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棒状链霉菌扩环酶分子改造及Bacillus subtilis FS1403耐热脂肪酶的研究

摘要第1-3页
Abstract第3-4页
中文文摘第4-10页
第1章 绪论第10-38页
   ·理性设计第11-16页
     ·寡核苷酸引物介导的定点突变第11-13页
       ·寡核苷酸引物介导的定点突变方法的原理和方法第11-12页
       ·改良的寡核苷酸引物所介导的定点突变方法第12-13页
     ·PCR介导的定点突变第13-16页
       ·重叠延伸PCR第14页
       ·大引物突变法第14-15页
       ·盒式突变第15-16页
   ·非理性设计——酶分子定向进化技术第16-31页
     ·酶分子定向进化的历史第16-17页
     ·酶分子定向进化的策略第17-27页
       ·易错PCR技术第17-18页
       ·DNA改组技术第18-20页
       ·外显子改组第20-21页
       ·交错延伸重组第21-22页
       ·随机引物体外重组第22-23页
       ·酶法体外随机-定位诱变第23-24页
       ·合成改组第24页
       ·截断状模板重组延伸第24-25页
       ·退火低核苷酸基因重排第25页
       ·非依赖序列同源性的重组法第25-27页
     ·定向进化文库的筛选方法第27-31页
       ·常规筛选方法第27-29页
       ·新发展的高效筛选方法第29-31页
   ·酶分子工程的应用和发展前景第31-34页
     ·提高酶分子的催化活性第31-32页
     ·提高酶分子稳定性第32页
     ·微生物酶分子对底物的专一性的定向改造第32-33页
     ·对映体选择性的定向进化第33页
     ·对蛋白药物的改造第33-34页
   ·本课题研究背景第34-36页
   ·本课题研究内容和意义第36-38页
     ·本课题研究内容第36页
     ·本课题研究的目的和意义第36-38页
第2章 棒状链霉菌扩环酶基因的定点突变第38-56页
   ·前言第38-39页
   ·材料与方法第39-46页
     ·材料第39-41页
       ·菌株和质粒第39页
       ·试剂第39-40页
       ·培养基以及缓冲液第40页
       ·主要仪器第40页
       ·定点突变引物第40-41页
     ·方法第41-46页
       ·大肠杆菌重组质粒pET30a-scDAOC的提取第41-42页
       ·定点突变的PCR条件第42-43页
       ·感受态E.coli JM109/E.coli BL21的制备第43页
       ·PCR产物的热激转化第43页
       ·阳性克隆子的快速筛选与验证第43-44页
       ·野生型和突变体的表达转化第44页
       ·突变体生物活性的检测第44-46页
   ·结果与讨论第46-55页
     ·定点突变的PCR条件的摸索第46页
     ·阳性克隆子的快速筛选与验证第46-47页
     ·突变体的测序验证第47-49页
     ·野生型和突变体的SDS-PAGE检测第49页
     ·标准蛋白曲线的绘制第49-50页
     ·野生型和突变体的抑菌圈测定第50-51页
     ·野生型和突变体的HPLC测定酶活第51-55页
   ·小结第55-56页
第3章 棒状链霉菌扩环酶基因随机突变的研究第56-66页
   ·前言第56页
   ·材料与方法第56-61页
     ·材料第56-58页
       ·菌株和质粒第56-57页
       ·试剂第57页
       ·培养基以及缓冲液第57页
       ·主要仪器第57-58页
       ·易错PCR和DNA改组的引物第58页
     ·方法第58-61页
       ·棒状链霉菌扩环酶基因的Error-prone PCR第58-60页
       ·DNA改组探索第60-61页
   ·结果与讨论第61-64页
     ·Error-prone PCR第61-63页
       ·Error-prone PCR条件优化第61页
       ·菌落PCR验证阳性克隆子并测序分析第61-62页
       ·易错PCR产物的表达转化以及酶切鉴定第62页
       ·Error-prone PCR的突变基因库表达和酶活检测第62-63页
