猪CAST基因多态性分析及发育性表达研究

【摘要】：CAST基因被认为是影响肉质性状的候选基因,本试验从基因多态性水平和基因表达水平研究不同猪种CAST基因第2内含子和外显子9的多态性分布,以及CAST基因在马身猪和大白猪背最长肌组织中的表达分析,以期为马身猪优良肉质遗传分子机理提供理论基础。猪CAST基因第2内含子中存在以GT为核心序列的微卫星座位。本试验检测了5个猪种(马身猪、山西黑猪、大白猪、长白猪、杜洛克猪)共227个个体在该座位的遗传多态性,检测到4个等位基因：A(171bp)、B(179bp)、C(185bp)、D(191bp)。所检测的猪群体中,马身猪群体以B等位基因为主(基因频率为0.6310),山西黑猪和杜洛克猪群体以D等位基因为主(基因频率分别为0.6389和0.5143),长白猪和大白猪群体中4种基因频率相近。所选择的猪群体中,共有10种基因型被检测到,大白猪和长白猪群体的基因型以纯合子为主,遗传纯合度分别为0.7037和0.6667。马身猪和山西黑猪群体的基因型以杂合子为主,遗传杂合度分别为0.5476和0.6111。采用PCR-SSCP技术检测了杜洛克猪、大白猪、长白猪、晋汾白猪、山西黑猪和马身猪6个品种共416头个体的CAST基因第9外显子的多态性,检测到A、B、C、D、E、F和G共7种单倍型。在马身猪群体中,以A单倍型为主；杜洛克猪群体中,以A、B单倍型为主;大白猪和山西黑猪群体中,以A、B和C单倍型为主：长白猪和晋汾白猪群体中,以B、C单倍型为主。对7种单倍型PCR产物进行PCR产物测序和同源序列比较,发现在扩增片段内共有5处突变,分别是扩增片段T37G、A150G、C167T、C193T和C256T,其中第193,256位点位于第9外显子上,均发生错义突变,第193位点突变使得苏氨酸突变为异亮氨酸,第256位点突变使得苏氨酸突变为蛋氨酸。利用GLM程序和最小二乘分析方法分析了单倍型与晋汾白猪体重和体尺性状的影响。结果发现,CAST基因的单倍型类型对体重和体尺性状无显著影响(P0.05)。采用荧光定量PCR技术,比较4个日龄阶段(60日龄、90日龄、120日龄、150日龄)马身猪和大白猪CAST基因mRNA表达差异。品种间比较发现,马身猪(公)和大白猪(公)CAST基因表达均呈现随日龄增长先升高后降低的趋势,大白猪(母)背最长肌组织CAST基因的表达总体呈现随日龄增长先升高后降低的趋势,在90日龄阶段表达量最高,极显著高于其它日龄阶段;马身猪(母)却呈现随日龄增长先略降后升高的趋势,60日龄和150日龄阶段表达差异不显著(PO.05),但60日龄和150日龄阶段CAST基因的表达显著高于其它日龄阶段。品种间比较发现,所选日龄中在60日龄和150日龄阶段,在相同性别的不同猪种之间的表达规律以及同时期表达量同样存在明显差异。
【关键词】：马身猪 CAST基因 微卫星 SSCP 荧光定量PCR
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2014
【分类号】：S828