| 摘要 | 第1-7页 |
| Abstract | 第7-8页 |
| 第一章 绪论 | 第8-19页 |
| §1.1 引言 | 第8页 |
| §1.2 分子遗传学机制 | 第8-11页 |
| §1.2.1 中心法则 | 第8-9页 |
| §1.2.2 遗传密码 | 第9页 |
| §1.2.3 mRNA的转录与加工 | 第9-10页 |
| §1.2.4 翻译 | 第10-11页 |
| §1.3 RNA干扰技术 | 第11-17页 |
| §1.3.1 RNA干扰的概念与起源 | 第11页 |
| §1.3.2 RNA干扰的作用机制与原理 | 第11-13页 |
| §1.3.3 编码区RNAi技术和启动子区RNAi技术 | 第13-14页 |
| §1.3.4 siRNA的获得及dsRNA的导入方法 | 第14页 |
| §1.3.5 RNA干扰的生物学功能 | 第14-16页 |
| §1.3.6 RNA干扰的应用前景 | 第16-17页 |
| §1.4 课题研究的主要内容及贡献 | 第17-19页 |
| 第二章 siRNA序列活性及其影响因素 | 第19-33页 |
| §2.1 引言 | 第19页 |
| §2.2 siRNA活性 | 第19-20页 |
| §2.3 MPI准则 | 第20页 |
| §2.4 siRNA序列的热力学特性与其活性的关系 | 第20-32页 |
| ·NN(nearest-neighbor model)模型 | 第20-21页 |
| §2.4.2 siRNA序列反义链5'端稳定性与siRNA序列活性关系 | 第21-25页 |
| §2.4.3 反义链5'端稳定性与3'端稳定性的差异对活性的影响 | 第25-29页 |
| §2.4.4 siRNA序列中间区域稳定性对其活性的影响 | 第29页 |
| §3.4.5 靶mRNA及siRNA序列二级结构对热力学特性的影响 | 第29-31页 |
| §2.4.6 siRNA序列热力学特性影响其活性的可能机制 | 第31-32页 |
| §2.5 小结 | 第32-33页 |
| 第三章 基于BP神经网络的siRNA活性预测 | 第33-43页 |
| §3.1 BP神经网络简介 | 第33-34页 |
| §3.2 BP神经网络预测siRNA活性 | 第34-41页 |
| §3.2.1 siRNA数据准备 | 第34页 |
| §3.2.2 提取特征向量 | 第34-35页 |
| §3.2.3 特征的相关性分析 | 第35-37页 |
| §3.2.4 建立和训练BP神经网络 | 第37-39页 |
| §3.2.5 测试结果评价 | 第39-41页 |
| §3.3 与其它方法的比较 | 第41页 |
| §3.4 小结 | 第41-43页 |
| 第四章 基于mRNA二级结构的预测优化 | 第43-49页 |
| §4.1 RNA二级结构 | 第43页 |
| §4.2 RNA二级结构预测 | 第43-45页 |
| §4.2.1 二级结构预测算法 | 第43页 |
| §4.2.2 RNA二级结构预测的数学描述 | 第43-45页 |
| §4.3 靶mRNA二级结构对siRNA活性的影响 | 第45页 |
| §4.4 基于mRNA二级结构的预测优化 | 第45-49页 |
| §4.4.1 筛选过程和标准 | 第45-48页 |
| §4.4.2 筛选结果 | 第48-49页 |
| 第五章 总结和展望 | 第49-51页 |
| §5.1 全文总结 | 第49-50页 |
| §5.2 研究展望 | 第50-51页 |
| 致谢 | 第51-52页 |
| 参考文献 | 第52-56页 |
