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新城疫病毒F48E9株全基因组核苷酸序列测定及表达载体构建

中文摘要第1-12页
英文摘要第12-14页
1 引言第14-29页
 1.1 新城疫病毒分子生物学概述第14-20页
 1.2 RNA病毒反遗传操作研究进展第20-23页
 1.3 新城疫病毒反遗传操作技术研究进展第23-29页
2 材料与方法第29-38页
 2.1 试验材料第29-30页
  2.1.1 病毒第29页
  2.1.2 载体第29页
  2.1.3 菌株与质粒第29页
  2.1.4 实验动物第29页
  2.1.5 主要试剂第29页
  2.1.6 主要仪器第29-30页
 2.2 方法第30-38页
  2.2.1 病毒的增殖第30页
  2.2.2 NDV F48E9株RNA的提取第30页
  2.2.3 NDV F48E9株全基因组的RT-PCR扩增第30-32页
  2.2.4 NDV F48E9株全基因组分段克隆第32-33页
  2.2.5 阳性重组子的筛选与鉴定第33-34页
  2.2.6 NDV F48E9株cDNA低拷贝表达载体的构建第34页
  2.2.7 序列比较第34-35页
  2.2.8 NP-P基因间隔区序列测定第35-38页
3 实验结果第38-53页
 3.1 NDV F48E9株全基因组cDNA克隆第38-40页
  3.1.1 NDV F48E9株各基因的RT-PCR扩增第38页
  3.1.2 NDV F48E9株3’端和5’端的RT-PCR扩增第38页
  3.1.3 NDV F48E9株主要基因cDNA的克隆与鉴定第38-39页
  3.1.4 NDV F48E9株全基因组cDNA核苷酸序列测定第39-40页
 3.2 F48E9株全基因组cDNA低拷贝表达载体的构建第40-44页
  3.2.1 F48E9株基因组3’端亚克隆结果第40-41页
  3.2.2 F48E9株基因组3’端和NP基因的连接第41页
  3.2.3 F48E9株3’端+NP+P连接第41页
  3.2.4 F48E9株3’端+NP+P+M连接第41-42页
  3.2.5 F48E9株L基因与5’端cDNA的连接第42页
  3.2.6 F48E9株基因组全长cDNA低拷贝表达载体的构建第42-44页
  3.2.7 F48E9株全基因组的核苷酸序列测定第44页
 3.3 序列比较第44-50页
  3.3.1 同源性比较第44-45页
  3.3.2 F基因遗传变异分析第45-48页
  3.3.3 HN基因遗传变异分析第48-49页
  3.3.4 L基因遗传变异分析第49-50页
 3.4 NP-P基因间隔区序列测定第50-53页
  3.4.1 NP-P基因间隔区序列RT-PCR扩增及鉴定结果第50页
  3.4.2 NP-P基因间隔区序列比较结果第50页
  3.4.3 NP-P基因间隔区序列核苷酸序列同源性比较第50-53页
4 讨论第53-59页
 4.1 F48E9全基因组cDNA核苷酸序列第53页
 4.2 NDV分离株同源性比较第53-54页
  4.2.1 六株NDV分离株编码基因的核苷酸及氨基酸同源性比较第53页
  4.2.2 F48E9株与其它毒株基因组核苷酸同源性比较第53-54页
 4.3 NP-P基因间隔区6碱基的插入第54页
 4.4 F基因遗传变异分析第54-56页
  4.4.1 F蛋白裂解位点处氨基酸的组成与毒力直接相关第55页
  4.4.2 不同NDV毒株F蛋白的糖基化位点稍有变化第55页
  4.4.3 不同毒株半胱氨酸残基(Cys)的数目与位置有所差异第55-56页
 4.5 HN基因遗传变异分析第56-57页
  4.5.1 糖基化位点的变化第56页
  4.5.2 半胱氨酸数目的变化第56-57页
 4.6 L基因遗传分析第57页
 4.7 基因起始与终止信号的序列比较第57-58页
 4.8 方法学上的改进第58-59页
  4.8.1 F48E9株3’端RT-PCR第58页
  4.8.2 不同连接策略的比较第58-59页
5 结论第59-60页
参考文献第60-69页
附录第69-90页
攻读学位期间发表文章情况第90-91页
致谢第91-92页
作者简历第92页

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