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利用ISSR和COI序列标记分析不同地理仿刺参群体的遗传多样性

摘要第1-7页
1 前言第7-23页
   ·仿刺参的研究概况第7-9页
     ·仿刺参的分类地位和分布区域第7页
     ·仿刺参的外部形态第7-8页
     ·海参相关基因的研究第8-9页
   ·遗传多样性和常用的研究技术第9-13页
     ·遗传多样性的研究技术——遗传标记的发展及其类型第11-13页
   ·分子标记的分类第13-16页
     ·RAPD第14-15页
     ·RFLP第15页
     ·AFLP第15-16页
     ·DNA指纹图谱第16页
   ·ISSR分子标记技术第16-18页
     ·ISSR分子标记技术的原理第16页
     ·ISSR分子标记技术的优点第16-17页
     ·ISSR分子标记技术的应用第17-18页
   ·用于分子系统学研究的主要基因第18-21页
     ·核基因第18-19页
     ·线粒体基因组第19-20页
     ·线粒体基因组的遗传与进化第20页
     ·mtDNA各部分适用的分类阶元及其研究进展第20-21页
     ·CO I基因的应用第21页
   ·本文的研究目的和意义第21-23页
2 材料与方法第23-38页
   ·实验材料及仪器、试剂第23-27页
     ·实验材料第23页
     ·主要仪器与试剂第23-27页
   ·实验方案第27-28页
   ·ISSR的研究方法第28-32页
     ·基因组DNA的提取第28页
     ·DNA模板的检测第28页
     ·ISSR-PCR反应体系和反应条件的建立第28-30页
     ·ISSR-PCR产物的检测第30-31页
     ·ISSR谱带的记录第31页
     ·ISSR数据的统计分析第31-32页
   ·CO I序列的研究方法第32-38页
     ·基因组DNA的提取方法第32-33页
     ·DNA模板的检测第33页
     ·引物的来源第33页
     ·CO I-PCR反应体系的建立第33-34页
     ·CO I-PCR产物的检测第34-35页
     ·目的片段的回收第35页
     ·再次PCR第35页
     ·琼脂糖切胶回收第35-36页
     ·乙醇精制第36页
     ·DNA测序第36页
     ·CO I序列的分析第36-37页
     ·仿刺参CO I区段基因的系统发育学分析第37-38页
3 结果与分析第38-57页
   ·DNA提取结果第38-39页
   ·ISSR-PCR反应第39-47页
     ·ISSR-PCR反应参数的调整第39-40页
     ·ISSR扩增结果第40-42页
     ·多态位点比率(P)第42-43页
     ·有效等位基因数(ne~*)第43-44页
     ·利用Shannon指数(I~*)估测仿刺参各地理亚群的遗传多样性第44页
     ·利用Nei指数(H~*)估测仿刺参各亚群间及各亚群内的遗传分化第44-46页
     ·仿刺参各亚群间遗传一致度与遗传聚类分析第46-47页
   ·仿刺参CO I序列的分析第47-57页
     ·CO I-PCR反应参数的调整结果第47-48页
     ·CO I-PCR扩增及其回收第48页
     ·PCR产物测序分析第48-53页
     ·CO I序列的突变位点和信息位点的分析第53-54页
     ·利用CO I序列构建仿刺参的分子系统树第54-57页
4 讨论第57-65页
   ·种群的遗传多样性及多态现象第57-59页
   ·种质资源分析第59-60页
   ·基因流第60-61页
   ·实验方法的优化第61-64页
     ·DNA的提取第61页
     ·引物的设计原则第61-62页
     ·关于PCR体系优化第62-63页
     ·ISSR反应的可重复性和可信性第63-64页
   ·ISSR分子标记的特点及可应用性第64-65页
5 结论第65-66页
Abstract第66-68页
参考文献第68-77页
致谢第77-78页
学位论文独创性声明第78页
学位论文版权的使用授权书第78页

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