摘要 | 第1-14页 |
ABSTRACT | 第14-16页 |
第一章 香蕉枯萎病菌生物学与检测技术研究综述 | 第16-28页 |
1 香蕉枯萎病菌生物学 | 第16-21页 |
·香蕉枯萎病菌鉴定与培养特性 | 第16-17页 |
·病原菌传播侵染和发病条件 | 第17页 |
·香蕉枯萎病诊断 | 第17-18页 |
·香蕉枯萎病生理分化现象 | 第18-19页 |
·香蕉枯萎病分布 | 第19-21页 |
2 香蕉枯萎病菌检测 | 第21-27页 |
·营养体亲和性(VCG)检测 | 第21页 |
·利用鉴别寄主检测鉴定 | 第21页 |
·鉴别培养基检测鉴定 | 第21-22页 |
·分子生物学检测 | 第22-26页 |
·rDNA-ITS 区序列分析 | 第23-24页 |
·RFLP 技术的应用 | 第24页 |
·随机扩增多态性DNA | 第24-25页 |
·序列特征扩增区域SCAR | 第25-26页 |
·分子标记技术在尖孢镰刀菌鉴定中的应用 | 第26-27页 |
3 本研究的意义和内容 | 第27-28页 |
·研究意义 | 第27页 |
·本研究的主要内容 | 第27-28页 |
第二章 蕉苗及蕉园土壤菌物及镰刀菌区系 | 第28-49页 |
1 材料与方法 | 第28-33页 |
·采样地点及样本类型 | 第28页 |
·土壤真菌分离 | 第28-29页 |
·土壤稀释涂布分离 | 第28-29页 |
·组织分离 | 第29页 |
·分离培养方法 | 第29页 |
·形态学鉴定 | 第29-30页 |
·镰刀菌rDNA-ITS 分析 | 第30-33页 |
2 结果与分析 | 第33-48页 |
·蕉园土壤和蕉苗根际真菌种类鉴定和描述 | 第33-47页 |
·根霉Rhizopus sp | 第33页 |
·毛霉Mucor sp. | 第33-34页 |
·单顶孢 Monacrosporium sp. | 第34页 |
·小克银汉霉Cunninghamella sp | 第34-35页 |
·黑曲霉Aspergillus niger | 第35-36页 |
·黄曲霉Aspergillus flavus | 第36-37页 |
·淡紫拟青霉Paecilomyces lilacinus | 第37页 |
·炭疽菌colletotrichum sp | 第37-38页 |
·明枝霉 Hyalodendron sp | 第38页 |
·青霉penicillium sp | 第38-39页 |
·丝核菌Rhizoctonia sp | 第39-40页 |
·绿色木霉 Trichoderma viride | 第40页 |
·链格孢 Alternaria sp | 第40-41页 |
·腐霉 Pythium sp. | 第41页 |
·弯孢霉Curvularia sp | 第41-42页 |
·尖孢镰孢F. oxysporum | 第42-43页 |
·尖孢镰孢芬芳变种F. oxysporum var. redolens | 第43页 |
·半祼镰孢F. semitectum | 第43-44页 |
·茄病镰孢F. solani | 第44页 |
·串珠镰孢F. moniliforme | 第44-45页 |
·木贼镰孢F. equiseti | 第45-46页 |
·蕉苗携菌及蕉园土壤真菌区系分析 | 第46-47页 |
·镰刀菌区系及RDNA-ITS 区序列分析比较 | 第47-48页 |
·镰刀菌rDNA-ITS 的PCR 扩增 | 第47-48页 |
·镰刀菌rDNA-ITS 系统进化树 | 第48页 |
3. 讨论 | 第48-49页 |
第三章 双重选择鉴别培养检测香蕉枯萎病菌4 号生理小种 | 第49-56页 |
1 材料与方法 | 第49-52页 |
·采样地点及样本类型 | 第49页 |
·KM 鉴别培养基的配方 | 第49-50页 |
·土壤悬浮液中选择性抑菌剂筛选 | 第50页 |
·土壤悬浮液中抑菌剂最适浓度测定 | 第50页 |
·土壤悬浮液中抑菌剂作用时间测定 | 第50页 |
·KM 鉴别培养基双重选择鉴别效果 | 第50-51页 |
·KM 鉴别培养基双重选择检出菌的致病性测定 | 第51-52页 |
2 结果与分析 | 第52-55页 |
·土壤悬浮液中抑菌剂筛选 | 第52页 |
·土壤悬浮液中抑菌剂最适浓度 | 第52-53页 |
·土壤悬浮液中抑菌剂作用时间 | 第53页 |
·KM 培养基双重选择检测结果 | 第53-54页 |
·KM 培养基双重选择检出菌致病性测定 | 第54-55页 |
3 讨论 | 第55-56页 |
第四章 香蕉枯萎病菌生理小种营养亲和性检测技术 | 第56-61页 |
1 材料与方法 | 第56-59页 |
·供试菌株 | 第56-57页 |
·培养基的种类和配方 | 第57页 |
·nit 突变体的诱导和表型鉴定 | 第57页 |
·nit 突变株间亲和性和亲和群测定 | 第57-59页 |
2 结果与分析 | 第59-60页 |
·nit 突变体的筛选和鉴定 | 第59页 |
·营养体亲和群测定结果 | 第59-60页 |
3 讨论 | 第60-61页 |
第五章 香蕉枯萎病菌生理小种的分子生物学检测 | 第61-108页 |
第一节 香蕉枯萎病菌基因组DNA 提取方法比较 | 第61-69页 |
