| 摘要 | 第1-7页 |
| ABSTRACT | 第7-11页 |
| 第一章 绪论 | 第11-18页 |
| ·问题提出 | 第11-13页 |
| ·国内外研究现状 | 第13-16页 |
| ·论文的主要内容及贡献 | 第16-18页 |
| 第二章 生物学基础及Affymetrix 基因芯片系统 | 第18-29页 |
| ·引言 | 第18页 |
| ·核酸的生物学基础 | 第18-22页 |
| ·核酸的分子组成 | 第18-19页 |
| ·核酸的分子结构 | 第19-22页 |
| ·基因表达 | 第22-23页 |
| ·Affymetrix 基因芯片系统 | 第23-26页 |
| ·Affymetrix 基因芯片独特的原位光刻技术 | 第23-24页 |
| ·Affymetrix 基因芯片的探针设计 | 第24-26页 |
| ·Affymetrix 基因芯片公司特有的注释资源 | 第26-27页 |
| ·小结 | 第27-29页 |
| 第三章 确定基因芯片探针集的mRNA 水平靶标 | 第29-42页 |
| ·引言 | 第29页 |
| ·BLAST 序列比对方法 | 第29-32页 |
| ·BlAST 工具 | 第29-30页 |
| ·BLAST 算法及相关参数 | 第30-32页 |
| ·相关 Affymetrix 基因芯片介绍 | 第32-34页 |
| ·GeneChip~(?) Human Genome U133 Set | 第32-33页 |
| ·GeneChip~(?) Mouse Genome 430A 2.0 Array | 第33-34页 |
| ·原始数据及试验结果 | 第34-38页 |
| ·原始数据 | 第34-35页 |
| ·确认转录本靶标 | 第35-38页 |
| ·核苷酸序列数据库简介 | 第38-40页 |
| ·GeneBank | 第38-39页 |
| ·EMBL | 第39页 |
| ·DDBJ | 第39-40页 |
| ·Ensembl | 第40页 |
| ·RefSeq | 第40页 |
| ·小结 | 第40-42页 |
| 第四章 转录本中心重注释文件验证及其在蛋白质相互作用研究的应用.. | 第42-59页 |
| ·引言 | 第42页 |
| ·相关数据库介绍 | 第42-44页 |
| ·Gene Expression Omnibus (GEO) | 第42-44页 |
| ·IPI | 第44页 |
| ·蛋白质相互作用数据库 | 第44页 |
| ·Pearson 相关系数 | 第44-49页 |
| ·Pearson 相关系数及其显著性检验 | 第45-47页 |
| ·Pearson 相关系数的比较及公共相关系数 | 第47-49页 |
| ·转录本中心重注释文件验证 | 第49-53页 |
| ·重注释结果在蛋白质相互作用研究的应用 | 第53-57页 |
| ·小结 | 第57-59页 |
| 第五章 总结和展望 | 第59-61页 |
| ·全文总结 | 第59页 |
| ·研究展望 | 第59-61页 |
| 参考文献 | 第61-65页 |
| 致谢 | 第65-66页 |
| 攻读硕士期间已发表或录用的论文 | 第66页 |
