| 摘要 | 第1-7页 |
| ABSTRACT | 第7-12页 |
| 第一章 绪论 | 第12-22页 |
| ·SELDI-TOF 质谱技术及其应用 | 第12-15页 |
| ·SELDI-TOF 质谱技术 | 第12-14页 |
| ·基于 SELDI-TOF 质谱技术筛选癌症相关生物标记 | 第14-15页 |
| ·寡核苷酸基因芯片技术及其应用 | 第15-19页 |
| ·寡核苷酸基因芯片技术 | 第15-17页 |
| ·基于寡核苷酸基因芯片技术筛选癌症相关生物标记 | 第17-19页 |
| ·论文研究的目的和意义 | 第19-20页 |
| ·论文的主要内容 | 第20-22页 |
| 第二章 SELDI-TOF 质谱数据预处理对癌症相关蛋白峰标记可重复性的影响 | 第22-44页 |
| ·引言 | 第22-23页 |
| ·材料与方法 | 第23-27页 |
| ·数据集 | 第23-24页 |
| ·数据预处理方法 | 第24-26页 |
| ·差异表达蛋白峰的筛选及其可重复性评价 | 第26-27页 |
| ·采用 2-均值聚类分层方法筛选差异表达蛋白峰 | 第27页 |
| ·结果 | 第27-39页 |
| ·蛋白峰识别的可重复性 | 第28-29页 |
| ·蛋白峰量化的可重复性 | 第29-31页 |
| ·差异表达蛋白峰识别的可重复性 | 第31-32页 |
| ·影响差异表达蛋白峰识别可重复性的两个主要因素 | 第32-34页 |
| ·通过提高统计效能提高差异表达蛋白峰识别的可重复性 | 第34-36页 |
| ·与乳腺癌数据初始研究发现的差异表达蛋白峰的比较 | 第36页 |
| ·平均质谱依赖的数据预处理方法与 CIPHERGEN 方法的比较 | 第36-39页 |
| ·讨论 | 第39-42页 |
| ·本章小结 | 第42-44页 |
| 第三章 发现乳腺癌转移相关的微弱差异表达信号和可重复的功能标记 | 第44-79页 |
| ·引言 | 第44-46页 |
| ·材料与方法 | 第46-54页 |
| ·仿真模型 | 第46页 |
| ·数据集与数据库 | 第46-51页 |
| ·癌相关基因 | 第51-52页 |
| ·差异表达基因的筛选 | 第52页 |
| ·差异表达基因的可重复性评价 | 第52-53页 |
| ·功能富集分析及其可重复性评价 | 第53-54页 |
| ·结果 | 第54-74页 |
| ·通过提高统计效能提取可重复的乳腺癌转移相关功能标记 | 第54-66页 |
| ·检验基因个数及其中非差异表达基因比例对统计效能的影响 | 第54-55页 |
| ·差异表达基因的筛选及其可靠性评价 | 第55-60页 |
| ·乳腺癌转移相关功能的可重复性 | 第60-62页 |
| ·提取可重复的乳腺癌转移相关功能 | 第62-66页 |
| ·通过降低错误发现率控制水平提取可重复的乳腺癌转移相关功能标记 | 第66-71页 |
| ·功能富集分析的稳健性 | 第66-67页 |
| ·在差异表达信号微弱的数据集中识别乳腺癌转移相关功能 | 第67-70页 |
| ·提取可重复的乳腺癌转移相关功能 | 第70-71页 |
| ·提取的可重复乳腺癌转移相关功能标记的比较 | 第71-74页 |
| ·讨论 | 第74-77页 |
| ·本章小结 | 第77-79页 |
| 第四章 结论和展望 | 第79-83页 |
| ·研究总结 | 第79-81页 |
| ·前景展望 | 第81-83页 |
| 附录一 | 第83-100页 |
| 附录二 | 第100-102页 |
| 致谢 | 第102-103页 |
| 参考文献 | 第103-118页 |
| 攻读博士期间取得的研究成果 | 第118-121页 |
| 攻读博士学位期间参加课题工作 | 第121-122页 |
