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耐高温纤维水解酶的研究

致谢第1-4页
摘要第4-6页
Abstract第6-14页
第一章 绪论第14-36页
   ·纤维素、半纤维素的结构及其水解酶第14-17页
     ·纤维素的化学组成及纤维素酶第14-15页
     ·半纤维素的化学组成及半纤维素酶第15-17页
   ·纤维素酶、半纤维素酶的研究进展第17-24页
     ·纤维素酶的来源、结构与分类第17-19页
     ·半纤维素酶的来源、结构与分类第19-23页
     ·纤维素酶、半纤维素酶的催化机理第23-24页
   ·耐热纤维素酶、半纤维素酶及其研究手段第24-27页
     ·同源序列比对第25页
     ·系统发育重建第25页
     ·蛋白结构解析和同源建模第25-26页
     ·基于理论设计的定点突变研究第26-27页
   ·Thermotoga maritima ATCC 43589 和 Thermotoga thermarum DSM 5069第27页
     ·Thermotoga maritima ATCC 43589第27页
     ·Thermotoga thermarum DSM 5069第27页
   ·立题背景及研究内容第27页
 参考文献第27-36页
第二章 Thermotoga maritima 内切葡聚糖酶 Cel12B 进化分析及耐热机理研究第36-49页
   ·前言第36页
   ·材料与方法第36-37页
     ·数据库中适宜序列的筛选第36页
     ·多重序列比对与系统发育研究第36-37页
     ·二级结构预测第37页
     ·功能残基鉴定第37页
   ·结果与分析第37-45页
     ·蛋白质氨基酸序列特征第38页
     ·系统发育分析第38-42页
     ·保守和催化氨基酸分析第42-43页
     ·极耐热内切葡聚糖糖酶 Cel12B 同源建模第43-44页
     ·功能氨基酸突变分析第44-45页
   ·讨论第45-46页
 参考文献第46-49页
第三章 Thermotoga maritima 极耐热葡聚糖酶与 CBD 融合的研究第49-58页
   ·前言第49页
   ·材料与方法第49-52页
     ·材料第49-50页
     ·细菌菌株和质粒第50页
     ·基因组 DNA 的提取和扩增第50-51页
     ·表达载体的构建与测序第51页
     ·Cel12B-CBD 融合蛋白的表达及其纯化第51页
     ·SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳分析第51页
     ·酶活测定第51页
     ·Cel12B-CBD 融合蛋白酶学性质测定第51页
     ·融合蛋白对天然纤维素分解实验第51-52页
     ·融合蛋白吸附实验第52页
   ·结果与分析第52-55页
     ·重组融合蛋白鉴定第52页
     ·重组融合蛋白酶学性质第52-54页
     ·融合酶吸附结晶纤维素第54页
     ·融合酶降解底物特异性第54-55页
   ·讨论第55-56页
 参考文献第56-58页
第四章 Thermotoga thermarum 耐热木聚糖酶 B 的克隆、高效表达和酶学性质研究第58-71页
   ·前言第58页
   ·材料与方法第58-61页
     ·材料第58页
     ·细菌菌株和质粒第58-59页
     ·基因组 DNA 的提取和扩增第59页
     ·表达载体的构建与测序第59页
     ·木聚糖酶 Xyn10B 的表达及其纯化第59页
     ·SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳分析第59页
     ·酶活测定第59-60页
     ·木聚糖酶 Xyn10B 的生化定性第60页
     ·底物特异性和动力学性质的测定第60页
     ·水解产物分析第60页
     ·生物信息学分析第60-61页
   ·结果与讨论第61-68页
     ·木糖苷酶 Xyn10B 基因的克隆、表达载体的构建、测序及其生物信息学分析第61-64页
     ·Xyn10B 木聚糖酶在 E. coli 中的诱导表达和纯化第64-65页
     ·Xyn10B 的生化定性第65-67页
     ·水解产物的分析第67-68页
 参考文献第68-71页
第五章 Thermotoga thermarum 极耐热木聚糖酶 A 的克隆、表达、酶学性质研究及耐热机理初探第71-84页
