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甘蓝型油菜及其亲本物种TTG1和TT18基因家族的克隆与比较基因组学研究

摘要第1-13页
ABSTRACT第13-19页
第1章 文献综述第19-37页
   ·芸薹属物种特点第19-21页
     ·芸薹属的起源和亲缘关系第19页
     ·甘蓝型油菜、甘蓝、白菜的基本特征第19-21页
   ·芸薹属比较基因组学研究第21-22页
   ·油菜黄籽性状的研究进展第22-27页
     ·油菜黄籽性状的优势第22-23页
     ·油菜黄籽性状形成的解剖、生理和生化机理研究进展第23-24页
     ·油菜黄籽性状的遗传学和分子生物学研究进展第24-26页
     ·甘蓝型油菜黄籽性状的育种成就和存在的问题第26-27页
   ·类黄酮生物合成途径的研究进展第27-33页
     ·类黄酮物质的特点和在植物体内的生理功能第27页
     ·类黄酮物质生物合成的一般途径第27-28页
     ·类黄酮合成途径的分子生物学研究第28-32页
     ·透明种皮基因(transparent testa,tt)研究第32-33页
   ·TRANSPARENT TESTA GLABRA 1(TTG1)基因特征及相关研究进展第33-34页
   ·TRANSPARENT TESTA 18(TT18)基因特征及相关研究进展第34-37页
第2章 引言第37-41页
第3章 甘蓝型油菜及其亲本物种TTG1基因家族的克隆与比较基因组学研究第41-93页
   ·材料与方法第41-56页
     ·植物材料、载体和菌种第41页
     ·试剂和试剂盒第41-43页
     ·主要仪器第43页
     ·基因组总DNA的提取(CTAB法)第43-44页
     ·总RNA的提取第44页
     ·质粒提取第44-45页
     ·总cDNA的获得(Rapid amplification of cDNA ends,RACE法)第45-48页
     ·BnTTG1、BoTTG1和BrTTG1基因家族5'和3'cDNA末端扩增第48-50页
     ·亚克隆和测序第50-52页
     ·Southern blot分析第52-54页
     ·BnTTG1、BoTTG1和BrTTG1基因家族组织特异性的半定量RT-PCR第54-56页
   ·结果与分析第56-86页
     ·核酸提取和总cDNA的获得第56-57页
       ·BnTTG1、BrTTG1和BoTTG1基因家族各成员的序列克隆第57-61页
     ·BnTTG1、BrTTG1和BoTTG1基因家族的核苷酸序列分析第61-67页
     ·BnTTG1、BoTTG1和BrTTG1核酸水平的同源性和进化关系第67-73页
       ·BnTTG1、BoTTG1和BrTTG1编码蛋白的分析第73-81页
     ·BnTTG1、BoTTG1和BrTTG1基因家族可能的成员数第81-82页
     ·BnTTG1、BoTTG1和BrTTG1基因家族成员的组织特异性检测第82-84页
     ·BnTTG1、BoTTG1和BrTTG1基因家族在本课题组育成的甘蓝型油菜、甘蓝 和白菜的黑、黄籽材料表达差异分析第84-86页
   ·讨论第86-91页
     ·BnTTG1、BoTTG1和BrTTG1基因家族是拟南芥TTG1的垂直同源基因第86页
     ·关于芸薹属物种的TTG1基因的拷贝数第86-88页
     ·关于甘蓝型油菜与白菜和甘蓝之间的进化关系第88-89页
     ·TTG1基因定向进化特别反应了碱基的物种偏好性第89页
     ·TTG1和AN11类WD40蛋白在蛋白水平具有极度保守性第89-90页
     ·TTG1与甘蓝型油菜、甘蓝、白菜的黄籽材料形成的关系第90页
     ·芸薹属TTG1基因的一些值得关注的结构特征第90-91页
   ·结论第91-93页
     ·系统地克隆了甘蓝型油菜及其亲本物种TTG1基因家族的全长序列第91页
     ·甘蓝型油菜及其亲本物种TTG1家族的蛋白结构特征第91页
     ·TTG1位点的证据表明白菜和甘蓝是甘蓝型油菜的基因供体第91-92页
     ·揭示了芸薹属TTG1基因家族的一些新的结构特征第92页
     ·TTG1与检测的甘蓝型油菜、甘蓝、白菜黄籽性状的关系第92-93页
第4章 甘蓝型油菜及其亲本物种TT18基因家族的克隆与比较基因组学研究第93-139页
   ·材料与方法第93-98页
     ·植物材料、载体和菌种第93页
     ·试剂和试剂盒第93页
     ·主要仪器第93页
     ·基因组总DNA的提取(CTAB法)第93页
     ·总RNA的提取第93页
     ·质粒提取第93页
     ·总cDNA的获得(Rapid amplification of cDNA ends,RACE法)第93页
     ·BnTT18、BoTT18和BrTT18基因家族5'和3'cDNA末端扩增第93-95页
     ·亚克隆和测序第95-96页
     ·Southern blot分析第96-97页
     ·BnTT18、BoTT18和BrTT18基因家族组织特异性的半定量RT-PCR第97-98页
     ·TT18基因核酸和推导蛋白序列结构和功能的生物信息学分析第98页
   ·结果与分析第98-134页
     ·核酸提取和总cDNA的获得第98页
     ·BnTT18、BrTT18和BoTT18基因家族各成员的序列克隆第98-102页
     ·BnTT18、BrTT18和BoTT18基因家族的核苷酸序列分析第102-110页
     ·BnTT18、BoTT18和BrTT18核酸水平的同源性和进化关系第110-118页
     ·BnTT18、BoTT18和BrTT18编码蛋白的分析第118-129页
     ·BnTT18、BoTT18和BrTT18基因家族可能的成员数第129-130页
     ·BnTT18、BoTT18和BrTT18基因家族成员表达特征分析第130-132页
     ·BnTT18、BoTT18和BrTT18基因家族在参试黑、黄籽材料间的表达差异性第132-134页
   ·讨论第134-136页
     ·BnTT18、BoTT18和BrTT18基因家族是拟南芥TT18基因的垂直同源基因第134页
     ·芸薹属TT18基因家族拷贝数第134-135页
     ·关于甘蓝型油菜与白菜和甘蓝之间的进化关系第135-136页
     ·TT18与甘蓝型油菜、甘蓝、白菜的黄籽材料形成的关系第136页
   ·结论第136-139页
     ·系统地克隆了甘蓝型油菜及其亲本物种TT18基因家族的全长序列第136-137页
     ·甘蓝型油菜及其亲本物种TT18家族的蛋白结构特征第137页
     ·TT18位点的证据表明白菜和甘蓝是甘蓝型油菜的基因供体第137-139页
参考文献第139-147页
主要缩略词第147-149页
发表论文及参加课题一览表第149-151页
致谢第151页

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