| 摘要 | 第1-7页 |
| Abstract | 第7-15页 |
| 英文缩略表 | 第15-16页 |
| 第一章 引言 | 第16-22页 |
| ·木霉菌在生物防治上的应用 | 第16页 |
| ·木霉菌的生防作用机制 | 第16-17页 |
| ·木霉菌制剂种类 | 第17页 |
| ·木霉产孢相关基因的研究 | 第17-18页 |
| ·差异表达基因的研究方法 | 第18-20页 |
| ·差异显示 PCR(DD-RTPCR) | 第18页 |
| ·抑制性消减杂交（SSH） | 第18-19页 |
| ·基因芯片 | 第19页 |
| ·基于高通量测序技术的转录组测序技术 | 第19-20页 |
| ·本研究的目的意义、内容及技术路线 | 第20-22页 |
| ·本研究的目的意义 | 第20-21页 |
| ·本研究的主要内容 | 第21页 |
| ·本研究的技术路线 | 第21-22页 |
| 第二章 哈茨木霉 Th-33 厚垣孢子形成过程中转录组测序时间的确定 | 第22-26页 |
| ·试验材料 | 第22-23页 |
| ·供试菌株 | 第22页 |
| ·主要试剂和仪器 | 第22-23页 |
| ·试验方法 | 第23-24页 |
| ·培养基的配制 | 第23页 |
| ·转录组测序时间的确定 | 第23页 |
| ·样品菌丝制备 | 第23-24页 |
| ·结果与分析 | 第24-25页 |
| ·讨论 | 第25-26页 |
| 第三章 哈茨木霉厚垣孢子形成不同时期的转录组分析 | 第26-49页 |
| ·试验材料 | 第26页 |
| ·主要试剂 | 第26页 |
| ·主要仪器 | 第26页 |
| ·试验方法 | 第26-29页 |
| ·总 RNA 的提取 | 第26页 |
| ·cDNA 文库构建和测序 | 第26-27页 |
| ·测序数据处理和 de novo 组装 | 第27-28页 |
| ·Unigene 注释 | 第28页 |
| ·基因表达定量和差异表达分析 | 第28页 |
| ·差异基因的注释分析和聚类分析 | 第28-29页 |
| ·结果与分析 | 第29-47页 |
| ·哈茨木霉 Th-33 菌丝总 RNA 的提取 | 第29-31页 |
| ·原始测序数据质量分析 | 第31-32页 |
| ·序列 de novo 拼接和比对 | 第32页 |
| ·注释及基因表达定量分析 | 第32-33页 |
| ·差异表达基因（DEG）分析 | 第33-36页 |
| ·差异表达基因的 GO 富集分析 | 第36-37页 |
| ·差异表达基因的 KEGG 富集分析 | 第37-39页 |
| ·厚垣孢子相关的差异表达基因分析 | 第39-47页 |
| ·讨论 | 第47-49页 |
| 第四章 实时荧光定量 PCR 验证差异表达基因 | 第49-65页 |
| ·试验材料与仪器 | 第49-50页 |
| ·供试菌株 | 第49页 |
| ·培养基及主要试剂 | 第49页 |
| ·主要仪器 | 第49-50页 |
| ·试验方法 | 第50-56页 |
| ·总 RNA 的提取和 cDNA 的合成 | 第50-51页 |
| ·引物设计 | 第51-52页 |
| ·内参基因的选择 | 第52-53页 |
| ·Real-time PCR 条件的优化 | 第53-54页 |
| ·重组质粒的制备 | 第54-55页 |
| ·制作标准曲线 | 第55页 |
| ·计算所有目标基因在不同时期的表达量 | 第55-56页 |
| ·结果与分析 | 第56-64页 |
| ·总 RNA 的提取 | 第56页 |
| ·内参基因的选择 | 第56-58页 |
| ·Real-time PCR 条件的优化 | 第58-59页 |
| ·重组质粒 DNA 的提取及拷贝数的测定 | 第59-60页 |
| ·标准曲线的构建 | 第60-62页 |
| ·各个时期基因表达量的计算 | 第62-64页 |
| ·讨论 | 第64-65页 |
| 第五章 全文结论 | 第65-66页 |
| 参考文献 | 第66-73页 |
| 致谢 | 第73-74页 |
| 作者简历 | 第74页 |