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野油菜黄单胞菌gum基因簇DNA片段上基因间隔区中的ORF及其功能分析

中文摘要第1-3页
英文摘要第3-7页
第一章 前言第7-19页
   ·野油菜黄单胞菌(Xanthomonas campestris pv.campestris)的概述第7页
   ·胞外多糖(EPS)第7-8页
   ·胞外多糖(EPS)与致病性的关系第8-9页
   ·Xcc胞外多糖(EPS)的分子结构第9-10页
   ·胞外多糖(EPS)的生物合成及调控第10-15页
   ·胞外多糖的粘度第15页
   ·黄单胞菌色素第15-17页
   ·Tn5gusA5转座子第17-18页
   ·本研究工作的目的、内容及意义第18-19页
     ·研究内容第18页
     ·目的意义第18-19页
第二章 材料与方法第19-38页
   ·培养基及培养条件第19-20页
     ·培养基第19页
     ·培养条件第19-20页
   ·抗菌素第20页
   ·溶液,缓冲液和试剂第20-21页
   ·总DNA的提取第21页
   ·DNA质粒的提取第21页
   ·限制性内切酶酶切第21页
   ·DNA连接第21-22页
   ·转化第22页
   ·三亲本接合第22-23页
   ·RNA操作第23-24页
     ·试验器具的处理第23页
     ·溶液处理第23页
     ·操作过程注意事项第23页
     ·Xcc细胞总RNA的提取第23-24页
     ·RNA中DNA的去除第24页
     ·直接从细胞中少量快速提取总DNA第24页
     ·RNA浓度及纯度的测定第24页
     ·RNA快速电泳检测第24页
   ·PCR反应第24-33页
     ·TAIL-PCR用于扩增Tn5 gusA5旁测序列第24-27页
     ·RT-PCR反应第27-31页
     ·整合突变体引物第31页
     ·常规反应PCR反应第31-33页
     ·重复第33页
   ·琼脂糖凝胶电泳第33页
   ·DNA的回收第33-34页
     ·电洗脱法回收DNA片段第33-34页
     ·PCR扩增产物回收第34页
   ·ABI DNA自动测序系统测定DNA序列第34-35页
   ·胞外多糖的分离与提纯第35页
   ·胞外多糖纯度鉴定采用凝胶过滤法第35页
   ·胞外多糖理化特性测定第35-36页
     ·胞外多糖的特性粘度测定第35页
     ·胞外多糖的组分测定第35-36页
   ·胞外酶的平板定性检测第36-37页
     ·胞外蛋白酶的检测第36页
     ·胞外纤维素酶的检测第36-37页
     ·胞外淀粉酶的检测第37页
   ·色素的测定第37页
   ·DSF因子检测第37-38页
第三章 结果与分析第38-48页
   ·Tn5gusA5转座子的极性效应第38-48页
     ·Xcc8004及其gum基因突变体的总RNA第38页
     ·RT-PCR扩增的gum基因簇中的gum基因的DNA片段第38-42页
     ·单一gum基因的Tn5gusA5插入位点前后的RT-PCR扩增的DNA片断第42-48页
第四章 讨论第48-49页
第五章 结果与分析第49-76页
   ·Tn5gusA5突变体在Xcc8004基因组上插入的定位第49-50页
     ·通过TAIL-PCR扩增Tn5gusA5旁侧序列:第49-50页
     ·Tn5gusA5旁侧序列的测定第50页
   ·插入突变体的GUS的活性第50-51页
   ·营养缺陷型鉴定第51页
   ·插入突变体的DSF第51-53页
   ·插入突变体的胞外酶产量第53-54页
   ·插入突变体的胞外多糖产量第54-55页
   ·插入突变体和Xcc8004的色素产量第55-56页
   ·黄原胶的粘度第56-57页
   ·胞外多糖的组份第57-61页
     ·测定结果第57-60页
     ·测定计算结果:第60-61页
   ·gumA-gumB间隔区的转录区段第61-67页
     ·Tn5gusA5插入突变体及Xcc8004的总RNA第62页
     ·Tn5gusA5插入突变体TGL243转录区段的RT-PCR第62-63页
     ·Tn5gusA5插入突变体TGL243位点前后的RT-PCR第63-64页
     ·Tn5gusA5插入突变体TGL233转录区段的RT-PCR第64-66页
     ·Tn5gusA5插入突变体TGL233位点前后的RT-PCR第66-67页
   ·ORF243和ORF233与gum操纵子第67-68页
   ·ORF243和ORF233的整合突变体第68-72页
     ·ORF243和ORF233的内嵌DNA第69-70页
     ·重组质粒的酶切第70-71页
     ·三亲本接合第71页
     ·标准PCR验证整合突变体第71-72页
   ·整合突变体的色素第72-74页
   ·整合突变体胞外多糖的粘度第74-76页
第六章 讨论第76-79页
参考文献第79-88页
致谢第88页

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