| 摘要 | 第12-14页 |
| Abstract | 第14-16页 |
| 第1章 绪论 | 第17-39页 |
| 1.1 引言 | 第17-19页 |
| 1.2 化能自养微生物 | 第19-26页 |
| 1.2.1 化能自养微生物的概念 | 第19-20页 |
| 1.2.2 已知固碳途径概述 | 第20-26页 |
| 1.3 化能自养细菌固碳作用 | 第26-28页 |
| 1.3.1 主要的化能自养细菌类群 | 第26-27页 |
| 1.3.2 化能自养细菌的主要固碳途径及关键酶 | 第27-28页 |
| 1.4 化能自养奇古菌固碳作用 | 第28-35页 |
| 1.4.1 海洋古菌 | 第28-31页 |
| 1.4.2 奇古菌门中的氨氧化古菌 | 第31-34页 |
| 1.4.3 化能自养奇古菌的主要固碳途径及关键酶 | 第34-35页 |
| 1.5 本论文的研究意义与设计思路 | 第35-39页 |
| 1.5.1 研究意义 | 第35-37页 |
| 1.5.2 设计思路 | 第37-39页 |
| 第2章 南海北部夏季水体环境因子检测与黑暗固碳速率调查研究 | 第39-57页 |
| 2.1 研究背景 | 第39-41页 |
| 2.2 材料与方法 | 第41-47页 |
| 2.2.1 站位与采样 | 第41-42页 |
| 2.2.2 实验准备 | 第42-43页 |
| 2.2.3 环境因子样品、DIC样品采集和添加~(14)C标记的NaH~(14)CO_3原位培养实验 | 第43-46页 |
| 2.2.4 数据获取与处理 | 第46页 |
| 2.2.5 本实验所用的主要设备与仪器 | 第46-47页 |
| 2.3 实验结果 | 第47-53页 |
| 2.3.1 南海北部夏季水体环境因子分布特征 | 第47-49页 |
| 2.3.2 南海北部夏季水体化能无机自养微生物固碳速率的分布特征 | 第49-53页 |
| 2.4 讨论 | 第53-57页 |
| 第3章 南海北部夏季水体主要化能无机自养细菌总群落与活性群落生态研究 | 第57-105页 |
| 3.1 研究背景 | 第57-58页 |
| 3.2 材料与方法 | 第58-67页 |
| 3.2.1 样品采集与处理 | 第58页 |
| 3.2.2 样品总DNA提取与总cDNA合成及PCR扩增 | 第58-63页 |
| 3.2.3 cbbL基因高通量测序与cbbM基因克隆文库构建 | 第63-64页 |
| 3.2.4 统计分析 | 第64-66页 |
| 3.2.5 系统发育分析 | 第66页 |
| 3.2.6 本研究所用的主要仪器与设备 | 第66-67页 |
| 3.3 实验结果 | 第67-102页 |
| 3.3.1 南海北部夏季水体cbbL基因分析结果 | 第67-84页 |
| 3.3.2 南海北部夏季水体cbbM基因分析结果 | 第84-102页 |
| 3.4 讨论 | 第102-105页 |
| 3.4.1 RuBisCO的分布 | 第102-103页 |
| 3.4.2 化能无机自养细菌的生存策略 | 第103-104页 |
| 3.4.3 化能无机自养细菌在南海北部水体中的生态位 | 第104-105页 |
| 第4章 南海北部夏季水体主要化能无机自养奇古菌总群落与活性群落生态研究 | 第105-136页 |
| 4.1 研究背景 | 第105页 |
| 4.2 材料与方法 | 第105-107页 |
| 4.2.1 样品采集与处理 | 第105-106页 |
| 4.2.2 样品总DNA提取与总cDNA合成及PCR扩增 | 第106页 |
| 4.2.3 accA基因高通量测序及测序数据处理 | 第106页 |
| 4.2.4 统计分析 | 第106-107页 |
| 4.2.5 系统发育分析 | 第107页 |
| 4.2.6 本研究所用的主要仪器与设备 | 第107页 |
| 4.3 实验结果 | 第107-132页 |
| 4.3.1 accA基因文库平行性验证分析 | 第107-111页 |
| 4.3.2 accA基因系统发育分析 | 第111-117页 |
| 4.3.3 accA基因多样性分析 | 第117-122页 |
| 4.3.4 化能无机自养奇古菌群落的生物地理空间分布分析 | 第122-129页 |
| 4.3.5 化能无机自养奇古菌群落的受控环境因子分析 | 第129-132页 |
| 4.4 讨论 | 第132-136页 |
| 4.4.1 化能自养奇古菌在南海北部夏季水体中的分布特征 | 第132-134页 |
| 4.4.2 影响化能无机自养奇古菌群落结构的环境因子 | 第134-136页 |
| 第5章 主要结论、创新点、不足与展望 | 第136-140页 |
| 5.1 主要结论 | 第136-138页 |
| 5.2 创新点 | 第138页 |
| 5.3 不足与展望 | 第138-140页 |
| 参考文献 | 第140-161页 |
| 致谢 | 第161页 |