1 材料与方法 | 第61-66页 |
·供试菌株 | 第61页 |
·麦粒培养基制作 | 第61页 |
·供试菌株培养与分生孢子收集 | 第61页 |
·分生孢子DNA 提取 | 第61-62页 |
·菌丝体的收集及其DNA 提取 | 第62-63页 |
·DNA 质量检测 | 第63页 |
·基因组DNA 的ITS-PCR 分析 | 第63-64页 |
·基因组DNA 的RAPD-PCR 扩增 | 第64-66页 |
2 结果与分析 | 第66-68页 |
·不同提取材料DNA 质量纯度和浓度分析 | 第66-67页 |
·基因组DNA 的PCR 扩增 | 第67-68页 |
3 讨论 | 第68-69页 |
第二节 香蕉枯萎病菌RDNA-ITS 区序列分析 | 第69-75页 |
1. 材料与方法 | 第69-72页 |
·供试菌株 | 第69-70页 |
·菌株DNA 提取 | 第70页 |
·香蕉枯萎病菌rDNA-ITS 区PCR 扩增 | 第70-71页 |
·PCR 产物克隆、测序与序列分析 | 第71-72页 |
2 结果与分析 | 第72-74页 |
·香蕉枯萎病菌的ITS-PCR 扩增 | 第72-73页 |
·香蕉枯萎病菌的ITS 区序列分析 | 第73-74页 |
3 讨论 | 第74-75页 |
第三节 香蕉枯萎病菌的RAPD 分析 | 第75-83页 |
1 材料与方法 | 第75-79页 |
·供试菌株 | 第75-76页 |
·供试菌株DNA 提取 | 第76-77页 |
·RAPD 引物 | 第77页 |
·RAPD 反应体系的优化和最适退火温度的确定 | 第77-78页 |
·数据分析 | 第78-79页 |
2 结果与分析 | 第79-82页 |
·RAPD 反应体系优化 | 第79-80页 |
·RAPD 图谱分析 | 第80-82页 |
3 讨论 | 第82-83页 |
第四节 RAPD 特异条带的SCAR 标记转化 | 第83-94页 |
1 供试菌株 | 第83-89页 |
·供试菌株 | 第83-84页 |
·RAPD 引物的筛选 | 第84页 |
·RAPD-PCR 反应体系 | 第84-85页 |
·特异性DNA 片段的回收 | 第85-86页 |
·回收产物的克隆 | 第86-88页 |
·SCAR 标记的转化 | 第88-89页 |
2 结果与分析 | 第89-93页 |
·筛选获得随机引物 | 第89页 |
·获得RAPD 特异片段 | 第89-90页 |
·RAPD 特异片段酶切鉴定及测序 | 第90-92页 |
·SCAR 标记的建立 | 第92-93页 |
3 讨论 | 第93-94页 |
第五节 ITS-SCAR 双重PCR 检测技术体系构建 | 第94-101页 |
1 材料与方法 | 第94-97页 |
·供试菌株 | 第94页 |
·供试菌株DNA 提取 | 第94-95页 |
·SCAR-PCR 引物 | 第95页 |
·ITS-PCR 引物设计 | 第95-96页 |
·检测体系测试 | 第96-97页 |
2 结果 | 第97-99页 |
·引物专化性测试 | 第97-98页 |
·检测体系参数的优化 | 第98页 |
·检测体系敏感度的测试 | 第98页 |
·ITS-SCAR 反应体系 | 第98-99页 |
·双重PCR 扩增 | 第99页 |
3 小结与讨论 | 第99-101页 |
第六节 ITS-SCAR 检测技术应用 | 第101-108页 |
1 材料与方法 | 第101-104页 |
·鉴别寄主 | 第101页 |
·供试菌株 | 第101页 |
·供试菌株DNA 提取 | 第101页 |
·接种香蕉苗的检测 | 第101-102页 |
·吸芽检测 | 第102页 |
·香蕉基因组DNA 提取 | 第102-103页 |
·ITS-SCAR 检测体系 | 第103-104页 |
2 结果 | 第104-107页 |
·接种蕉苗发病情况 | 第104页 |
·接种蕉苗及田间检测 | 第104-107页 |
3 小结与讨论 | 第107-108页 |
第六章 总结与展望 | 第108-112页 |
1 研究结果 | 第108-109页 |
·蕉苗携菌及蕉园土壤真菌区系分析 | 第108页 |
·香蕉枯萎病菌的生物学检测 | 第108页 |
·香蕉枯萎病菌分子生物学检测 | 第108-109页 |
2 特色与创新 | 第109-110页 |
·蕉苗携菌及蕉园土壤真菌区系分析 | 第109-110页 |
·生物学检测创新 | 第110页 |
·基因组DNA 提取方法改进 | 第110页 |
·ITS-SCAR 双重PCR 检测香蕉枯萎病菌生理小种 | 第110页 |
3 展望 | 第110-112页 |
·KM 培养基双重抑菌检测香蕉枯萎病菌4 号生理小种 | 第110-111页 |
·ITS-SCAR 双重PCR 检测香蕉枯萎病菌 | 第111页 |
·香蕉枯萎病菌防控 | 第111-112页 |
参考文献 | 第112-125页 |
附录1:镰刀菌RDNA-ITS 测序结果 | 第125-128页 |
附录2:主要培养基及试剂与溶液的配制 | 第128-131页 |
图表目录 | 第131-133页 |
攻博期间发表的相关论文 | 第133-134页 |
致谢 | 第134页 |