| 中文摘要 | 第1-5页 |
| ABSTRACT | 第5-7页 |
| 目录 | 第7-9页 |
| 第一章 文献综述 | 第9-16页 |
| 1 TAP基因概述及其研究进展 | 第9-11页 |
| 2 DNA甲基化修饰研究进展 | 第11-12页 |
| 3 白细胞介素概述及其研究进展 | 第12-13页 |
| 4 生物信息学概述 | 第13-14页 |
| 5 苏太猪F18大肠秆菌病抗性和敏感性资源群体简介 | 第14页 |
| 6 本研究的目的和意义 | 第14-16页 |
| 第二章 猪TAP1基因多态性分析 | 第16-24页 |
| 1 试验材料 | 第16-17页 |
| ·试验动物 | 第16页 |
| ·主要仪器 | 第16页 |
| ·主要试剂 | 第16-17页 |
| ·主要试剂的配制 | 第17页 |
| 2 试验方法 | 第17-19页 |
| ·DNA提取 | 第17-18页 |
| ·引物设计 | 第18页 |
| ·PCR扩增 | 第18-19页 |
| ·酶切电泳判型 | 第19页 |
| ·序列测定 | 第19页 |
| ·统计分析 | 第19页 |
| 3 结果与分析 | 第19-22页 |
| ·引物的扩增效果检测 | 第19-20页 |
| ·TAP1基因PCR-RFLP检测结果 | 第20页 |
| ·TAP1序列分析结果 | 第20-21页 |
| ·不同猪群体TAP1基因外显子2的基因型及其等位基因频率分析 | 第21-22页 |
| 4 讨论 | 第22-24页 |
| 第三章 TAP1基因表达规律及其与F18大肠杆菌抗性的关系 | 第24-37页 |
| 1 试验材料 | 第24-25页 |
| ·试验动物 | 第24页 |
| ·主要仪器 | 第24页 |
| ·主要试剂 | 第24-25页 |
| ·主要试剂的配制 | 第25页 |
| 2 试验方法 | 第25-28页 |
| ·组织总RNA的提取 | 第25-26页 |
| ·引物设计与合成 | 第26页 |
| ·RT-PCR扩增 | 第26-27页 |
| ·实时荧光定量PCR | 第27-28页 |
| ·数据处理与统计分析 | 第28页 |
| 3 结果与分析 | 第28-34页 |
| ·总RNA的纯度与完整性 | 第28-29页 |
| ·荧光定量PCR引物常规PCR检测及测序结果 | 第29页 |
| ·荧光定量PCR的溶解曲线 | 第29-30页 |
| ·TAP1基因在不同日龄仔猪中表达规律 | 第30-31页 |
| ·TAP1在苏太猪F18大肠杆菌抗性和敏感性猪群中的表达规律 | 第31-32页 |
| ·TAP1基因在不同猪种中的表达规律 | 第32-33页 |
| ·TAP1基因在G729A变异位点的3种基因型个体中的表达规律 | 第33-34页 |
| 4 讨论 | 第34-37页 |
| 第四章 TAP1基因多态性与部分免疫应答指标的关联分析 | 第37-49页 |
| 1 试验材料 | 第37页 |
| ·试验动物 | 第37页 |
| ·主要仪器 | 第37页 |
| ·主要试剂 | 第37页 |
| 2 试验方法 | 第37-39页 |
| ·实验原理 | 第37-38页 |
| ·实验操作步骤 | 第38-39页 |
| ·操作程序总结 | 第39页 |
| ·数据计算及分析 | 第39页 |
| 3 结果与分析 | 第39-47页 |
| ·不同猪种免疫指标正常值范围的估计 | 第39-43页 |
| ·不同猪种中IL-2正态分布 | 第39-40页 |
| ·不同猪种中IL-6正态分布 | 第40-41页 |
| ·不同猪种中IL-10正态分布 | 第41-42页 |
| ·不同猪种中IL-12正态分布 | 第42-43页 |
| ·各猪种间免疫指标差异分析 | 第43-44页 |
| ·大白猪中TAP1基因与免疫指标关联分析 | 第44-45页 |
| ·苏太猪中TAP1基因与免疫指标关联分析 | 第45-46页 |
| ·梅山猪中TAP1基因与免疫指标关联分析 | 第46-47页 |
| 4 讨论 | 第47-49页 |
| 第五章 TAP1基因启动子区甲基化修饰检测 | 第49-59页 |
| 1 试验材料 | 第49页 |
| ·试验动物 | 第49页 |
| ·主要仪器 | 第49页 |
| ·主要试剂 | 第49页 |
| ·主要试剂的配制 | 第49页 |
| 2 试验方法 | 第49-53页 |
| ·组织DNA提取纯化 | 第49页 |
| ·亚硫酸氢钠转化DNA | 第49-52页 |
| ·引物设计与合成 | 第52-53页 |
| ·PCR扩增、克隆测序 | 第53页 |
| ·数据处理与统计分析 | 第53页 |
| 3 结果与分析 | 第53-57页 |
| ·猪TAP1侧翼调控序列的生物信息学分析 | 第53-55页 |
| ·内侧引物扩增产物 | 第55页 |
| ·测序结果分析 | 第55页 |
| ·不同组织甲基化状态 | 第55-56页 |
| ·苏太猪不同日龄十二指肠和空肠的甲基化情况 | 第56页 |
| ·不同猪种十二指肠和空肠的甲基化情况 | 第56-57页 |
| ·苏太猪F18大肠杆菌抗性和敏感性群十二指肠、空肠的甲基化情况 | 第57页 |
| 4 讨论 | 第57-59页 |
| 全文结论 | 第59-60页 |
| 参考文献 | 第60-68页 |
| 致谢 | 第68-69页 |
| 攻读学位期间发表和参与发表的学术论文目录 | 第69-71页 |
