交文库差异表达基因生物信息学分析第34-36页
  3. 讨论与结论第36-37页
   ·文库构建分析第36-37页
     ·RNA结果分析第36页
     ·酶切分析第36页
     ·接头的连接效率第36页
     ·PCR产物分析第36-37页
   ·差异基因分析第37页
  4 小结第37-38页
 试验二 转录组测序分析第38-49页
  1. 材料与方法第38-40页
   ·试验材料第38页
     ·试验动物第38页
   ·RNA提取第38页
   ·杂交盘羊尾部的转录组测序流程第38-39页
   ·转录组数据分析第39-40页
  2 转录组测序结果第40-46页
   ·杂交盘羊尾部组织RNA-seq转录组数据拼接及注释结果第40-43页
     ·杂交盘羊RNA-seq转录组数据拼接结果第40页
     ·杂交盘羊尾部组织Unigene的Nr注释结果第40-41页
     ·杂交盘羊尾部组织Unigene的GO注释结果第41-43页
     ·杂交盘羊尾部组织Unigene的KEGG富集分析第43页
   ·杂交盘羊尾部组织差异表达基因的GO功能分析第43-44页
   ·杂交盘羊尾部组织差异表达基因Unigene的KEGG富集分析第44页
   ·杂交盘羊尾部组织差异基因表达分析第44-46页
   ·差选T-box家族基因第46页
  3 讨论第46-48页
  4 小结第48-49页
全文结论第49-50页
参考文献第50-55页
致谢第55-56页
作者简介第56-57页
附件第57页

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