摘要 | 第1-7页 |
Abstract | 第7-8页 |
缩略词 | 第8-11页 |
引言 | 第11-12页 |
第一章 文献综述 | 第12-21页 |
1 m RNA差异显示法 | 第12页 |
·m RNA差异显示法的优点 | 第12页 |
·m RNA差异显示法的缺点 | 第12页 |
2 c DNA代表性差异分析(c DNA-RDA) | 第12-13页 |
·c DNA-RDA的原理和方法 | 第12-13页 |
·c DNA-RDA的优点和缺点 | 第13页 |
3 基因表达系列分析(SAGE) | 第13页 |
·SAGE的原理与实验流程 | 第13页 |
·SAGE技术的优缺点 | 第13页 |
4 抑制性消减杂交技术(SSH) | 第13-16页 |
·SSH的原理与操作 | 第13-15页 |
·SSH的优点与缺点 | 第15页 |
·SSH技术应用进展 | 第15-16页 |
5 转录组测序技术及其应用 | 第16-20页 |
·转录组历史 | 第16页 |
·转录组学 | 第16页 |
·转录组技术 | 第16-18页 |
·EST和基因芯片 | 第17页 |
·新一代测序技术 | 第17-18页 |
·RNA-seq | 第18页 |
·RNA-seq技术的发展 | 第18页 |
·转录组测序的应用 | 第18-20页 |
6 研究的目的与意义 | 第20-21页 |
第二章 试验研究 | 第21-49页 |
试验一 杂交盘羊尾部组织抑制性消减文库的构建与分析 | 第21-38页 |
1. 材料与方法 | 第21-30页 |
·试验材料 | 第21-22页 |
·样品的采集 | 第21页 |
·试验试剂 | 第21页 |
·质粒及菌种 | 第21页 |
·实验仪器设备 | 第21-22页 |
·方法 | 第22-30页 |
·杂交盘羊尾部组织总RNA提取 | 第22页 |
·m RNA分离纯化 | 第22-23页 |
·抑制性消减杂交 | 第23-30页 |
2. 结果 | 第30-36页 |
·杂交盘羊总RNA提取、纯化与检测 | 第30页 |
·酶切 | 第30-31页 |
·接头连接效率的检测 | 第31-32页 |
·消减二次PCR扩增产物 | 第32页 |
·消减效率检测 | 第32-33页 |
·消减c DNA文库的扩增及初步鉴定 | 第33-34页 |
·消减杂交文库差异表达基因生物信息学分析 | 第34-36页 |
3. 讨论与结论 | 第36-37页 |
·文库构建分析 | 第36-37页 |
·RNA结果分析 | 第36页 |
·酶切分析 | 第36页 |
·接头的连接效率 | 第36页 |
·PCR产物分析 | 第36-37页 |
·差异基因分析 | 第37页 |
4 小结 | 第37-38页 |
试验二 转录组测序分析 | 第38-49页 |
1. 材料与方法 | 第38-40页 |
·试验材料 | 第38页 |
·试验动物 | 第38页 |
·RNA提取 | 第38页 |
·杂交盘羊尾部的转录组测序流程 | 第38-39页 |
·转录组数据分析 | 第39-40页 |
2 转录组测序结果 | 第40-46页 |
·杂交盘羊尾部组织RNA-seq转录组数据拼接及注释结果 | 第40-43页 |
·杂交盘羊RNA-seq转录组数据拼接结果 | 第40页 |
·杂交盘羊尾部组织Unigene的Nr注释结果 | 第40-41页 |
·杂交盘羊尾部组织Unigene的GO注释结果 | 第41-43页 |
·杂交盘羊尾部组织Unigene的KEGG富集分析 | 第43页 |
·杂交盘羊尾部组织差异表达基因的GO功能分析 | 第43-44页 |
·杂交盘羊尾部组织差异表达基因Unigene的KEGG富集分析 | 第44页 |
·杂交盘羊尾部组织差异基因表达分析 | 第44-46页 |
·差选T-box家族基因 | 第46页 |
3 讨论 | 第46-48页 |
4 小结 | 第48-49页 |
全文结论 | 第49-50页 |
参考文献 | 第50-55页 |
致谢 | 第55-56页 |
作者简介 | 第56-57页 |
附件 | 第57页 |