| 博士生自认为的论文创新点 | 第1-7页 |
| 摘要 | 第7-8页 |
| Abstract | 第8-9页 |
| 目录 | 第9-11页 |
| 图表目录 | 第11-14页 |
| 第一章 研究背景 | 第14-40页 |
| ·转录暂停再延伸过程概述 | 第14-28页 |
| ·转录暂停(transcriptional pausing)的发现 | 第14-15页 |
| ·广泛存在的RNA聚合酶暂停现象 | 第15-18页 |
| ·转录暂停的生物学功能 | 第18-19页 |
| ·转录暂停再延伸机制 | 第19-28页 |
| ·SR蛋白家族概述 | 第28-31页 |
| ·SR蛋白家族简介 | 第28-30页 |
| ·SR蛋白的转录调控 | 第30-31页 |
| ·SR蛋白介导子细胞核中的基因网络 | 第31页 |
| ·染色体-剪接连接器模型(adaptor model) | 第31-32页 |
| ·转录速度测定方法概述 | 第32-33页 |
| ·转录调控相关的研究手段介绍 | 第33-40页 |
| ·转录组测序(RNA-seq) | 第33-34页 |
| ·RNA结合蛋白免疫共沉淀测序(CLIP-seq) | 第34-35页 |
| ·高锰酸钾足迹(Permanganate fotprinting) | 第35-36页 |
| ·加帽小RNA分析和测序(Short,capped RNA analysis and sequencing) | 第36页 |
| ·染色质免疫共沉淀测序(ChIP-seq) | 第36-38页 |
| ·新生RNA测序(NET-seq：nascent transcript sequencing) | 第38页 |
| ·Run-on RNA测序(GRO-seq) | 第38-40页 |
| 第二章 实验材料与实验方法 | 第40-53页 |
| ·实验材料 | 第40-43页 |
| ·细胞与细胞培养 | 第40页 |
| ·质粒构建及相关材料 | 第40-42页 |
| ·抗体,DNA,RNA oligos | 第42-43页 |
| ·实验方法 | 第43-52页 |
| ·转染和荧光素酶实验 | 第43页 |
| ·细胞分离,免疫共沉淀,RT-qPCR | 第43页 |
| ·RNA依赖的P-TEFb释放实验 | 第43-50页 |
| ·RNA-seq,ChIP-seq,CLIP-seq,和GRO-seq | 第50-52页 |
| ·科学问题解决框架图 | 第52页 |
| ·统计学分析 | 第52-53页 |
| 第三章 实验结果与讨论 | 第53-95页 |
| ·SRSF2介导的转录暂停再延伸机制 | 第53-86页 |
| ·研究背景与立项依据概述 | 第53页 |
| ·实验结果 | 第53-86页 |
| ·SRSF2敲除降低了转录速度 | 第86-89页 |
| ·小结与讨论 | 第89-91页 |
| ·SRSF2调控基因的转录暂停再延伸过程 | 第89页 |
| ·SRSF2与HIV-tat蛋白介导的转录激活比较 | 第89-90页 |
| ·7SK/P-TEFb复合体位于启动子附近 | 第90页 |
| ·SR蛋白可能在speckles里调控基因表达 | 第90-91页 |
| ·转录调控与mRNA剪接在细胞里是相互协调的 | 第91页 |
| ·SRSF2调控转录相关元件 | 第91-93页 |
| ·研究背景与立项 | 第91-92页 |
| ·SRSF2敲除造成子H3K36me3的上调 | 第92页 |
| ·SR蛋白敲除影响了染色体上转录复合体的稳定性 | 第92-93页 |
| ·SR蛋白敲除引起了RNA聚合酶的泛素化 | 第93页 |
| ·小结与讨论 | 第93-95页 |
| ·SR蛋白调控了H3K36me3在基因组上的分布 | 第93-94页 |
| ·SR蛋白影响转录机器稳定性的可能原因 | 第94-95页 |
| 参考文献 | 第95-106页 |
| 缩略词表 | 第106-109页 |
| 作者简历 | 第109-110页 |
| 攻博期间发表的科研成果 | 第110-111页 |
| 致谢 | 第111页 |
