| 第一章 绪论 | 第1-12页 |
| ·生物信息学 | 第7-9页 |
| ·生物序列比对算法的发展 | 第9-10页 |
| ·蚁群算法概述 | 第10-11页 |
| ·本文主要内容 | 第11-12页 |
| 第二章 生物序列比对基础 | 第12-22页 |
| ·生物序列的定义 | 第12-14页 |
| ·DNA 序列 | 第12-13页 |
| ·RNA 序列 | 第13页 |
| ·蛋白质序列 | 第13-14页 |
| ·生物序列比对 | 第14-18页 |
| ·生物序列比对问题的描述 | 第14-15页 |
| ·替换矩阵 | 第15-17页 |
| ·空位罚分 | 第17-18页 |
| ·动态规划算法在序列比对中的应用 | 第18-22页 |
| ·全局比对中的动态规划 | 第18-20页 |
| ·局部比对中的动态规划 | 第20-22页 |
| 第三章 基于基本蚁群算法的序列比对 | 第22-37页 |
| ·基本蚁群算法的原理 | 第22-24页 |
| ·基本蚁群算法的典型应用 | 第24-27页 |
| ·蚁群比对算法的设计 | 第27-30页 |
| ·利用蚁群算法求解序列比对问题和TSP 问题的比较 | 第30-32页 |
| ·蚁群比对算法的实现 | 第32-34页 |
| ·实验与结果 | 第34-37页 |
| 第四章 基本蚁群比对算法的改进 | 第37-46页 |
| ·个体差异策略 | 第37-38页 |
| ·前进方向选择策略的改进 | 第38-39页 |
| ·限制路径上的信息素浓度 | 第39-40页 |
| ·改进蚁群比对算法的实现 | 第40-41页 |
| ·改进蚁群比对算法的实验和结果 | 第41-42页 |
| ·蚁群比对算法中参数对解的影响 | 第42-46页 |
| ·信息素挥发度ρ的选择的影响 | 第42-43页 |
| ·蚂蚁数量m 的选择的影响 | 第43-44页 |
| ·常数Q的取值选择的影响 | 第44页 |
| ·α 、β 、γ 取值的影响 | 第44-46页 |
| 结束语 | 第46-47页 |
| 参考文献 | 第47-49页 |
| 摘要 | 第49-52页 |
| ABSTRACT | 第52-55页 |
| 致谢 | 第55-56页 |
| 导师及作者简介 | 第56页 |