     ·DNA改组探索第63-64页
       ·链霉菌和真菌扩环酶摸板的大量扩增第63页
       ·目的基因的随机片段化第63页
       ·无引物PCR重组第63-64页
       ·有引物PCR第64页
       ·PCR产物的测序验证第64页
   ·小结第64-66页
第4章 耐热脂肪酶产生菌FS1403的分离筛选和16SrDNA基因序列的分析第66-76页
   ·前言第66页
   ·材料与方法第66-70页
     ·材料第66-67页
       ·菌株和质粒第66页
       ·试剂第66页
       ·培养基第66-67页
       ·仪器第67页
       ·引物第67页
     ·方法第67-70页
       ·嗜热菌的分离培养第67页
       ·产脂肪酶耐热菌株的筛选第67页
       ·产脂肪酶菌株耐热性试验第67页
       ·FS1403脂肪酶性质的初步研究第67-68页
       ·基因组DNA的提取第68-69页
       ·16SrDNA基因获得第69页
       ·16SrDNA基因的连接转化第69页
       ·16SrDNA基因阳性克隆子的菌落PCR鉴定第69页
       ·16SrDNA序列分析和进化树构建第69-70页
   ·结果与讨论第70-74页
     ·产脂肪酶耐热菌株的筛选第70页
     ·FS1403脂肪酶性质的初步研究第70-71页
       ·FS1403脂肪酶活性测定第70页
       ·FS1403脂肪酶作用温度和作用pH第70-71页
       ·温度对FS1403脂肪酶热稳定性的影响第71页
     ·FS1403基因组DNA的提取第71-72页
     ·FS1403 16SrDNA基因获得第72页
     ·FS1403 16SrDNA基因阳性克隆子的筛选与验证第72-73页
     ·FS1403 16SrDNA基因测序结果第73页
     ·FS1403 16SrDNA基因系统进化树分析第73-74页
   ·小结第74-76页
第5章 Bacillus subtilis FS1403耐热脂肪酶基因的克隆和表达第76-90页
   ·前言第76页
   ·材料和方法第76-82页
     ·材料第76-78页
       ·菌株和质粒第76页
       ·工具酶和生化试剂第76-77页
       ·培养基及缓冲液第77页
       ·引物第77-78页
       ·主要仪器设备第78页
     ·方法第78-82页
       ·菌株基因组DNA的提取第78-79页
       ·脂肪酶基因的获得第79页
       ·脂肪酶基因的回收第79页
       ·CaCl_2法制备宿主菌E.coli JM109、E.coli BL21感受态细胞第79页
       ·脂肪酶基因的克隆第79页
       ·脂肪酶基因阳性克隆子的菌落PCR鉴定第79-80页
       ·脂肪酶基因序列的测定第80页
       ·重组表达质粒的构建及鉴定第80-81页
       ·脂肪酶基因在原核表达载体中的表达第81页
       ·表达产物的SDS-PAGE分析第81页
       ·重组枯草芽孢杆菌耐热脂肪酶酶学性质的初步研究第81-82页
   ·结果与讨论第82-88页
     ·基因组DNA的提取第82页
     ·目的基因PCR扩增第82-83页
     ·克隆与重组子的鉴定第83页
     ·脂肪酶基因的测序结果第83-84页
     ·脂肪酶序列的结构分析第84-85页
       ·基因序列的分析第84页
       ·编码蛋白的预测及分析第84-85页
     ·原核表达载体的构建与鉴定第85页
     ·表达产物的电泳结果第85-86页
     ·重组芽孢杆菌耐热脂肪酶酶学性质的初步鉴定第86-88页
       ·重组菌脂肪酶的活性鉴定第86页
       ·温度对重组菌表达的脂肪酶的酶活的影响第86-87页
       ·pH对重组菌表达的脂肪酶的酶活的影响第87页
       ·温度对重组菌脂肪酶热稳定性的影响第87-88页
   ·小结第88-90页
总结与展望第90-92页
附录 主要符号对照表第92-94页
参考文献第94-100页
攻读学位期间承担的科研任务与主要成果第100-102页
致谢第102-104页
个人简历第104-105页

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