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玉米GRF-interacting Factor1(gif1)突变基因的图位克隆及生物学功能解析

摘要第7-10页
ABSTRACT第10-13页
缩略词表第14-15页
1 前言第15-30页
    1.1 玉米花序形态建成与分生组织的命运第16-18页
    1.2 玉米花序发育进程中分生组织的基因调控第18-23页
        1.2.1 玉米花序分生组织产生和维持(maintenance)的基因调控第18-19页
        1.2.2 玉米花序分生组织身份(identity)及其转变(transition)的基因调控第19-21页
        1.2.3 玉米花序分生组织确定性(determinancy)的基因调控第21-22页
        1.2.4 玉米花序发育中分生组织的互作调控第22-23页
    1.3 玉米花序发育的影响因素第23-25页
    1.4 GRF-INTERA CTING FACTOR对植株生长发育的调控第25-28页
        1.4.1 GRF-INTERA CTING FACTOR对叶片发育的调控第26-27页
        1.4.2 GRF-INTERA CTING FACTOR对花器官发育的调控第27-28页
    1.5 研究目的及意义第28-30页
2 材料与方法第30-36页
    2.1 试验材料和来源第30-31页
        2.1.1 试验材料及定位群体构建第30页
        2.1.2 关联分析材料第30页
        2.1.3 突变群体的表型鉴定第30-31页
    2.2 雌雄花序发育的细胞学观察第31页
    2.3 GIF1的图位克隆第31-32页
    2.4 基因表达分析第32页
    2.5 转录组数据分析第32-33页
    2.6 mRNA的原位杂交第33-34页
    2.7 酵母双杂交试验第34页
    2.8 染色质免疫共沉淀测序(ChIP-seq)及数据分析第34-35页
    2.9 候选基因的关联分析第35-36页
3 结果与分析第36-70页
    3.1 玉米gif1突变体植株表型分析第36-40页
        3.1.1 玉米gif1突变体植株形态变异分析第36-38页
        3.1.2 玉米gif1突变体花序的形态及构成第38-39页
        3.1.3 玉米gif1突变体小花及心皮的形态第39-40页
    3.2 玉米gif1突变体细胞学表型分析第40-44页
        3.2.1 玉米gif1雌花序细胞学表型分析第41-42页
        3.2.2 玉米gif1雄花序细胞学表型分析第42-44页
    3.3 gif1突变体的遗传分析第44-45页
    3.4 GIF1基因的图位克隆第45-52页
        3.4.1 GIF1基因多态性标记的初筛第45-46页
        3.4.2 GIF1基因的初步定位第46-48页
        3.4.3 GIF1基因的精细定位第48-49页
        3.4.4 GIF1候选基因的分析第49-50页
        3.4.5 GIF1候选基因的克隆第50-52页
    3.5 GIF1基因结构与同源分析第52-54页
    3.6 GIF1基因的表达模式分析第54-58页
        3.6.1 GIF1基因的时空表达分析第55-56页
        3.6.2 玉米生长调节因子家族基因(GRFs)及GRF互作因子家族基因(GIFs)的表达模式第56-57页
        3.6.3 GIF1基因的原位杂交分析第57-58页
    3.7 GIF1蛋白与GRFS的互作分析第58-60页
    3.8 GIF1基因的调控分析第60-65页
        3.8.1 gif1及其野生型转录组测序数据质量分析第60-61页
        3.8.2 差异表达基因分析第61页
        3.8.3 差异表达基因的表达验证第61-62页
        3.8.4 差异表达基因的GO富集分析第62-63页
        3.8.5 GIF1对花序发育相关基因的调控分析第63-64页
        3.8.6 GIF1对细胞周期及生长素相关基因的调控分析第64-65页
    3.9 GIF1所调控的下游靶基因分析第65-68页
        3.9.1 GIF1结合DNA区域分析第65-66页
        3.9.2 GIF1结合的差异表达基因分析第66-67页
        3.9.3 GIF1在UB3和GIF1内的结合及验证第67-68页
    3.10 候选基因的关联分析第68-70页
        3.10.1 GIF1候选基因多态性位点及连锁不平衡分析第68页
        3.10.2 自然群体中GIF1的遗传变异与表型关联分析第68-70页
4 讨论第70-76页
    4.1 GIF1对玉米植株表型的影响具有多效性第70页
    4.2 GIF1决定玉米分生组织的确定性及命运第70-71页
    4.3 GIF1-GRF互作复合体通过调控相关基因影响玉米花序发育第71-73页
    4.4 克隆GIF1基因对玉米育种具有一定的理论价值和实际意义第73-74页
    4.5 结论、创新点及不足之处第74-76页
5 参考文献第76-87页
附录A第87-116页
附录B第116-121页
附录C 攻读学位期间已经参与发表的论文第121-122页
致谢第122-124页

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