| 摘要 | 第1-6页 |
| Abstract | 第6-10页 |
| 英文缩略表 | 第10-11页 |
| 第一章 文献综述 | 第11-28页 |
| ·动物免疫学基础 | 第11-13页 |
| ·固有免疫 | 第11-12页 |
| ·适应性免疫 | 第12页 |
| ·胸腺和脾脏 | 第12-13页 |
| ·IgG 免疫学意义 | 第13页 |
| ·异嗜性粒细胞和淋巴细胞 | 第13页 |
| ·抗病育种 | 第13-15页 |
| ·抗病力的遗传基础 | 第14页 |
| ·抗病育种途径 | 第14-15页 |
| ·鸡基因图谱和连锁不平衡分析 | 第15-17页 |
| ·鸡的基因图谱 | 第15-16页 |
| ·鸡的连锁不平衡特性 | 第16-17页 |
| ·基因定位方法 | 第17-18页 |
| ·连锁分析 | 第18页 |
| ·关联分析 | 第18页 |
| ·全基因组关联研究 | 第18-24页 |
| ·全基因关联研究试验设计 | 第19-20页 |
| ·全基因组关联研究多重检验校正 | 第20-22页 |
| ·群体分层 | 第22页 |
| ·GWAS 在人类复杂疾病和性状中的应用 | 第22-23页 |
| ·GWAS 在畜禽中的应用 | 第23-24页 |
| ·ILLUMINA SNP 基因分型技术 | 第24-27页 |
| ·Illumina 光纤微珠芯片原理 | 第24-25页 |
| ·Illumina Infinium 技术原理 | 第25-26页 |
| ·SNP 基因分型数据的质控 | 第26-27页 |
| ·本研究的目的和意义 | 第27-28页 |
| 第二章 材料和方法 | 第28-34页 |
| ·试验材料 | 第28-29页 |
| ·试验动物 | 第28页 |
| ·试验仪器 | 第28-29页 |
| ·主要试剂与溶液配制 | 第29页 |
| ·试验方法 | 第29-31页 |
| ·血样采集 | 第29-30页 |
| ·基因组 DNA 提取和检测 | 第30页 |
| ·SNP 分型和质量控制 | 第30页 |
| ·性状表型记录 | 第30-31页 |
| ·数据处理和统计分析 | 第31-34页 |
| ·表型记录统计分析 | 第31-32页 |
| ·样本群体结构检测 | 第32页 |
| ·全基因组关联分析 | 第32-33页 |
| ·连锁不平衡分析 | 第33-34页 |
| 第三章 结果和讨论 | 第34-51页 |
| ·基因组 DNA 检测结果 | 第34页 |
| ·SNP 基因分型及质量控制 | 第34页 |
| ·免疫性状表型数据分析 | 第34-37页 |
| ·描述性统计分析 | 第34-36页 |
| ·正态性检验和转换 | 第36-37页 |
| ·试验鸡群的群体结构 | 第37-39页 |
| ·全基因组关联分析结果 | 第39-45页 |
| ·讨论 | 第45-51页 |
| 第四章 全文结论 | 第51-52页 |
| 参考文献 | 第52-61页 |
| 附录 | 第61-79页 |
| 附录 1 各性状 5%全基因组水平显著 SNP 位点的单体型块分析 | 第61-74页 |
| 附录 2 各性状全基因组关联分析结果中达潜在关联位点信息 | 第74-79页 |
| 致谢 | 第79-80页 |
| 作者简历 | 第80页 |