| 摘要 | 第5-7页 |
| Abstract | 第7-8页 |
| 第一章 绪论 | 第14-26页 |
| 1.1 引言 | 第14-16页 |
| 1.1.1 研究背景 | 第14-15页 |
| 1.1.2 研究的目的和意义 | 第15-16页 |
| 1.1.3 项目来源和经费支持 | 第16页 |
| 1.2 国内外研究现状及发展趋势 | 第16-23页 |
| 1.2.1 RNA提取方法研究进展 | 第16-17页 |
| 1.2.2 木材形成的分子调控机制及国内外研究进展 | 第17-23页 |
| 1.3 主要研究内容 | 第23-25页 |
| 1.3.1 研究目标 | 第23-24页 |
| 1.3.2 研究内容 | 第24页 |
| 1.3.3 拟解决的重点问题 | 第24-25页 |
| 1.4 研究技术路线 | 第25-26页 |
| 第二章 基于Kingfisher Flex系统桉树叶片RNA的提取方法比较及优化 | 第26-36页 |
| 2.1 材料与方法 | 第26-28页 |
| 2.1.1 植物材料 | 第26-27页 |
| 2.1.2 磁珠试剂盒 | 第27页 |
| 2.1.3 试验方法 | 第27-28页 |
| 2.2 结果与分析 | 第28-35页 |
| 2.2.1 RNA样品完整性、浓度和纯度分析 | 第28-31页 |
| 2.2.2 最佳磁珠法RNA提取试剂盒的筛选 | 第31-32页 |
| 2.2.3 正交试验优化 | 第32-34页 |
| 2.2.4 最佳试剂盒C对细叶桉及其他树种的RNA提取 | 第34页 |
| 2.2.5 cDNA文库构建及质检 | 第34-35页 |
| 2.3 小结 | 第35-36页 |
| 第三章 基于RNA-seq挖掘尾叶桉×细叶桉材性候选基因 | 第36-78页 |
| 3.1 材料与方法 | 第37-41页 |
| 3.1.1 材料 | 第37-39页 |
| 3.1.2 RNA提取及质量检测 | 第39页 |
| 3.1.3 cDNA建库和测序 | 第39页 |
| 3.1.4 测序数据质控过滤与评估 | 第39-40页 |
| 3.1.5 参考基因组比对及转录组组装和定量 | 第40页 |
| 3.1.6 差异基因表达分析 | 第40页 |
| 3.1.7 韦恩图比较分析 | 第40页 |
| 3.1.8 差异表达基因的GO注释及功能富集分析 | 第40-41页 |
| 3.1.9 差异表达基因KEGG Pathway富集分析 | 第41页 |
| 3.1.10 差异表达基因转录因子富集分析 | 第41页 |
| 3.2 结果与分析 | 第41-76页 |
| 3.2.1 RNA提取与质量检测 | 第41-42页 |
| 3.2.2 测序数据质量评估 | 第42-45页 |
| 3.2.3 实生苗和无性系样品的差异表达基因分析 | 第45-48页 |
| 3.2.4 实生苗和无性系样品差异表达基因的GO功能富集分析 | 第48-57页 |
| 3.2.5 实生苗和无性系样品的差异表达基因的KEGG Pathway富集分析 | 第57-65页 |
| 3.2.6 实生苗和无性系差异表达基因的转录因子分布 | 第65-69页 |
| 3.2.7 实生苗和无性系材性性状相关候选基因分析 | 第69-74页 |
| 3.2.8 实生苗和无性系的次生壁合成相关的转录因子分析 | 第74-76页 |
| 3.3 小结 | 第76-78页 |
| 第四章 结论与讨论 | 第78-85页 |
| 4.1 结论 | 第78-79页 |
| 4.1.1 基于Kingfisher Flex系统树木叶片RNA的提取方法比较及优化 | 第78页 |
| 4.1.2 基于RNA-seq尾细桉材性候选基因及转录因子的挖掘 | 第78-79页 |
| 4.2 讨论 | 第79-83页 |
| 4.2.1 树木叶片RNA的自动提取方法及在林木分子生物研究中的应用 | 第79-80页 |
| 4.2.2 与4组木材材性性状相关的关键候选基因及转录因子 | 第80-83页 |
| 4.2.3 实生苗和无性系共有DEGs | 第83页 |
| 4.3 展望 | 第83-85页 |
| 参考文献 | 第85-93页 |
| 附录 | 第93-95页 |
| 在读期间学术研究 | 第95-96页 |
| 致谢 | 第96页 |
