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香蕉枯萎病菌生理小种检测技术研究

摘要第1-14页
ABSTRACT第14-16页
第一章 香蕉枯萎病菌生物学与检测技术研究综述第16-28页
 1 香蕉枯萎病菌生物学第16-21页
   ·香蕉枯萎病菌鉴定与培养特性第16-17页
   ·病原菌传播侵染和发病条件第17页
   ·香蕉枯萎病诊断第17-18页
   ·香蕉枯萎病生理分化现象第18-19页
   ·香蕉枯萎病分布第19-21页
 2 香蕉枯萎病菌检测第21-27页
   ·营养体亲和性(VCG)检测第21页
   ·利用鉴别寄主检测鉴定第21页
   ·鉴别培养基检测鉴定第21-22页
   ·分子生物学检测第22-26页
     ·rDNA-ITS 区序列分析第23-24页
     ·RFLP 技术的应用第24页
     ·随机扩增多态性DNA第24-25页
     ·序列特征扩增区域SCAR第25-26页
   ·分子标记技术在尖孢镰刀菌鉴定中的应用第26-27页
 3 本研究的意义和内容第27-28页
   ·研究意义第27页
   ·本研究的主要内容第27-28页
第二章 蕉苗及蕉园土壤菌物及镰刀菌区系第28-49页
 1 材料与方法第28-33页
   ·采样地点及样本类型第28页
   ·土壤真菌分离第28-29页
     ·土壤稀释涂布分离第28-29页
     ·组织分离第29页
   ·分离培养方法第29页
   ·形态学鉴定第29-30页
   ·镰刀菌rDNA-ITS 分析第30-33页
 2 结果与分析第33-48页
   ·蕉园土壤和蕉苗根际真菌种类鉴定和描述第33-47页
     ·根霉Rhizopus sp第33页
     ·毛霉Mucor sp.第33-34页
     ·单顶孢 Monacrosporium sp.第34页
     ·小克银汉霉Cunninghamella sp第34-35页
     ·黑曲霉Aspergillus niger第35-36页
     ·黄曲霉Aspergillus flavus第36-37页
     ·淡紫拟青霉Paecilomyces lilacinus第37页
     ·炭疽菌colletotrichum sp第37-38页
     ·明枝霉 Hyalodendron sp第38页
     ·青霉penicillium sp第38-39页
     ·丝核菌Rhizoctonia sp第39-40页
     ·绿色木霉 Trichoderma viride第40页
     ·链格孢 Alternaria sp第40-41页
     ·腐霉 Pythium sp.第41页
     ·弯孢霉Curvularia sp第41-42页
     ·尖孢镰孢F. oxysporum第42-43页
     ·尖孢镰孢芬芳变种F. oxysporum var. redolens第43页
     ·半祼镰孢F. semitectum第43-44页
     ·茄病镰孢F. solani第44页
     ·串珠镰孢F. moniliforme第44-45页
     ·木贼镰孢F. equiseti第45-46页
     ·蕉苗携菌及蕉园土壤真菌区系分析第46-47页
   ·镰刀菌区系及RDNA-ITS 区序列分析比较第47-48页
     ·镰刀菌rDNA-ITS 的PCR 扩增第47-48页
     ·镰刀菌rDNA-ITS 系统进化树第48页
 3. 讨论第48-49页
第三章 双重选择鉴别培养检测香蕉枯萎病菌4 号生理小种第49-56页
 1 材料与方法第49-52页
   ·采样地点及样本类型第49页
   ·KM 鉴别培养基的配方第49-50页
   ·土壤悬浮液中选择性抑菌剂筛选第50页
   ·土壤悬浮液中抑菌剂最适浓度测定第50页
   ·土壤悬浮液中抑菌剂作用时间测定第50页
   ·KM 鉴别培养基双重选择鉴别效果第50-51页
   ·KM 鉴别培养基双重选择检出菌的致病性测定第51-52页
 2 结果与分析第52-55页
   ·土壤悬浮液中抑菌剂筛选第52页
   ·土壤悬浮液中抑菌剂最适浓度第52-53页
   ·土壤悬浮液中抑菌剂作用时间第53页
   ·KM 培养基双重选择检测结果第53-54页
   ·KM 培养基双重选择检出菌致病性测定第54-55页
 3 讨论第55-56页
第四章 香蕉枯萎病菌生理小种营养亲和性检测技术第56-61页
 1 材料与方法第56-59页
   ·供试菌株第56-57页
   ·培养基的种类和配方第57页
   ·nit 突变体的诱导和表型鉴定第57页
   ·nit 突变株间亲和性和亲和群测定第57-59页
 2 结果与分析第59-60页
   ·nit 突变体的筛选和鉴定第59页
   ·营养体亲和群测定结果第59-60页
 3 讨论第60-61页
