本地化生物信息学平台的完善和大批量水稻数据的分析
| 缩略词表 | 第1-6页 |
| 摘要 | 第6-7页 |
| Abstract | 第7-9页 |
| 1 前言 | 第9-24页 |
| ·生物信息学产生的背景 | 第9-11页 |
| ·生物信息学的发展与应用 | 第11-19页 |
| ·相关学科和技术的发展 | 第11页 |
| ·计算机分析工具 | 第11-13页 |
| ·生物学数据库 | 第13-18页 |
| ·核酸序列数据库 | 第15-16页 |
| ·蛋白质序列数据库 | 第16页 |
| ·高级结构数据库 | 第16-18页 |
| ·其他数据库 | 第18页 |
| ·生物信息学的应用 | 第18-19页 |
| ·EST数据研究 | 第19-20页 |
| ·突变体数据研究 | 第20-21页 |
| ·生物信息平台基础 | 第21-22页 |
| ·本研究的目的 | 第22-24页 |
| 2 材料与方法 | 第24-30页 |
| ·生物实验材料 | 第24-25页 |
| ·计算机硬件与软件 | 第25-26页 |
| ·实验与计算方法 | 第26-30页 |
| ·cDNA克隆的测序与分析 | 第26-27页 |
| ·SNP和Indel分析 | 第27-28页 |
| ·侧翼序列的处理与分析 | 第28页 |
| ·EST和侧翼序列定位与功能分类 | 第28-29页 |
| ·QTL数据收集与整理 | 第29页 |
| ·水稻EST分析流程 | 第29-30页 |
| 3 结果与分析 | 第30-55页 |
| ·水稻EST数据库的构建与EST的分析 | 第30-50页 |
| ·水稻EST数据库内容和功能 | 第30页 |
| ·对cDNA文库的序列分析 | 第30-32页 |
| ·EST功能分类 | 第32-33页 |
| ·对表达序列种间、种内特有多态性挖掘 | 第33-38页 |
| ·EST在水稻基因组上的定位 | 第38-40页 |
| ·一种新类型的mutator类转座酶 | 第40-43页 |
| ·EST与重要农艺性状QTL的整合 | 第43-50页 |
| ·水稻突变体数据库的构建与使用 | 第50-55页 |
| ·水稻突变体数据库的构建 | 第50-53页 |
| ·数据库检索 | 第53-54页 |
| ·关键词检索 | 第53-54页 |
| ·BLAST检索 | 第54页 |
| ·应用情况 | 第54-55页 |
| 4 讨论 | 第55-61页 |
| ·本研究的创新之处及意义 | 第55-56页 |
| ·高丰度基因 | 第56页 |
| ·对低冗余过程序列的利用 | 第56-57页 |
| ·多变的DIS频率 | 第57-58页 |
| ·新基因发掘 | 第58-59页 |
| ·QTL与EST整合图谱的应用 | 第59页 |
| ·水稻突变体数据库未来打算 | 第59页 |
| ·水稻EST数据库与水稻突变体数据库的集成 | 第59-60页 |
| ·生物学、分子生物学实验与生物信息学的关系 | 第60-61页 |
| 参考文献 | 第61-74页 |
| 附录 | 第74-86页 |
| 附表1.具有代表性的生物学数据库 | 第74-83页 |
| 附表2.水稻突变体数据库中的突变表型 | 第83-86页 |
| 作者简历 | 第86-88页 |
| 致谢 | 第88页 |
