| 本文所用到的英文名称及缩写 | 第1-12页 |
| 中文摘要 | 第12-14页 |
| 英文摘要 | 第14-16页 |
| 前 言 | 第16-18页 |
| 第一篇 文献综述 | 第18-69页 |
| 第一章 鸡传染性支气管炎概论 | 第18-45页 |
| 一、 简介 | 第18-19页 |
| 二、 病原学 | 第19-20页 |
| （一） 分类 | 第19页 |
| （二） 形态学 | 第19-20页 |
| （三） 化学组成 | 第20页 |
| （四） 病毒的复制 | 第20页 |
| 三、 理化因素的影响 | 第20-22页 |
| （一） 温度 | 第20-21页 |
| （二） 冻干 | 第21页 |
| （三） PH稳定性 | 第21页 |
| （四） 化学因素的影响 | 第21页 |
| （五） 血凝性 | 第21-22页 |
| （六） 干扰现象 | 第22页 |
| （七） 毒株分类 | 第22页 |
| 四、 病毒的培养 | 第22-24页 |
| （一） 鸡胚培养 | 第22-23页 |
| （二） 细胞培养 | 第23-24页 |
| （三） 器官培养 | 第24页 |
| 五、 致病性 | 第24-25页 |
| 六、 致病机理和流行病学 | 第25-26页 |
| 七、 潜伏期 | 第26页 |
| 八、 IB的临床症状 | 第26-27页 |
| 九、 组织病理学变化 | 第27-28页 |
| 十、 免疫 | 第28-29页 |
| 十一、 诊断 | 第29页 |
| 十二、 病毒的分离和鉴定 | 第29-31页 |
| （一） 病毒分离： | 第29-30页 |
| （二） 病毒的鉴定 | 第30-31页 |
| 十三、 IBV的血清型： | 第31-33页 |
| 参考文献 | 第33-45页 |
| 第二章 鸡传染性支气管炎病毒分子生物学研究进展 | 第45-56页 |
| 一、 IBV基因组结构及其编码产物 | 第45-47页 |
| 二、 IBV结构蛋白 | 第47-50页 |
| （一） S蛋白 | 第47-49页 |
| （二） M蛋白 | 第49-50页 |
| （三） N蛋白 | 第50页 |
| 三、 IBV结构蛋白的免疫活性 | 第50-56页 |
| 第三章 传染性支气管炎病毒分子流行病学研究进展 | 第56-69页 |
| 一、 传染性支气管炎的临床表现型的变化 | 第56-57页 |
| 二、 传染性支气管炎病毒的血清型研究进展 | 第57-58页 |
| 三、 单克隆抗体分析 | 第58-59页 |
| 四、 传染性支气管炎病毒的血凝和血凝抑制（HA和HI）分型研究 | 第59-60页 |
| 五、 传染性支气管炎病毒的分子流行病学研究现状 | 第60-65页 |
| （一） 寡核苷酸指纹图分析 | 第60-61页 |
| （二） PCR及RFLP | 第61页 |
| （三） 传染性支气管炎病毒基因变异与蛋白质变异的分子流行病学研究。 | 第61-65页 |
| 参考文献 | 第65-69页 |
| 第二篇 研究报告 | 第69-115页 |
| 第四章 鸡传染性支气管炎病毒鉴定方法的研究 | 第69-83页 |
| 一 IBV的鸡胚矮小化试验 | 第69-71页 |
| 1 材料 | 第69-70页 |
| 1．1 病毒 | 第69-70页 |
| 1．2 鸡胚 | 第70页 |
| 2 方法 | 第70-71页 |
| 2．1 病料处理 | 第70页 |
| 2．2 鸡胚接种 | 第70页 |
| 2．3 鸡胚传代 | 第70页 |
| 2．4 结果判定 | 第70-71页 |
| 3 结果 | 第71页 |
| 4 讨论 | 第71页 |
| 二 IBV的单克隆抗体-斑点酶联免疫吸附试验（DOT-ELISA） | 第71-73页 |
| 1． 材料 | 第71-72页 |
| 1．1 病毒 | 第71页 |
| 1．2 单克隆抗体 | 第71页 |
| 1．3 其他 | 第71-72页 |
| 2． 方法 | 第72页 |
| 3 结果 | 第72页 |
| 4 讨论 | 第72-73页 |
| 三 IBV的核酸探针杂交检测方法（DOT-BLOT） | 第73-76页 |
| 1 材料 | 第73页 |
| 1．1 病毒 | 第73页 |
| 1．2 作为探针的核酸 | 第73页 |
| 2 方法 | 第73-74页 |