   ·前言第71页
   ·材料和方法第71-73页
     ·xyn10A 基因、质粒和培养基第71页
     ·DNA 操纵和质粒的构建第71-72页
     ·重组木聚糖酶 Xyn10A 的表达和纯化第72页
     ·生化性质测定第72页
     ·水解产物的分析第72-73页
     ·多序列比对和系统发育分析第73页
     ·三维结构预测第73页
     ·圆二色谱光谱测定温度变化值第73页
   ·结果与分析第73-78页
     ·Xyn10A 的克隆和序列分析第73页
     ·重组木聚糖酶 Xyn10A 的表达和纯化第73-74页
     ·木聚糖酶 Xyn10A 的生化定性第74-75页
     ·Xyn10A 降解木聚糖第75-76页
     ·Xyn10A 的系统发生树和催化残基第76-77页
     ·CD 表征结果分析第77-78页
   ·讨论第78-81页
 参考文献第81-84页
第六章 Thermotoga thermarum β-木糖苷酶/α-阿拉伯糖苷酶的克隆、表达及酶学性质研究第84-97页
   ·前言第84页
   ·材料与方法第84-87页
     ·菌株、质粒及培养基第84-85页
     ·基因操作第85页
     ·质粒构建第85页
     ·蛋白表达与纯化第85页
     ·β-木糖苷酶/α-阿拉伯糖苷酶酶学性质测定第85-86页
     ·Tth xynB3 β-木糖苷酶系统发育学研究第86页
     ·Tth xynB3 β-木糖苷酶对低聚木糖的水解研究第86-87页
   ·结果与分析第87-92页
     ·Tth xynB3 β-木糖苷酶的克隆和序列分析第87页
     ·Tth xynB3 β-木糖苷酶的表达与纯化第87-88页
     ·Tth xynB3 β-木糖苷酶的酶学性质分析第88-89页
     ·Tth xynB3 β-木糖苷酶底物特异性及耐木糖性能第89-90页
     ·Tth xynB3 β-木糖苷酶对低聚糖的降解第90-91页
     ·Tth xynB3 β-木糖苷酶的系统发育分析第91-92页
   ·讨论第92-94页
 参考文献第94-97页
第七章 Thermotoga thermarum β-甘露糖苷酶的克隆、高效表达和酶学性质研究第97-111页
   ·前言第97页
   ·材料与方法第97-100页
     ·细菌菌株和培养条件第97页
     ·质粒构建第97-98页
     ·重组β-甘露糖苷酶的表达与纯化第98页
     ·酶活测定和温度、pH 值对酶活的影响第98-99页
     ·底物特异性第99页
     ·1,4-β-D-甘露聚糖降解实验第99页
     ·生物信息学分析第99-100页
     ·氨基酸序列检索号第100页
   ·结果与分析第100-106页
     ·Tth Man5 β-甘露糖苷酶氨基酸序列分析第100-101页
     ·Tth Man5 β-甘露糖苷酶的高效表达和纯化第101-102页
     ·Tth Man5 β-甘露糖苷酶的生化性质第102-104页
     ·Tth Man5 β-甘露糖苷酶水解 1,4-β-D-甘露聚糖分析第104页
     ·Tth Man5 β-甘露糖苷酶系统发育分析第104-106页
   ·讨论第106-108页
 参考文献第108-111页
第八章 Thermotoga thermarum 阿拉伯多糖酶的克隆、表达与酶学性质分析第111-123页
   ·前言第111页
   ·材料与方法第111-113页
     ·底物第111页
     ·菌株和生长条件第111页
     ·构建质粒和菌株第111-112页
     ·阿拉多糖酶的表达和纯化第112页
     ·酶的生化性质第112-113页
     ·底物特异性第113页
     ·生物信息学分析第113页
     ·核苷酸序列编号第113页
   ·结果与分析第113-118页
     ·T. thermarum 阿拉伯多糖酶的序列分析第113-115页
     ·阿拉伯糖酶的表达和纯化第115-116页
     ·Tth Abn 阿拉伯糖酶的生化性质第116-117页
     ·阿拉伯多糖酶的水解第117-118页
     ·Tth Abn 阿拉伯多糖酶进化分析第118页
   ·讨论第118-121页
 参考文献第121-123页
第九章 全文总结第123-125页
攻读学位期间发表的学术论文第125-126页

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