第五章 香蕉枯萎病菌生理小种的分子生物学检测第61-108页
 第一节 香蕉枯萎病菌基因组DNA 提取方法比较第61-69页
  1 材料与方法第61-66页
   ·供试菌株第61页
   ·麦粒培养基制作第61页
   ·供试菌株培养与分生孢子收集第61页
   ·分生孢子DNA 提取第61-62页
   ·菌丝体的收集及其DNA 提取第62-63页
   ·DNA 质量检测第63页
   ·基因组DNA 的ITS-PCR 分析第63-64页
   ·基因组DNA 的RAPD-PCR 扩增第64-66页
  2 结果与分析第66-68页
   ·不同提取材料DNA 质量纯度和浓度分析第66-67页
   ·基因组DNA 的PCR 扩增第67-68页
  3 讨论第68-69页
 第二节 香蕉枯萎病菌RDNA-ITS 区序列分析第69-75页
  1. 材料与方法第69-72页
   ·供试菌株第69-70页
   ·菌株DNA 提取第70页
   ·香蕉枯萎病菌rDNA-ITS 区PCR 扩增第70-71页
   ·PCR 产物克隆、测序与序列分析第71-72页
  2 结果与分析第72-74页
   ·香蕉枯萎病菌的ITS-PCR 扩增第72-73页
   ·香蕉枯萎病菌的ITS 区序列分析第73-74页
  3 讨论第74-75页
 第三节 香蕉枯萎病菌的RAPD 分析第75-83页
  1 材料与方法第75-79页
   ·供试菌株第75-76页
   ·供试菌株DNA 提取第76-77页
   ·RAPD 引物第77页
   ·RAPD 反应体系的优化和最适退火温度的确定第77-78页
   ·数据分析第78-79页
  2 结果与分析第79-82页
   ·RAPD 反应体系优化第79-80页
   ·RAPD 图谱分析第80-82页
  3 讨论第82-83页
 第四节 RAPD 特异条带的SCAR 标记转化第83-94页
  1 供试菌株第83-89页
   ·供试菌株第83-84页
   ·RAPD 引物的筛选第84页
   ·RAPD-PCR 反应体系第84-85页
   ·特异性DNA 片段的回收第85-86页
   ·回收产物的克隆第86-88页
   ·SCAR 标记的转化第88-89页
  2 结果与分析第89-93页
   ·筛选获得随机引物第89页
   ·获得RAPD 特异片段第89-90页
   ·RAPD 特异片段酶切鉴定及测序第90-92页
   ·SCAR 标记的建立第92-93页
  3 讨论第93-94页
 第五节 ITS-SCAR 双重PCR 检测技术体系构建第94-101页
  1 材料与方法第94-97页
   ·供试菌株第94页
   ·供试菌株DNA 提取第94-95页
   ·SCAR-PCR 引物第95页
   ·ITS-PCR 引物设计第95-96页
   ·检测体系测试第96-97页
  2 结果第97-99页
   ·引物专化性测试第97-98页
   ·检测体系参数的优化第98页
   ·检测体系敏感度的测试第98页
   ·ITS-SCAR 反应体系第98-99页
   ·双重PCR 扩增第99页
  3 小结与讨论第99-101页
 第六节 ITS-SCAR 检测技术应用第101-108页
  1 材料与方法第101-104页
   ·鉴别寄主第101页
   ·供试菌株第101页
   ·供试菌株DNA 提取第101页
   ·接种香蕉苗的检测第101-102页
   ·吸芽检测第102页
   ·香蕉基因组DNA 提取第102-103页
   ·ITS-SCAR 检测体系第103-104页
  2 结果第104-107页
   ·接种蕉苗发病情况第104页
   ·接种蕉苗及田间检测第104-107页
  3 小结与讨论第107-108页
第六章 总结与展望第108-112页
 1 研究结果第108-109页
   ·蕉苗携菌及蕉园土壤真菌区系分析第108页
   ·香蕉枯萎病菌的生物学检测第108页
   ·香蕉枯萎病菌分子生物学检测第108-109页
 2 特色与创新第109-110页
   ·蕉苗携菌及蕉园土壤真菌区系分析第109-110页
   ·生物学检测创新第110页
   ·基因组DNA 提取方法改进第110页
   ·ITS-SCAR 双重PCR 检测香蕉枯萎病菌生理小种第110页
 3 展望第110-112页
   ·KM 培养基双重抑菌检测香蕉枯萎病菌4 号生理小种第110-111页
   ·ITS-SCAR 双重PCR 检测香蕉枯萎病菌第111页
   ·香蕉枯萎病菌防控第111-112页
参考文献第112-125页
附录1:镰刀菌RDNA-ITS 测序结果第125-128页
附录2:主要培养基及试剂与溶液的配制第128-131页
图表目录第131-133页
攻博期间发表的相关论文第133-134页
致谢第134页

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