| 2．1 用于制备探针的核酸的获得 | 第73页 |
| 2．2 探针标记 | 第73页 |
| 2．3 样品RNA的提取 | 第73页 |
| 2．4 斑点杂交 | 第73-74页 |
| 3 结果 | 第74页 |
| 4 讨论 | 第74-76页 |
| 小结 | 第76-82页 |
| 参考文献 | 第82-83页 |
| 第五章 传染性支气管炎病毒RT-PCR方法研究 | 第83-99页 |
| 一． 传染性支气管炎病毒S1全基因的RT-PCR研究 | 第83-89页 |
| 1 材料和方法 | 第84-87页 |
| 1．1 材料 | 第84页 |
| 1．1．1 病毒 | 第84页 |
| 1．1．2 试剂 | 第84页 |
| 1．1．3 引物 | 第84页 |
| 1．2 方法 | 第84-87页 |
| 1．2．1 病毒的增殖与浓缩 | 第84页 |
| 1．2．2 病毒纯化 | 第84-85页 |
| 1．2．3 RNA提取 | 第85页 |
| 1．2．4 RT-PCR | 第85页 |
| 1．2．5 反应体系中各种反应物最佳浓度的优化 | 第85-86页 |
| 1．2．6 不同RNA提取方法对RT-PCR反应结果的影响 | 第86页 |
| 1．2．7 不同反转录酶对IBV完整S1基因扩增的影响 | 第86页 |
| 1．2．8 RT-PCR产物的检测 | 第86-87页 |
| 2 结果 | 第87-88页 |
| 2．1 M41RT-PCR扩增结果 | 第87页 |
| 2．2 反应物最佳浓度结果 | 第87页 |
| 2．3 不同RNA提取方法比较结果 | 第87页 |
| 2．4 不同反转录酶使用效果比较 | 第87页 |
| 2．4 用优化的条件对IBV地方分离株扩增效果 | 第87-88页 |
| 3 讨论： | 第88-89页 |
| 二、 传染性支气管炎病毒核蛋白（N）基因的RT-PCR研究 | 第89-95页 |
| 1 材料和方法 | 第90-92页 |
| 1．1 病毒 | 第90页 |
| 1．2 试剂 | 第90页 |
| 1．3 引物 | 第90页 |
| 1．4 实验步骤 | 第90-92页 |
| 1．5 RT-PCR产物检测 | 第92页 |
| 1．6 二次PCR | 第92页 |
| 1．7 基因测序 | 第92页 |
| 1．8 序列分析 | 第92页 |
| 2 结果 | 第92-93页 |
| 3 讨论 | 第93-95页 |
| 英文摘要 | 第95-96页 |
| 参考文献 | 第96-99页 |
| 第六章 我国传染性支气管炎病毒地方流行株的序列测定与分子流行病学研究 | 第99-115页 |
| 1 材料和方法 | 第100-101页 |
| 1．1 材料 | 第100页 |
| 1．1．1 病毒 | 第100页 |
| 1．1．2 质粒及菌种 | 第100页 |
| 1．1．3 试剂 | 第100页 |
| 1．1．4 序列分析软件与IBV毒株序列来源 | 第100页 |
| 1．2 方法 | 第100-101页 |
| 1．2．1 PCR产物的回收与纯化 | 第100页 |
| 1．2．2 PCR产物与T载体的连接 | 第100-101页 |
| 1．2．3 连接产物的转化与重组质粒的鉴定 | 第101页 |
| 1．2．4 序列测定 | 第101页 |
| 1．2．5 IBV各毒株S1基因与蛋白序列发生进化关系分析 | 第101页 |
| 1．2．6 IBV地方分离毒株JS/95/03 N基因序列发生进化树分析 | 第101页 |
| 2． 结果 | 第101-103页 |
| 2．1 不同毒株的S1基因扩增结果 | 第101-102页 |
| 2．2 S1基因的克隆与鉴定结果 | 第102页 |
| 2．3 不同毒株S1基因序列测定结果 | 第102页 |
| 2．4 IBV国内分离毒株的S1全基因系统发生进化关系分析 | 第102-103页 |
| 2．5 地方毒株JS/95/03 N基因的系统发生进化关系分析 | 第103页 |
| 2．6 S1基因与N基因综合分析结果 | 第103页 |
| 3． 讨论 | 第103-113页 |
| 英文摘要 | 第113-114页 |
| 参考文献 | 第114-115页 |
| 全文总结 | 第115-117页 |
| 附录： 本研究中被GENBANKI收录的序列 | 第117-134页 |
| 论文发表情况 | 第134页 |
